MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	AT	3	6	824	829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017020	TA	3	6	5257	5262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017020	TC	3	6	7049	7054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017020	CT	3	6	8135	8140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017020	AT	3	6	8926	8931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017020	TA	3	6	9507	9512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017020	TA	3	6	9516	9521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017020	TA	3	6	9529	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017020	AT	3	6	9804	9809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017020	TA	3	6	9824	9829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017020	TA	3	6	10572	10577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017020	AT	3	6	10582	10587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017020	AT	3	6	10684	10689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017020	AT	3	6	11025	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017020	GA	3	6	15433	15438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017020	AT	3	6	15665	15670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017020	TA	3	6	15688	15693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017020	AT	3	6	15708	15713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017020	TA	3	6	15983	15988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017020	TA	3	6	15996	16001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017020	AT	3	6	16004	16009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017020	AT	3	6	16759	16764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017020	TA	3	6	17689	17694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017020	TA	3	6	18009	18014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017020	AT	3	6	19339	19344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017020	AT	3	6	19468	19473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017020	AT	3	6	19651	19656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017020	AG	3	6	19723	19728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017020	AT	3	6	25584	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017020	CT	3	6	26080	26085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017020	CT	3	6	26335	26340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017020	AT	4	8	26476	26483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017020	CT	3	6	26830	26835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017020	TC	3	6	26867	26872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017020	TA	3	6	27052	27057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017020	TC	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017020	TC	3	6	27562	27567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017020	AT	3	6	28244	28249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017020	CT	3	6	28751	28756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017020	CT	3	6	29072	29077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017020	AT	3	6	29783	29788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017020	AT	3	6	30777	30782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017020	AT	3	6	31480	31485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017020	AT	3	6	31910	31915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.