MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 9794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017028	ATGA	2	8	128836	128843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017028	TTG	2	6	128876	128881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017028	TAA	2	6	128885	128890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017028	TTC	2	6	128900	128905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017028	TTTA	2	8	128956	128963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017028	A	8	8	128991	128998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017028	TCT	2	6	128999	129004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017028	GAA	2	6	129017	129022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017028	TA	3	6	129060	129065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017028	TGT	2	6	129089	129094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017028	TATT	2	8	129113	129120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017028	T	7	7	129151	129157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017028	AGA	2	6	129158	129163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017028	TTTTCT	2	12	129164	129175	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1015	NC_017028	CTA	2	6	129240	129245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017028	ATT	2	6	129265	129270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017028	T	7	7	129297	129303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017028	A	6	6	129381	129386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017028	ATA	2	6	130429	130434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017028	TAT	2	6	130495	130500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017028	TAA	2	6	130521	130526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017028	GAG	2	6	130584	130589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017028	GAC	2	6	130631	130636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017028	TA	3	6	130663	130668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017028	CCA	3	9	130740	130748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_017028	ACTT	2	8	130806	130813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_017028	TTAA	2	8	130822	130829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017028	TAA	2	6	130838	130843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017028	AAG	2	6	130905	130910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017028	AG	3	6	130916	130921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017028	ATA	2	6	130925	130930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017028	AT	3	6	130962	130967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017028	A	6	6	130979	130984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017028	GAA	2	6	130999	131004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017028	AG	3	6	131101	131106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017028	ACTA	2	8	131132	131139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_017028	TAT	2	6	131143	131148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017028	TTTA	2	8	131152	131159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017028	TAT	2	6	131193	131198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017028	ATA	2	6	131247	131252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017028	ACA	2	6	131496	131501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017028	TTA	2	6	131641	131646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017028	AAT	2	6	131647	131652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017028	TA	5	10	131694	131703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017028	TAC	2	6	131716	131721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017028	ATT	2	6	131727	131732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017028	ATT	2	6	131758	131763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017028	TAT	2	6	132997	133002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017028	ATC	2	6	133271	133276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017028	AACT	2	8	133301	133308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_017028	TGC	2	6	133385	133390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017028	TCTA	2	8	133420	133427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_017028	TAA	2	6	133432	133437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017028	T	6	6	133443	133448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017028	TAA	2	6	133457	133462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017028	ATA	2	6	133482	133487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017028	AGT	2	6	133488	133493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017028	ATG	2	6	133495	133500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017028	T	6	6	133503	133508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017028	TTA	2	6	133529	133534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017028	TAT	2	6	133794	133799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017028	TTA	2	6	133802	133807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017028	TAT	2	6	133835	133840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017028	TAT	2	6	133855	133860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017028	ACT	2	6	133877	133882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017028	TC	3	6	133884	133889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017028	TAG	2	6	133906	133911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017028	TTA	2	6	133914	133919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017028	TTC	2	6	133955	133960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017028	AT	4	8	133978	133985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017028	ATA	2	6	134041	134046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017028	A	6	6	134046	134051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017028	AT	5	10	134071	134080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017028	GCT	2	6	134084	134089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017028	TGT	2	6	134090	134095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017028	TAT	2	6	134316	134321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017028	GCC	2	6	134348	134353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_017028	TCA	2	6	134394	134399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017028	TTC	2	6	134427	134432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017028	T	7	7	134447	134453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017028	CAAG	2	8	134567	134574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_017028	TAG	2	6	134604	134609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017028	CCTGC	2	10	134633	134642	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1084	NC_017028	CTA	2	6	134710	134715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017028	CAT	2	6	134753	134758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_017028	T	7	7	134834	134840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017028	CTC	2	6	134844	134849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_017028	TTC	2	6	134877	134882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017028	TTC	2	6	134925	134930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017028	AGC	2	6	134940	134945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017028	A	6	6	134959	134964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017028	TTCTAA	2	12	134991	135002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1094	NC_017028	CTGC	2	8	135031	135038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_017028	ATT	2	6	135058	135063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017028	TTA	2	6	135087	135092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017028	AAC	2	6	135152	135157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017028	T	6	6	135198	135203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017028	ATCT	2	8	135214	135221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_017028	T	8	8	135233	135240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017028	TTA	2	6	135251	135256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017028	AGC	2	6	135280	135285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017028	TTTCT	2	10	135291	135300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1104	NC_017028	T	6	6	135328	135333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017028	AAC	2	6	135342	135347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017028	TTTC	2	8	135524	135531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017028	TTA	2	6	135542	135547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017028	AT	3	6	135614	135619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017028	TGCT	2	8	135693	135700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_017028	T	6	6	135706	135711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017028	T	8	8	135726	135733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017028	ATT	2	6	135772	135777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017028	CTG	2	6	135779	135784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017028	TAAA	2	8	135946	135953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017028	T	6	6	135970	135975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017028	T	7	7	135997	136003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017028	CAA	2	6	136011	136016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017028	T	6	6	136125	136130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017028	T	6	6	136248	136253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017028	CAA	2	6	136258	136263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017028	TGT	2	6	136266	136271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017028	CAA	2	6	136324	136329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017028	CATTA	2	10	136349	136358	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_017028	TTC	2	6	136400	136405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_017028	TGA	2	6	136465	136470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017028	TCA	2	6	136500	136505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017028	T	6	6	136538	136543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017028	T	6	6	136563	136568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017028	TAA	2	6	136659	136664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017028	CTT	2	6	136674	136679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017028	CTC	2	6	136734	136739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_017028	T	6	6	136788	136793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017028	TAA	2	6	136904	136909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017028	T	7	7	136934	136940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_017028	TTG	2	6	136986	136991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_017028	AAGCA	2	10	201262	201271	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1408	NC_017028	CAA	3	9	201318	201326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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