MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 5568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	CTT	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017028	ATA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017028	AAT	2	6	2743	2748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017028	TTA	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017028	TAT	2	6	3381	3386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017028	GCT	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017028	AGC	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017028	TCA	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017028	ATA	2	6	3482	3487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017028	ATA	2	6	3720	3725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017028	CGG	2	6	3745	3750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017028	TAA	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017028	TTA	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017028	TAT	2	6	4666	4671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017028	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017028	TTG	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017028	CTG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017028	TAA	2	6	4970	4975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017028	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017028	CAA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017028	TGT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017028	TAG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017028	TTA	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017028	TTG	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017028	TTG	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017028	ATA	2	6	5462	5467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017028	TCT	2	6	5473	5478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017028	TCT	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017028	ATT	2	6	5797	5802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017028	TAA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017028	ATA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017028	GTA	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017028	AAT	3	9	8911	8919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017028	ATT	2	6	10253	10258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017028	GCT	2	6	10383	10388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017028	TTA	2	6	10399	10404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017028	TAA	2	6	10422	10427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017028	TAT	2	6	10644	10649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017028	TAA	2	6	10680	10685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017028	ATT	3	9	10935	10943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017028	AGT	2	6	10991	10996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017028	TAG	2	6	11019	11024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017028	TTA	2	6	11057	11062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017028	CTT	2	6	11094	11099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017028	CTT	2	6	11118	11123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017028	TAA	2	6	11308	11313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017028	ATT	2	6	11345	11350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017028	TGA	2	6	11387	11392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017028	TCT	2	6	11403	11408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017028	ATT	2	6	11417	11422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017028	ATT	2	6	11480	11485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017028	AGA	2	6	11594	11599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017028	TGC	2	6	11677	11682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017028	AGA	2	6	11720	11725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017028	ATA	2	6	11871	11876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017028	GTT	2	6	12224	12229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017028	TTA	2	6	12343	12348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017028	AAT	2	6	12354	12359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017028	GAA	2	6	14323	14328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017028	TAA	2	6	15692	15697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017028	TTA	2	6	15707	15712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017028	TTG	2	6	15723	15728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017028	GAA	2	6	15755	15760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017028	GTA	2	6	15765	15770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017028	CGA	2	6	15774	15779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017028	ATT	2	6	15820	15825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017028	CAA	2	6	15879	15884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017028	GTT	2	6	15893	15898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017028	ATG	2	6	15905	15910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017028	ATC	2	6	15974	15979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017028	ATT	2	6	16202	16207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017028	GCT	2	6	16829	16834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017028	ATA	2	6	16968	16973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017028	ATA	2	6	17010	17015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017028	TAT	2	6	17045	17050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017028	TCA	2	6	17242	17247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017028	GAC	2	6	17493	17498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017028	ATT	2	6	17633	17638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017028	TTA	2	6	18983	18988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017028	GTC	2	6	19027	19032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017028	TAG	2	6	19113	19118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017028	GAG	2	6	20134	20139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017028	TCA	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017028	GAC	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017028	ATT	2	6	21837	21842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017028	CTA	2	6	21883	21888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017028	AAT	2	6	21919	21924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017028	CTT	2	6	21966	21971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017028	TAT	2	6	21973	21978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017028	TTA	2	6	22016	22021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017028	GAT	2	6	22096	22101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017028	ATT	2	6	22141	22146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017028	AGA	2	6	24012	24017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017028	TAA	2	6	24320	24325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017028	TGA	2	6	24339	24344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017028	AAG	2	6	24394	24399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017028	AAG	2	6	24433	24438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017028	ATA	2	6	24451	24456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017028	TAA	2	6	24936	24941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017028	ATT	2	6	25003	25008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017028	ATT	2	6	25214	25219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017028	CAA	2	6	25252	25257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017028	GAA	2	6	25271	25276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017028	CGC	2	6	25817	25822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017028	TAC	2	6	25841	25846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017028	TTA	2	6	25880	25885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017028	TGA	2	6	25890	25895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017028	TAA	2	6	26013	26018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017028	AAG	2	6	26034	26039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017028	TGT	2	6	26061	26066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017028	TAT	2	6	26177	26182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017028	ATT	2	6	26287	26292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017028	GAA	2	6	26530	26535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017028	ATT	2	6	26616	26621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017028	TTA	2	6	26692	26697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017028	TAT	2	6	26909	26914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017028	TAA	2	6	26919	26924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017028	CAA	2	6	27010	27015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017028	ATT	2	6	27107	27112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017028	CAG	2	6	27136	27141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017028	ATT	2	6	27173	27178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017028	ATC	2	6	27212	27217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017028	TAT	3	9	31048	31056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017028	ATT	2	6	31755	31760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017028	ATA	2	6	31761	31766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017028	ATA	2	6	33710	33715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017028	GTC	2	6	33790	33795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017028	GAG	2	6	33801	33806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017028	AAT	2	6	33831	33836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017028	TTA	2	6	35454	35459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017028	TCC	2	6	37234	37239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017028	ATA	2	6	37260	37265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017028	CAT	2	6	39927	39932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017028	AGC	2	6	39974	39979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017028	GGT	2	6	40059	40064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017028	ATC	2	6	40869	40874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017028	AAG	2	6	42899	42904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017028	TTG	2	6	45334	45339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017028	TTA	2	6	45346	45351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017028	AAT	2	6	45357	45362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017028	CAT	2	6	45368	45373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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