MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 9794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017028	AAG	2	6	1282469	1282474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_017028	TTTA	2	8	1282499	1282506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_017028	A	7	7	1282650	1282656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_017028	ATA	2	6	1282658	1282663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_017028	TAA	2	6	1282667	1282672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_017028	GAA	2	6	1282735	1282740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_017028	TGA	2	6	1282813	1282818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_017028	A	6	6	1282859	1282864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_017028	ATA	2	6	1282866	1282871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_017028	TGA	2	6	1282873	1282878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_017028	TAT	2	6	1282888	1282893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_017028	AG	3	6	1283022	1283027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_017028	AAT	2	6	1283029	1283034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_017028	TGAA	2	8	1283104	1283111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_017028	GAA	2	6	1283138	1283143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_017028	A	6	6	1283142	1283147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_017028	CTA	2	6	1283153	1283158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_017028	ATA	2	6	1283190	1283195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_017028	CTA	2	6	1283214	1283219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_017028	AT	3	6	1283235	1283240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_017028	ACTG	2	8	1283251	1283258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9022	NC_017028	AAC	2	6	1283259	1283264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_017028	AT	3	6	1283340	1283345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_017028	T	6	6	1283355	1283360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_017028	TTC	2	6	1283410	1283415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_017028	ATA	2	6	1283421	1283426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_017028	TA	3	6	1283433	1283438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_017028	ATT	2	6	1283452	1283457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_017028	TCA	3	9	1283483	1283491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_017028	TGT	2	6	1283514	1283519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_017028	TAACT	2	10	1283524	1283533	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9032	NC_017028	TTC	2	6	1283543	1283548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_017028	CAA	2	6	1283575	1283580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_017028	TTC	2	6	1283581	1283586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_017028	TA	3	6	1283639	1283644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_017028	ATA	2	6	1283689	1283694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_017028	ATTTAA	2	12	1283730	1283741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_017028	A	6	6	1283740	1283745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_017028	ATT	2	6	1283764	1283769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_017028	ATTT	2	8	1283779	1283786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_017028	GTAG	2	8	1285059	1285066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_017028	AT	3	6	1285248	1285253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_017028	TTA	2	6	1285268	1285273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_017028	AGC	2	6	1285335	1285340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_017028	TAA	3	9	1291153	1291161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_017028	ATT	2	6	1291166	1291171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_017028	TGT	2	6	1291174	1291179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_017028	TAT	2	6	1291180	1291185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_017028	TA	3	6	1291188	1291193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_017028	TAT	2	6	1292598	1292603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_017028	CCT	2	6	1292682	1292687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9052	NC_017028	AAG	2	6	1292764	1292769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_017028	CTC	2	6	1292813	1292818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9054	NC_017028	A	6	6	1292828	1292833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_017028	ATC	2	6	1292854	1292859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_017028	AT	3	6	1292876	1292881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_017028	ATTT	2	8	1292884	1292891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_017028	ATTA	2	8	1292940	1292947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_017028	GTT	2	6	1294261	1294266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_017028	CAT	2	6	1294282	1294287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_017028	TA	4	8	1294303	1294310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_017028	AGC	2	6	1294324	1294329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_017028	ACC	2	6	1294504	1294509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9064	NC_017028	TGG	2	6	1294525	1294530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_017028	A	6	6	1294533	1294538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_017028	T	7	7	1294600	1294606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_017028	T	7	7	1294624	1294630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_017028	TTA	2	6	1294661	1294666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_017028	AATT	2	8	1294676	1294683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_017028	TAT	2	6	1294842	1294847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_017028	A	7	7	1294921	1294927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_017028	A	6	6	1294956	1294961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_017028	ATAA	2	8	1294970	1294977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_017028	A	6	6	1294989	1294994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_017028	AAAG	2	8	1295015	1295022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_017028	ATG	2	6	1295112	1295117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_017028	TAT	2	6	1295189	1295194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_017028	ACC	2	6	1295226	1295231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9079	NC_017028	GGT	2	6	1295250	1295255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_017028	AGTTTA	2	12	1295268	1295279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_017028	TCA	2	6	1295418	1295423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_017028	AG	3	6	1295433	1295438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_017028	AGG	2	6	1295453	1295458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_017028	ACAT	2	8	1295463	1295470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9085	NC_017028	ATT	2	6	1295496	1295501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_017028	AAT	2	6	1295507	1295512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_017028	CTA	2	6	1295515	1295520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_017028	CCT	2	6	1295552	1295557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9089	NC_017028	TAAT	2	8	1295558	1295565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_017028	GTT	2	6	1295588	1295593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_017028	AAT	2	6	1295598	1295603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_017028	TTG	2	6	1296783	1296788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_017028	TAG	2	6	1296818	1296823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9095	NC_017028	GAT	2	6	1296919	1296924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_017028	AT	3	6	1296940	1296945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_017028	TAA	2	6	1296987	1296992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_017028	ATCT	2	8	1297005	1297012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9099	NC_017028	T	6	6	1297012	1297017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_017028	TAATT	2	10	1297042	1297051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_017028	ATTT	2	8	1297061	1297068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_017028	ATA	2	6	1297102	1297107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_017028	CAAATC	2	12	1297110	1297121	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9104	NC_017028	ATAA	2	8	1297204	1297211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_017028	TTTC	2	8	1297221	1297228	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9106	NC_017028	TAA	2	6	1299026	1299031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_017028	ATT	2	6	1299033	1299038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_017028	T	6	6	1299058	1299063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_017028	TAAA	2	8	1299105	1299112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_017028	TAT	2	6	1299155	1299160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_017028	TAAAT	2	10	1299452	1299461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_017028	CTC	2	6	1300816	1300821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_017028	AAT	2	6	1301024	1301029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_017028	ATT	2	6	1302842	1302847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_017028	GAT	2	6	1302883	1302888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_017028	AAT	2	6	1303977	1303982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_017028	AGAA	2	8	1305438	1305445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_017028	A	6	6	1305444	1305449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_017028	TAA	2	6	1306517	1306522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_017028	AATA	2	8	1306529	1306536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_017028	AT	3	6	1306547	1306552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_017028	GT	3	6	1306558	1306563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_017028	TTG	2	6	1306636	1306641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_017028	ATT	2	6	1306706	1306711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_017028	T	6	6	1306716	1306721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_017028	T	6	6	1306726	1306731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_017028	A	8	8	1306816	1306823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_017028	T	6	6	1308717	1308722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_017028	CT	3	6	1308723	1308728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9130	NC_017028	TAAA	2	8	1308781	1308788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_017028	CAT	2	6	1308825	1308830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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