MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 5940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016932	AGTC	2	8	1804744	1804751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_016932	CAAG	2	8	1805307	1805314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_016932	TTG	2	6	1805317	1805322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016932	GCG	2	6	1805360	1805365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_016932	TTAA	2	8	1805667	1805674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016932	AGC	2	6	1805718	1805723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_016932	CAG	2	6	1805728	1805733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4010	NC_016932	AT	3	6	1805835	1805840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4012	NC_016932	ACA	2	6	1805930	1805935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_016932	A	7	7	1805977	1805983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016932	ACC	2	6	1806063	1806068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_016932	GGT	2	6	1806075	1806080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016932	A	6	6	1806088	1806093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016932	TCT	2	6	1806233	1806238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016932	AG	3	6	1806253	1806258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016932	CA	3	6	1806299	1806304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_016932	GGA	2	6	1806305	1806310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016932	ATG	2	6	1806332	1806337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016932	CTCC	2	8	1806379	1806386	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4023	NC_016932	TTA	2	6	1807288	1807293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016932	GGC	2	6	1807764	1807769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4028	NC_016932	CGAT	2	8	1810611	1810618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_016932	GCG	2	6	1810711	1810716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4031	NC_016932	G	6	6	1810776	1810781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016932	ACGC	2	8	1810810	1810817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4037	NC_016932	AAGCA	2	10	1811261	1811270	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4042	NC_016932	C	6	6	1811497	1811502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4051	NC_016932	GCA	2	6	1812326	1812331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4057	NC_016932	AACAA	2	10	1812870	1812879	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4065	NC_016932	GCA	2	6	1813206	1813211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4087	NC_016932	GTT	3	9	1814362	1814370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_016932	CCAA	2	8	1814864	1814871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_016932	GAA	2	6	1814977	1814982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016932	TCC	2	6	1815075	1815080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_016932	ACCA	2	8	1815084	1815091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_016932	GAC	2	6	1815126	1815131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4105	NC_016932	GAC	2	6	1815225	1815230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4107	NC_016932	CAT	2	6	1815284	1815289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_016932	ATC	2	6	1815316	1815321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_016932	ATCCCT	2	12	1815331	1815342	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_016932	CCA	2	6	1815352	1815357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_016932	CAC	2	6	1815359	1815364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_016932	CAC	2	6	1815386	1815391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_016932	ACA	2	6	1815408	1815413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_016932	CTC	2	6	1815441	1815446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_016932	CAC	2	6	1815452	1815457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_016932	AC	3	6	1815466	1815471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_016932	CAAAGG	2	12	1815489	1815500	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4118	NC_016932	AGC	2	6	1815543	1815548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_016932	CTA	2	6	1815616	1815621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_016932	CAGA	2	8	1815835	1815842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_016932	GTC	2	6	1815911	1815916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_016932	TGA	3	9	1815951	1815959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016932	CGA	2	6	1815972	1815977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_016932	CG	3	6	1816021	1816026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_016932	GTG	2	6	1816119	1816124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016932	CGT	2	6	1816172	1816177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_016932	TCT	2	6	1816178	1816183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_016932	GAT	2	6	1816203	1816208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016932	A	6	6	1816269	1816274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016932	CACC	2	8	1817092	1817099	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4131	NC_016932	GAA	2	6	1817120	1817125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016932	AGG	2	6	1817179	1817184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016932	AGA	2	6	1817188	1817193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016932	CAT	2	6	1817207	1817212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_016932	ATT	2	6	1817747	1817752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_016932	CAG	2	6	1817773	1817778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_016932	T	6	6	1819468	1819473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_016932	T	6	6	1819500	1819505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_016932	GTT	2	6	1823648	1823653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_016932	GCT	2	6	1823659	1823664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_016932	TA	4	8	1823772	1823779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_016932	TG	3	6	1823801	1823806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_016932	AGG	2	6	1823826	1823831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_016932	TGAA	2	8	1823832	1823839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_016932	AC	3	6	1823841	1823846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4147	NC_016932	TCAC	2	8	1823851	1823858	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4148	NC_016932	CAC	2	6	1823866	1823871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4149	NC_016932	GGC	2	6	1823889	1823894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4150	NC_016932	ACC	2	6	1823993	1823998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4152	NC_016932	CAA	2	6	1824055	1824060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4153	NC_016932	T	6	6	1824072	1824077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_016932	CA	4	8	1824102	1824109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4155	NC_016932	GTT	2	6	1824117	1824122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_016932	CGTA	2	8	1824268	1824275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4157	NC_016932	CGTC	2	8	1824322	1824329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4158	NC_016932	CTT	2	6	1824355	1824360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4159	NC_016932	CGG	2	6	1824377	1824382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_016932	CAC	2	6	1824677	1824682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4163	NC_016932	AGG	2	6	1824733	1824738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_016932	CCA	2	6	1824760	1824765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4165	NC_016932	CCA	2	6	1824843	1824848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4166	NC_016932	GCG	2	6	1824855	1824860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4167	NC_016932	CG	3	6	1824951	1824956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4168	NC_016932	CAG	2	6	1825007	1825012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4171	NC_016932	ACC	2	6	1825258	1825263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4173	NC_016932	ACC	2	6	1825378	1825383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4174	NC_016932	A	6	6	1825461	1825466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4175	NC_016932	GCA	2	6	1825496	1825501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4178	NC_016932	CA	3	6	1825627	1825632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4179	NC_016932	CAC	2	6	1825677	1825682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4183	NC_016932	CAC	2	6	1825891	1825896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4200	NC_016932	CAC	2	6	1826808	1826813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4202	NC_016932	CA	3	6	1826879	1826884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4203	NC_016932	CGTT	2	8	1826931	1826938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4207	NC_016932	A	6	6	1827181	1827186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4208	NC_016932	AC	3	6	1827189	1827194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4209	NC_016932	CAAA	2	8	1827202	1827209	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4210	NC_016932	A	6	6	1827207	1827212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4211	NC_016932	ATT	2	6	1827237	1827242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4213	NC_016932	ACC	2	6	1827277	1827282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4217	NC_016932	CAC	2	6	1827312	1827317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4218	NC_016932	CAA	2	6	1827323	1827328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4219	NC_016932	CAT	2	6	1827356	1827361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4221	NC_016932	AAC	2	6	1827393	1827398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4222	NC_016932	CAACA	2	10	1827411	1827420	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4223	NC_016932	CA	3	6	1827419	1827424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4224	NC_016932	ACA	3	9	1827422	1827430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4225	NC_016932	CA	3	6	1827429	1827434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4226	NC_016932	TCA	2	6	1827435	1827440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4228	NC_016932	CCA	2	6	1827456	1827461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4229	NC_016932	AGC	2	6	1827468	1827473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4231	NC_016932	A	7	7	1827508	1827514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_016932	ACA	2	6	1827518	1827523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_016932	ACCA	2	8	1827527	1827534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4234	NC_016932	AAAAAC	2	12	1827545	1827556	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4237	NC_016932	TGACG	2	10	1827696	1827705	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4239	NC_016932	TG	3	6	1827879	1827884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_016932	ATG	2	6	1827905	1827910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4242	NC_016932	TC	3	6	1827953	1827958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_016932	CCA	2	6	1827967	1827972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4244	NC_016932	CACGA	2	10	1828032	1828041	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4247	NC_016932	TTC	2	6	1828131	1828136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4249	NC_016932	CTC	2	6	1828347	1828352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4250	NC_016932	TCC	2	6	1828395	1828400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4251	NC_016932	GAC	2	6	1828509	1828514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_016932	ACC	2	6	1828522	1828527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4253	NC_016932	GCT	2	6	1828586	1828591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_016932	CTT	2	6	1828611	1828616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_016932	CTG	2	6	1828734	1828739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_016932	CAA	2	6	1828837	1828842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_016932	CCA	2	6	1828882	1828887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4258	NC_016932	CA	4	8	1828886	1828893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_016932	CGC	2	6	1829038	1829043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4260	NC_016932	A	6	6	1829091	1829096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_016932	ACCA	2	8	1829098	1829105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_016932	ACA	2	6	1829571	1829576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4263	NC_016932	CA	3	6	1829588	1829593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4264	NC_016932	CAA	2	6	1829614	1829619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_016932	CAACA	2	10	1829672	1829681	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4267	NC_016932	CA	3	6	1829680	1829685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4268	NC_016932	CAG	2	6	1829699	1829704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4284	NC_016932	ATTT	2	8	1834256	1834263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4352	NC_016932	AGA	2	6	1863958	1863963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4362	NC_016932	AGC	2	6	1867860	1867865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4387	NC_016932	GC	3	6	1886937	1886942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4390	NC_016932	CTT	2	6	1890491	1890496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4391	NC_016932	CTTC	2	8	1890520	1890527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4394	NC_016932	CGG	2	6	1890599	1890604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4396	NC_016932	CAA	2	6	1890707	1890712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4397	NC_016932	GTA	2	6	1890786	1890791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_016932	GTA	3	9	1891098	1891106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_016932	TAACC	2	10	1922515	1922524	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4498	NC_016932	T	6	6	1922556	1922561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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