MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 9794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	CTT	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017028	TAAA	2	8	1161	1168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017028	ATTT	2	8	2653	2660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017028	T	6	6	2658	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017028	ATA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017028	AAT	2	6	2743	2748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017028	TTA	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017028	TA	3	6	2815	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017028	AG	3	6	2828	2833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017028	TAT	2	6	3381	3386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017028	GCT	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017028	AGC	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017028	TCA	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017028	ATA	2	6	3482	3487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017028	ATA	2	6	3720	3725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017028	A	8	8	3735	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017028	CGG	2	6	3745	3750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017028	T	7	7	3784	3790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017028	TAA	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017028	TATT	2	8	3843	3850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017028	ACTT	2	8	4612	4619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017028	TC	3	6	4633	4638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017028	TTA	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017028	TAT	2	6	4666	4671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017028	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017028	TCATTT	2	12	4771	4782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017028	TTG	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017028	CTG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017028	T	7	7	4917	4923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017028	TAA	2	6	4970	4975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017028	GTCA	2	8	5031	5038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017028	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017028	CAA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017028	CTTA	2	8	5169	5176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017028	TGT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017028	TAG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017028	TTA	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017028	T	6	6	5255	5260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017028	TTG	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017028	TTG	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017028	AT	3	6	5323	5328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017028	TC	3	6	5434	5439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017028	ATTT	2	8	5441	5448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017028	ATA	2	6	5462	5467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017028	TCT	2	6	5473	5478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017028	T	6	6	5530	5535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017028	TCT	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017028	T	7	7	5787	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017028	ATT	2	6	5797	5802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017028	TAA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017028	ATA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017028	GATTA	2	10	5867	5876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017028	TA	3	6	5942	5947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017028	TCACT	2	10	8836	8845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017028	T	6	6	8863	8868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017028	A	6	6	8869	8874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017028	GTA	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017028	TTTTA	2	10	8894	8903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017028	AAT	3	9	8911	8919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017028	GTAG	2	8	8928	8935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017028	ATT	2	6	10253	10258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017028	GCT	2	6	10383	10388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017028	TGTA	2	8	10389	10396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017028	TTA	2	6	10399	10404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017028	TAA	2	6	10422	10427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017028	ATTA	2	8	10450	10457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017028	TAT	2	6	10644	10649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017028	TAA	2	6	10680	10685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017028	ATT	3	9	10935	10943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017028	GCTT	2	8	10963	10970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017028	T	6	6	10969	10974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017028	TA	3	6	10977	10982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017028	AGT	2	6	10991	10996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017028	TGTT	2	8	11009	11016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017028	TAG	2	6	11019	11024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017028	GTTT	2	8	11042	11049	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017028	TTA	2	6	11057	11062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017028	CTT	2	6	11094	11099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017028	T	6	6	11107	11112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017028	CTT	2	6	11118	11123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017028	T	6	6	11199	11204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017028	AT	3	6	11222	11227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017028	T	6	6	11244	11249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017028	TTCC	2	8	11286	11293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017028	TAA	2	6	11308	11313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017028	ATT	2	6	11345	11350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017028	TGA	2	6	11387	11392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017028	TCT	2	6	11403	11408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017028	ATT	2	6	11417	11422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017028	ATT	2	6	11480	11485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017028	TAAT	2	8	11519	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017028	AATTA	2	10	11546	11555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017028	AGA	2	6	11594	11599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017028	AGAGC	2	10	11601	11610	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017028	TGC	2	6	11677	11682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017028	AGA	2	6	11720	11725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017028	T	7	7	11857	11863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017028	ATA	2	6	11871	11876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017028	A	6	6	11889	11894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017028	GTT	2	6	12224	12229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017028	TATT	2	8	12275	12282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017028	A	6	6	12333	12338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017028	TTA	2	6	12343	12348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017028	AAT	2	6	12354	12359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017028	T	6	6	14235	14240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017028	TGTTC	2	10	14283	14292	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017028	GAA	2	6	14323	14328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017028	TAAT	2	8	14358	14365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017028	TAA	2	6	15692	15697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017028	A	6	6	15696	15701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017028	TTA	2	6	15707	15712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017028	TTG	2	6	15723	15728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017028	GAA	2	6	15755	15760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017028	GTA	2	6	15765	15770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017028	CGA	2	6	15774	15779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017028	A	6	6	15791	15796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017028	T	7	7	15812	15818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017028	ATT	2	6	15820	15825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017028	T	7	7	15824	15830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017028	CAA	2	6	15879	15884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017028	GTT	2	6	15893	15898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017028	ATG	2	6	15905	15910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017028	ATCT	2	8	15913	15920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017028	ATTT	2	8	15952	15959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017028	ATC	2	6	15974	15979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017028	A	7	7	16001	16007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017028	A	6	6	16036	16041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017028	A	6	6	16082	16087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017028	AATAT	2	10	16106	16115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017028	T	6	6	16119	16124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017028	TA	3	6	16130	16135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017028	ATTT	2	8	16165	16172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017028	T	6	6	16170	16175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017028	ATT	2	6	16202	16207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017028	A	6	6	16246	16251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017028	A	6	6	16253	16258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017028	A	6	6	16331	16336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017028	GCT	2	6	16829	16834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017028	ATGAA	2	10	16923	16932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017028	ATA	2	6	16968	16973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017028	A	7	7	16973	16979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017028	TGTTA	2	10	17000	17009	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017028	ATA	2	6	17010	17015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017028	TAT	2	6	17045	17050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017028	A	6	6	17054	17059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017028	ACAA	2	8	17178	17185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017028	A	7	7	17235	17241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017028	TCA	2	6	17242	17247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017028	GAC	2	6	17493	17498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017028	CCTAAT	2	12	17545	17556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017028	TA	3	6	17615	17620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017028	ATT	2	6	17633	17638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017028	TTA	2	6	18983	18988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017028	GTC	2	6	19027	19032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017028	GCGA	2	8	19036	19043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_017028	TAG	2	6	19113	19118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017028	TCA	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017028	TCGC	2	8	20194	20201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_017028	GAC	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017028	AGTA	2	8	21549	21556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017028	T	8	8	21601	21608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017028	ATT	2	6	21837	21842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017028	CTA	2	6	21883	21888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017028	AAT	2	6	21919	21924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017028	CTT	2	6	21966	21971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_017028	TAT	2	6	21973	21978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017028	T	6	6	21988	21993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017028	TTA	2	6	22016	22021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017028	AT	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017028	ATT	2	6	22141	22146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_017028	A	6	6	23993	23998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017028	AAG	2	6	24433	24438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017028	ATA	2	6	24451	24456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_017028	A	6	6	24946	24951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017028	ATT	2	6	25214	25219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017028	AT	3	6	25236	25241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017028	A	6	6	25245	25250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017028	TAT	2	6	52844	52849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_017028	TGT	2	6	53117	53122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017028	GAA	2	6	53881	53886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017028	GGAGC	2	10	53935	53944	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_017028	TAAA	2	8	68842	68849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017028	TTG	2	6	68898	68903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017028	GTAA	2	8	68941	68948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017028	GCT	2	6	68999	69004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_017028	AAG	2	6	69061	69066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017028	TTA	2	6	69092	69097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017028	AGA	2	6	69179	69184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017028	CAG	2	6	69202	69207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_017028	TGA	2	6	69266	69271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017028	ATTC	2	8	69273	69280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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459	NC_017028	TAC	2	6	69660	69665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_017028	A	6	6	69730	69735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017028	TGA	2	6	69747	69752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017028	CAT	2	6	69791	69796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_017028	TAAC	2	8	69883	69890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_017028	A	8	8	70114	70121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_017028	AGT	2	6	70381	70386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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