MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 9794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017028	A	6	6	771572	771577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017028	GTC	2	6	772834	772839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017028	AGC	2	6	772846	772851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017028	TCG	2	6	772894	772899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017028	TCT	2	6	772912	772917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017028	AATAA	2	10	772955	772964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017028	TAA	2	6	774049	774054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017028	TA	4	8	775832	775839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017028	AAC	2	6	775842	775847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017028	A	6	6	775850	775855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017028	TAA	2	6	775856	775861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017028	GATT	2	8	777197	777204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017028	CAT	2	6	777209	777214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017028	ATA	2	6	777281	777286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017028	TAA	2	6	777287	777292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017028	GTT	2	6	777384	777389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017028	TACA	2	8	777400	777407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_017028	ATAA	2	8	777433	777440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017028	TTC	2	6	777441	777446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017028	AATA	2	8	777457	777464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017028	A	6	6	777499	777504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017028	TTAC	2	8	777510	777517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_017028	TAA	3	9	777561	777569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017028	TAT	2	6	778963	778968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017028	GTT	2	6	778977	778982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017028	TATT	2	8	778995	779002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017028	CTC	2	6	779013	779018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_017028	A	6	6	779060	779065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017028	TA	3	6	779067	779072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017028	TTG	2	6	780541	780546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017028	A	6	6	780574	780579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017028	CAT	2	6	780580	780585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017028	TAGGG	2	10	780802	780811	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017028	TAA	2	6	780841	780846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017028	TGCT	2	8	781082	781089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_017028	ATT	2	6	781090	781095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017028	TCT	2	6	781096	781101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017028	GAC	2	6	781146	781151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017028	ACT	2	6	781179	781184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_017028	AAT	2	6	781224	781229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017028	ATAA	2	8	781255	781262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017028	TAA	2	6	781307	781312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017028	TTA	2	6	781369	781374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017028	CAA	2	6	781438	781443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017028	AAAT	2	8	781453	781460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017028	TAA	2	6	781497	781502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017028	AAAT	2	8	781521	781528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017028	TAA	2	6	781565	781570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017028	CAA	2	6	781627	781632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017028	A	6	6	781647	781652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5052	NC_017028	TTA	2	6	781777	781782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017028	TTA	2	6	781828	781833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017028	A	6	6	781843	781848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017028	A	6	6	782065	782070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017028	CAA	2	6	782104	782109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017028	ACA	2	6	782136	782141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017028	A	6	6	782141	782146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017028	AAG	2	6	782244	782249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017028	TAAA	2	8	782328	782335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017028	A	6	6	782333	782338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017028	CTTCAA	2	12	782369	782380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5066	NC_017028	AT	3	6	782447	782452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017028	AT	3	6	782481	782486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017028	ATT	2	6	782575	782580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017028	ATT	2	6	782606	782611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017028	AT	3	6	782622	782627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017028	CT	3	6	782629	782634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_017028	TTAA	2	8	782641	782648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017028	TAA	3	9	782646	782654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017028	GCA	2	6	782686	782691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5078	NC_017028	GAA	2	6	782820	782825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017028	AT	3	6	782829	782834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017028	CTAT	2	8	782845	782852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_017028	A	6	6	782871	782876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017028	TAAA	2	8	782890	782897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017028	ATA	2	6	782947	782952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017028	TCA	2	6	782953	782958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017028	TTACC	2	10	782994	783003	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5086	NC_017028	GA	3	6	783060	783065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017028	A	6	6	783076	783081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017028	AAT	2	6	783107	783112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017028	A	8	8	783114	783121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017028	AAT	2	6	783130	783135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017028	TGA	2	6	783138	783143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_017028	AAC	2	6	783217	783222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5099	NC_017028	GAA	2	6	783445	783450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017028	TGC	2	6	783471	783476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017028	AAG	2	6	783523	783528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017028	ATT	2	6	783581	783586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017028	ATG	2	6	783595	783600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017028	A	7	7	783602	783608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017028	TCA	2	6	783610	783615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017028	TAT	2	6	783617	783622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017028	A	8	8	783629	783636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017028	AT	3	6	783647	783652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017028	A	6	6	783712	783717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017028	TA	3	6	783731	783736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017028	TAT	2	6	783766	783771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017028	TGA	2	6	783772	783777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017028	A	6	6	783777	783782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017028	AAAG	2	8	783784	783791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017028	AAT	2	6	783838	783843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017028	CAT	2	6	783845	783850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5118	NC_017028	TTA	2	6	783962	783967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017028	ACCA	2	8	783986	783993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_017028	AAG	2	6	783996	784001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_017028	TATC	2	8	784084	784091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_017028	CTTT	2	8	784110	784117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_017028	TAG	2	6	784187	784192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017028	AAT	2	6	784199	784204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017028	A	6	6	784217	784222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017028	A	7	7	784237	784243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017028	TAA	2	6	784266	784271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017028	TA	3	6	784292	784297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017028	A	6	6	784300	784305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017028	ATA	2	6	784367	784372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017028	TAT	2	6	784400	784405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017028	TTAT	2	8	784451	784458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017028	GGTA	2	8	784524	784531	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017028	TATC	2	8	784593	784600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5136	NC_017028	AGA	2	6	784667	784672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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