MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017031	AGC	2	6	1129595	1129600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_017031	CAAA	2	8	1129602	1129609	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_017031	GCT	2	6	1131867	1131872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017031	GTG	2	6	1131901	1131906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017031	AGT	2	6	1131912	1131917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017031	TGT	2	6	1132946	1132951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017031	TCT	2	6	1132959	1132964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017031	AGA	2	6	1133039	1133044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017031	GAA	2	6	1133059	1133064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017031	TCA	2	6	1133409	1133414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017031	CGGGG	2	10	1135145	1135154	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3012	NC_017031	GGT	2	6	1135168	1135173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017031	CT	3	6	1136632	1136637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_017031	TCCT	2	8	1136693	1136700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_017031	TAGG	2	8	1136735	1136742	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017031	ACAAT	2	10	1136787	1136796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_017031	CAC	2	6	1136818	1136823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_017031	TG	3	6	1136852	1136857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017031	TTTTAT	2	12	1136873	1136884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017031	A	6	6	1136885	1136890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017031	AGT	2	6	1136899	1136904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017031	TAA	2	6	1138308	1138313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017031	GATCGC	2	12	1138375	1138386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017031	CAT	2	6	1138400	1138405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017031	TAT	2	6	1138418	1138423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017031	TTA	2	6	1138460	1138465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017031	GTC	2	6	1138470	1138475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_017031	CT	3	6	1138511	1138516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_017031	T	6	6	1138556	1138561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017031	GTTT	2	8	1138615	1138622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017031	GCA	2	6	1139879	1139884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017031	ATT	2	6	1140595	1140600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017031	TC	3	6	1140642	1140647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_017031	GGC	2	6	1140669	1140674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017031	GTAT	2	8	1144297	1144304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017031	TG	3	6	1144305	1144310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017031	TCA	2	6	1144845	1144850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017031	AGA	3	9	1146205	1146213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017031	TG	3	6	1148178	1148183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017031	AAAG	2	8	1149225	1149232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017031	TACC	2	8	1150674	1150681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_017031	AGAAAA	2	12	1150734	1150745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017031	TCTTTT	2	12	1150755	1150766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3044	NC_017031	TGT	2	6	1151765	1151770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017031	CAT	2	6	1154319	1154324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017031	TGT	2	6	1154327	1154332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017031	CAAAA	2	10	1154358	1154367	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3048	NC_017031	CATT	2	8	1154402	1154409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_017031	AACA	2	8	1154444	1154451	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_017031	CTAT	2	8	1154546	1154553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_017031	CCCGG	2	10	1154606	1154615	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3052	NC_017031	CTA	2	6	1154657	1154662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017031	C	6	6	1154683	1154688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3054	NC_017031	GGC	2	6	1154806	1154811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017031	GC	3	6	1155048	1155053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_017031	TTGG	2	8	1155058	1155065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017031	TGC	2	6	1155105	1155110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017031	CCA	2	6	1155118	1155123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_017031	GAT	2	6	1155163	1155168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017031	ATA	2	6	1155534	1155539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017031	CGA	2	6	1156529	1156534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_017031	TCG	2	6	1159153	1159158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017031	AAG	2	6	1163292	1163297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017031	ATC	2	6	1163363	1163368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017031	TCA	2	6	1163401	1163406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017031	TG	3	6	1163416	1163421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017031	TAAAG	2	10	1163451	1163460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017031	T	7	7	1163473	1163479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017031	A	7	7	1163540	1163546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017031	TAC	2	6	1163581	1163586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_017031	ACA	2	6	1163777	1163782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017031	CGG	2	6	1163787	1163792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017031	ATC	2	6	1163807	1163812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017031	ATGG	2	8	1163830	1163837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017031	CAG	2	6	1163856	1163861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_017031	GCC	2	6	1163877	1163882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_017031	CAT	2	6	1163943	1163948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017031	TTC	2	6	1164080	1164085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_017031	GCT	2	6	1164123	1164128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017031	GTA	2	6	1164162	1164167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017031	TCT	2	6	1164210	1164215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017031	ATTT	2	8	1164224	1164231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017031	T	7	7	1164864	1164870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017031	CTTC	2	8	1166116	1166123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_017031	GAC	2	6	1166126	1166131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017031	CAT	2	6	1166544	1166549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_017031	AAGA	2	8	1169390	1169397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017031	GATT	2	8	1169439	1169446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017031	AGG	2	6	1171302	1171307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017031	AAC	2	6	1171325	1171330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_017031	CTT	2	6	1171364	1171369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_017031	ATT	2	6	1171618	1171623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017031	CCCA	2	8	1171665	1171672	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3094	NC_017031	CCG	2	6	1171716	1171721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_017031	CCTT	2	8	1171744	1171751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_017031	GTAT	2	8	1171785	1171792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017031	AAAT	2	8	1171825	1171832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017031	GAC	3	9	1172564	1172572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017031	GCT	2	6	1172583	1172588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017031	CAG	2	6	1172611	1172616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017031	AGA	2	6	1172625	1172630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017031	GC	3	6	1175473	1175478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_017031	AGT	2	6	1176202	1176207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017031	TACC	2	8	1178693	1178700	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_017031	TTA	2	6	1178941	1178946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017031	TAC	2	6	1178978	1178983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017031	TGG	2	6	1179065	1179070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017031	CAA	2	6	1180446	1180451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_017031	TAAT	2	8	1180530	1180537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017031	AGA	2	6	1182710	1182715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017031	TTA	2	6	1182737	1182742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017031	TAAA	2	8	1182748	1182755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017031	ACC	2	6	1182763	1182768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_017031	TCT	2	6	1182799	1182804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017031	CGG	2	6	1184497	1184502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017031	TGG	2	6	1184564	1184569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017031	CAG	2	6	1185109	1185114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017031	GC	3	6	1185145	1185150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_017031	ATTC	2	8	1191199	1191206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_017031	AC	3	6	1191218	1191223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_017031	AACC	2	8	1191250	1191257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_017031	ATC	2	6	1191273	1191278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017031	TAA	2	6	1191343	1191348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017031	TTC	2	6	1191349	1191354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017031	CCA	2	6	1191359	1191364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_017031	GTA	2	6	1196142	1196147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017031	AAGG	2	8	1196152	1196159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017031	T	6	6	1196202	1196207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017031	TTA	2	6	1196217	1196222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017031	TCC	2	6	1197200	1197205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_017031	TCA	2	6	1197235	1197240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_017031	T	6	6	1197295	1197300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017031	CTT	2	6	1197382	1197387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_017031	ATTA	2	8	1197443	1197450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017031	GAA	2	6	1197466	1197471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_017031	CTTT	2	8	1197505	1197512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3137	NC_017031	CAAA	2	8	1197533	1197540	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_017031	GGAC	2	8	1197558	1197565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3139	NC_017031	TCA	2	6	1199671	1199676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_017031	TCA	2	6	1200863	1200868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_017031	AAT	2	6	1200960	1200965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_017031	GTAG	2	8	1200972	1200979	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_017031	CAGA	2	8	1204362	1204369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3144	NC_017031	CAC	2	6	1204725	1204730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3145	NC_017031	ATG	2	6	1207631	1207636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_017031	CTTT	2	8	1207643	1207650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3147	NC_017031	ACT	2	6	1207675	1207680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_017031	ATG	2	6	1208582	1208587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_017031	TCG	2	6	1209821	1209826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3152	NC_017031	ATC	2	6	1211006	1211011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3154	NC_017031	T	6	6	1211121	1211126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_017031	ACC	2	6	1211153	1211158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3160	NC_017031	AGCT	2	8	1212409	1212416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3162	NC_017031	AGTC	2	8	1217189	1217196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3163	NC_017031	GCT	2	6	1217209	1217214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_017031	GTT	2	6	1217217	1217222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_017031	TC	3	6	1217223	1217228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3166	NC_017031	ACG	2	6	1217274	1217279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3169	NC_017031	TGC	2	6	1219808	1219813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_017031	AAG	2	6	1221683	1221688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_017031	A	6	6	1221719	1221724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3174	NC_017031	T	7	7	1224748	1224754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3175	NC_017031	CTG	2	6	1224798	1224803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3177	NC_017031	CTTA	2	8	1228215	1228222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3183	NC_017031	CTG	2	6	1230105	1230110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3184	NC_017031	TCC	2	6	1231037	1231042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3209	NC_017031	GAT	3	9	1258181	1258189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3218	NC_017031	ACTT	2	8	1269835	1269842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3219	NC_017031	TGA	2	6	1269891	1269896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3221	NC_017031	CTT	2	6	1270884	1270889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3230	NC_017031	TTTC	2	8	1272214	1272221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3231	NC_017031	AAC	2	6	1272260	1272265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3239	NC_017031	TGT	2	6	1273657	1273662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3244	NC_017031	AAT	2	6	1276479	1276484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_017031	AAC	2	6	1276525	1276530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_017031	CA	3	6	1277498	1277503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3247	NC_017031	CCG	2	6	1277504	1277509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3248	NC_017031	ATA	2	6	1277510	1277515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_017031	TA	3	6	1277514	1277519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_017031	CTTAA	2	10	1277689	1277698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3251	NC_017031	AGC	2	6	1280484	1280489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_017031	ATCC	2	8	1280497	1280504	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3253	NC_017031	GCA	2	6	1281154	1281159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_017031	CAT	2	6	1281201	1281206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_017031	TTA	2	6	1282999	1283004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_017031	TTCT	2	8	1283007	1283014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3257	NC_017031	TGC	2	6	1283027	1283032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_017031	CTC	2	6	1286117	1286122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_017031	AGA	2	6	1286133	1286138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3261	NC_017031	TCG	2	6	1286173	1286178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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