MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 5940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2621	NC_016932	ATCGC	2	10	1139147	1139156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2627	NC_016932	CTAT	2	8	1139481	1139488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2630	NC_016932	C	6	6	1139618	1139623	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2631	NC_016932	TGC	2	6	1139757	1139762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_016932	GCTT	2	8	1139986	1139993	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2633	NC_016932	TGC	2	6	1140040	1140045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_016932	CCA	2	6	1140052	1140057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2635	NC_016932	GAT	2	6	1140097	1140102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_016932	C	6	6	1140129	1140134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2637	NC_016932	ATT	2	6	1140200	1140205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_016932	ATA	2	6	1140470	1140475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_016932	CGA	2	6	1141465	1141470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2640	NC_016932	TCG	2	6	1144090	1144095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2641	NC_016932	AAG	2	6	1148229	1148234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_016932	ATC	2	6	1148300	1148305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2643	NC_016932	CAA	2	6	1148316	1148321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2644	NC_016932	TCA	2	6	1148338	1148343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2645	NC_016932	TG	3	6	1148353	1148358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_016932	TAAAG	2	10	1148388	1148397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_016932	TCT	2	6	1149148	1149153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2648	NC_016932	ATTT	2	8	1149162	1149169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2649	NC_016932	T	7	7	1149802	1149808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2650	NC_016932	ATC	2	6	1149870	1149875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2651	NC_016932	GAA	2	6	1149931	1149936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_016932	GCC	2	6	1149988	1149993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2653	NC_016932	GTC	2	6	1150047	1150052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2654	NC_016932	GCT	2	6	1150089	1150094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2655	NC_016932	T	6	6	1150122	1150127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2656	NC_016932	ATC	2	6	1150177	1150182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2657	NC_016932	TGC	2	6	1150329	1150334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2658	NC_016932	GCA	2	6	1150414	1150419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2659	NC_016932	GCTT	2	8	1150429	1150436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2660	NC_016932	ACG	2	6	1150467	1150472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2661	NC_016932	CTG	2	6	1150536	1150541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2662	NC_016932	TCGAC	2	10	1150573	1150582	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2663	NC_016932	CGC	2	6	1150622	1150627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2664	NC_016932	TAA	2	6	1150640	1150645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_016932	TTC	2	6	1150665	1150670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2669	NC_016932	GGAA	2	8	1150841	1150848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2670	NC_016932	TC	3	6	1150858	1150863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2671	NC_016932	AAG	2	6	1150902	1150907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2672	NC_016932	ACTC	2	8	1150908	1150915	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2673	NC_016932	AAT	2	6	1150977	1150982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2674	NC_016932	GATT	2	8	1150986	1150993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2675	NC_016932	ACC	4	12	1151017	1151028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2677	NC_016932	CAT	2	6	1151482	1151487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2679	NC_016932	GATT	2	8	1154377	1154384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2683	NC_016932	T	6	6	1156588	1156593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2684	NC_016932	CCCA	2	8	1156604	1156611	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2685	NC_016932	GTAT	2	8	1156723	1156730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2692	NC_016932	AGT	2	6	1161145	1161150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2694	NC_016932	TAC	2	6	1163921	1163926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2702	NC_016932	CGG	2	6	1169437	1169442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2714	NC_016932	TTA	2	6	1181160	1181165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2723	NC_016932	GGAC	2	8	1182501	1182508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2726	NC_016932	GTAG	2	8	1185921	1185928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2727	NC_016932	TGAA	2	8	1185941	1185948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2728	NC_016932	CAGA	2	8	1189311	1189318	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2729	NC_016932	CAC	2	6	1189674	1189679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2730	NC_016932	AAGCTC	2	12	1192534	1192545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2731	NC_016932	ATG	2	6	1192580	1192585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2732	NC_016932	CTTT	2	8	1192592	1192599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2739	NC_016932	ACC	2	6	1196100	1196105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2740	NC_016932	TGT	2	6	1196137	1196142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2742	NC_016932	GGA	2	6	1196200	1196205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2743	NC_016932	TTG	2	6	1196233	1196238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2744	NC_016932	AGCT	2	8	1197355	1197362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2745	NC_016932	ACT	2	6	1197398	1197403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2746	NC_016932	GTT	2	6	1202052	1202057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2747	NC_016932	AGTC	2	8	1202136	1202143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2748	NC_016932	GCT	2	6	1202156	1202161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2749	NC_016932	GTT	2	6	1202164	1202169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2750	NC_016932	TC	3	6	1202170	1202175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2751	NC_016932	ACG	2	6	1202221	1202226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2752	NC_016932	GAT	2	6	1204071	1204076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2753	NC_016932	TCC	2	6	1204727	1204732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2754	NC_016932	TGC	2	6	1204755	1204760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2755	NC_016932	AC	3	6	1204796	1204801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2756	NC_016932	AAG	2	6	1206630	1206635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2757	NC_016932	A	6	6	1206666	1206671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2758	NC_016932	CTT	2	6	1209135	1209140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2759	NC_016932	CTGT	2	8	1209738	1209745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2760	NC_016932	CTTT	2	8	1209772	1209779	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2761	NC_016932	CA	3	6	1209798	1209803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2762	NC_016932	ACC	2	6	1211885	1211890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2763	NC_016932	GAA	2	6	1211913	1211918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2764	NC_016932	CTTA	2	8	1213160	1213167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2765	NC_016932	ATA	2	6	1213243	1213248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2766	NC_016932	TAA	2	6	1213263	1213268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2767	NC_016932	GAA	2	6	1213278	1213283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2768	NC_016932	GAA	2	6	1214595	1214600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2770	NC_016932	CTG	2	6	1215050	1215055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2785	NC_016932	GTTC	2	8	1225813	1225820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2882	NC_016932	ACCC	2	8	1271251	1271258	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2883	NC_016932	TAA	2	6	1271273	1271278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2884	NC_016932	GCTTA	2	10	1271313	1271322	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2885	NC_016932	AGAA	2	8	1271703	1271710	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2886	NC_016932	GCC	2	6	1271725	1271730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2887	NC_016932	TCT	2	6	1273485	1273490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2889	NC_016932	TTC	2	6	1273561	1273566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2890	NC_016932	ATCGT	2	10	1273572	1273581	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2891	NC_016932	TTG	2	6	1274251	1274256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2892	NC_016932	GTAT	2	8	1274269	1274276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2894	NC_016932	A	6	6	1274285	1274290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2898	NC_016932	ATT	2	6	1274379	1274384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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