MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 9794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017028	ATA	2	6	461150	461155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017028	A	10	10	461393	461402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017028	TGA	2	6	461431	461436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017028	TGT	2	6	461437	461442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017028	CA	3	6	461486	461491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_017028	TTGATA	2	12	461532	461543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017028	AGG	3	9	461565	461573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017028	AGT	2	6	461593	461598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017028	TAA	2	6	462305	462310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017028	AAT	2	6	462312	462317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017028	AC	3	6	462394	462399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_017028	A	6	6	462427	462432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017028	TGA	2	6	462547	462552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017028	TGAG	2	8	462554	462561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017028	AG	3	6	462560	462565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017028	TTTTAC	2	12	462599	462610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3017	NC_017028	ATA	2	6	462648	462653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017028	AGCA	2	8	462695	462702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_017028	TAG	2	6	462760	462765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017028	TAG	2	6	462820	462825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017028	ATTA	2	8	462834	462841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017028	AGT	2	6	462846	462851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017028	ATA	2	6	462909	462914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017028	TGT	2	6	462930	462935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017028	A	6	6	462939	462944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017028	ATC	2	6	462960	462965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017028	AT	3	6	462968	462973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017028	CAG	2	6	463017	463022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017028	TTA	2	6	463088	463093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017028	GAA	3	9	463114	463122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017028	TAG	2	6	463140	463145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017028	AAT	2	6	463167	463172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017028	AGAT	2	8	463259	463266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017028	ATT	2	6	463353	463358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017028	A	7	7	463392	463398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017028	TGCT	2	8	463408	463415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_017028	ATA	2	6	463443	463448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017028	TAA	2	6	463467	463472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017028	TAA	2	6	463497	463502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017028	AT	3	6	463521	463526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017028	TA	3	6	463873	463878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017028	TGA	2	6	463886	463891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017028	TGAA	2	8	463897	463904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017028	A	6	6	463903	463908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017028	AT	3	6	463912	463917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017028	T	6	6	463917	463922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017028	AGA	3	9	463923	463931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017028	AGA	2	6	463940	463945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017028	TAA	2	6	463992	463997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017028	CTT	2	6	464043	464048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017028	TAT	2	6	464109	464114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017028	TAA	2	6	464115	464120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017028	AGT	2	6	464538	464543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017028	TGA	2	6	464764	464769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017028	T	6	6	464800	464805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017028	AT	3	6	464807	464812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017028	AATA	2	8	464819	464826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017028	TAA	2	6	464862	464867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017028	A	9	9	464866	464874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017028	TCT	2	6	464903	464908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_017028	TC	3	6	464972	464977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_017028	CTA	2	6	465002	465007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017028	A	6	6	465028	465033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017028	AAG	2	6	465068	465073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017028	ACC	2	6	465093	465098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3068	NC_017028	GGA	2	6	465198	465203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017028	TTA	3	9	465699	465707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017028	TTTA	2	8	466920	466927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017028	TA	3	6	466939	466944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017028	T	6	6	466964	466969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017028	ATTT	2	8	466980	466987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017028	T	6	6	469245	469250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017028	T	7	7	469252	469258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017028	GTT	2	6	469261	469266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_017028	ATA	2	6	469320	469325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_017028	ACA	2	6	469411	469416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3084	NC_017028	TTG	2	6	471066	471071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_017028	CAT	2	6	471135	471140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017028	TA	3	6	471142	471147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017028	TCT	2	6	471326	471331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017028	TAA	2	6	471637	471642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_017028	TCGC	2	8	475089	475096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_017028	ATT	2	6	476613	476618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017028	ATA	3	9	476619	476627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017028	TTAAT	2	10	476641	476650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_017028	TAAAAT	2	12	476711	476722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017028	AAAT	3	12	476719	476730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017028	AAATTA	2	12	476734	476745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3102	NC_017028	TTA	2	6	476770	476775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017028	ACT	2	6	476879	476884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017028	TTTA	2	8	476886	476893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017028	T	7	7	476928	476934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017028	T	6	6	476958	476963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017028	A	6	6	476965	476970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_017028	TAA	2	6	477021	477026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017028	TAA	3	9	477246	477254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3112	NC_017028	ATA	2	6	478525	478530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017028	CGTA	2	8	478547	478554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_017028	CAA	2	6	478601	478606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017028	TCGC	2	8	481167	481174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_017028	AT	3	6	481207	481212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017028	T	7	7	484438	484444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017028	A	7	7	484511	484517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017028	T	7	7	484533	484539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017028	TGT	2	6	484544	484549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017028	CA	3	6	484627	484632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_017028	TAT	2	6	485392	485397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017028	TTGCA	2	10	485410	485419	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3124	NC_017028	A	6	6	485419	485424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017028	TAT	2	6	485459	485464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017028	AATTT	2	10	485473	485482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_017028	TAT	2	6	485536	485541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017028	ATT	2	6	485547	485552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017028	TA	3	6	485585	485590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017028	TAA	2	6	485594	485599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017028	GAA	2	6	485641	485646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017028	TTC	2	6	485774	485779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_017028	TAT	2	6	485797	485802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017028	T	6	6	486187	486192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_017028	TGT	2	6	486227	486232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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