MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 5940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016932	GTT	2	6	470735	470740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016932	CTG	2	6	470801	470806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_016932	TCGC	2	8	470893	470900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_016932	CTTTG	2	10	470915	470924	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_016932	CGC	2	6	470928	470933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_016932	TCC	2	6	470938	470943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_016932	TTCC	2	8	471084	471091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_016932	CTC	2	6	471153	471158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_016932	TCT	2	6	471232	471237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1012	NC_016932	GCT	2	6	471340	471345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016932	GTTC	2	8	471359	471366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_016932	AAG	2	6	471405	471410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016932	GTT	2	6	472386	472391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016932	TATG	2	8	472666	472673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016932	AAG	2	6	472710	472715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016932	CTC	2	6	473879	473884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_016932	GTGCCT	2	12	476347	476358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016932	ATG	2	6	477290	477295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016932	CTAT	2	8	478562	478569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_016932	TGGTTC	2	12	479736	479747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1023	NC_016932	AGG	2	6	479757	479762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016932	ATT	2	6	480486	480491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016932	AT	3	6	480568	480573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016932	GT	4	8	480603	480610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1028	NC_016932	TAA	2	6	482750	482755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016932	TTTC	2	8	482778	482785	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_016932	GC	3	6	482789	482794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1033	NC_016932	GAT	2	6	485781	485786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016932	CTG	2	6	485828	485833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016932	TC	3	6	485834	485839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_016932	TGT	2	6	485842	485847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016932	CGA	2	6	485859	485864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1042	NC_016932	A	6	6	485969	485974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016932	GTA	2	6	486000	486005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1053	NC_016932	ACT	2	6	493668	493673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1063	NC_016932	GTG	2	6	494839	494844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016932	GGA	2	6	494857	494862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016932	CGA	2	6	494868	494873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_016932	ATG	2	6	501027	501032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_016932	GAT	2	6	501575	501580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_016932	GC	3	6	501613	501618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_016932	GA	3	6	501651	501656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016932	GC	4	8	501675	501682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_016932	CTG	2	6	501686	501691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1108	NC_016932	GTT	2	6	501926	501931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016932	GGC	3	9	501936	501944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016932	GAG	2	6	501972	501977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016932	ATT	2	6	502047	502052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_016932	CCT	2	6	502101	502106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1115	NC_016932	AAG	2	6	502127	502132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016932	GCG	2	6	502480	502485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016932	GTA	2	6	504162	504167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016932	A	7	7	504190	504196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016932	T	6	6	504217	504222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016932	T	6	6	504301	504306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016932	AT	3	6	504311	504316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016932	GGT	2	6	504320	504325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016932	CCA	2	6	506110	506115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_016932	A	7	7	506137	506143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016932	T	6	6	506144	506149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016932	TTA	2	6	506174	506179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016932	CGTCC	2	10	506184	506193	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1128	NC_016932	TAA	2	6	506257	506262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016932	CTTCT	2	10	507646	507655	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1130	NC_016932	GTT	2	6	507670	507675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016932	TAC	2	6	508906	508911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016932	CCA	2	6	509910	509915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_016932	GCA	2	6	509923	509928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_016932	CCT	2	6	512127	512132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_016932	TGAA	2	8	513664	513671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_016932	GCGT	2	8	517283	517290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1139	NC_016932	CAAG	2	8	517293	517300	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1249	NC_016932	ACCTA	2	10	576053	576062	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1250	NC_016932	TCT	2	6	576855	576860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_016932	GAG	2	6	576944	576949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_016932	GAAG	2	8	576963	576970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_016932	CGG	2	6	577765	577770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_016932	T	6	6	577776	577781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_016932	TGGA	2	8	577813	577820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_016932	GCA	2	6	577826	577831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_016932	TCC	2	6	577837	577842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1259	NC_016932	GCA	2	6	577874	577879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1261	NC_016932	TTTC	2	8	577947	577954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1262	NC_016932	AATC	2	8	579350	579357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1263	NC_016932	TAA	2	6	583525	583530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_016932	ATT	3	9	583562	583570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_016932	TTTG	2	8	583707	583714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_016932	AT	3	6	583749	583754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_016932	TTAA	2	8	583768	583775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_016932	TA	3	6	583803	583808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_016932	GTG	2	6	583834	583839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_016932	TG	3	6	610156	610161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_016932	AGC	2	6	610186	610191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_016932	CTG	2	6	610205	610210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_016932	ACC	2	6	610224	610229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_016932	TGA	2	6	610249	610254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_016932	GGGAG	2	10	610299	610308	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_016932	GAA	2	6	610379	610384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_016932	TGG	2	6	610425	610430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_016932	AGCGAA	2	12	610439	610450	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1417	NC_016932	GTT	2	6	610464	610469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_016932	TGGT	2	8	610684	610691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_016932	AGG	2	6	610871	610876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_016932	AGC	2	6	610887	610892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1422	NC_016932	GTTG	2	8	610995	611002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_016932	CGT	2	6	611013	611018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_016932	GT	3	6	611054	611059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_016932	CCG	2	6	611109	611114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1426	NC_016932	GTG	2	6	611222	611227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_016932	GTG	2	6	611237	611242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_016932	TG	3	6	611287	611292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_016932	GT	4	8	611294	611301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_016932	GTA	2	6	611325	611330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_016932	TGC	2	6	611418	611423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_016932	T	6	6	611453	611458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_016932	GGT	2	6	611536	611541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_016932	TTG	2	6	611628	611633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_016932	TGG	2	6	611655	611660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_016932	TTA	2	6	611688	611693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_016932	CGG	2	6	611822	611827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_016932	CTG	2	6	611907	611912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1440	NC_016932	GTG	2	6	612070	612075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_016932	TGG	2	6	612154	612159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_016932	CCT	2	6	612181	612186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1443	NC_016932	GGT	2	6	612236	612241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_016932	GTG	2	6	612334	612339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_016932	TCG	2	6	612432	612437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1447	NC_016932	CCG	2	6	612537	612542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1448	NC_016932	GAA	2	6	612558	612563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_016932	TACG	2	8	612644	612651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1451	NC_016932	AAC	2	6	612797	612802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_016932	TGT	2	6	612807	612812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_016932	GT	3	6	612811	612816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_016932	TGT	2	6	612822	612827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_016932	A	6	6	612842	612847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_016932	TGT	2	6	612857	612862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_016932	TGTGT	2	10	612897	612906	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_016932	TGG	2	6	612920	612925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_016932	CGC	2	6	613024	613029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1460	NC_016932	GTG	2	6	613048	613053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1461	NC_016932	GGGT	2	8	613055	613062	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_016932	GT	3	6	613073	613078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_016932	CAC	2	6	613086	613091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1469	NC_016932	CTT	2	6	613487	613492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1470	NC_016932	TGC	2	6	613638	613643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1472	NC_016932	TC	3	6	613666	613671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1473	NC_016932	GGCT	2	8	613682	613689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1474	NC_016932	GGT	2	6	613702	613707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1475	NC_016932	AGAA	2	8	613739	613746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1476	NC_016932	GGC	2	6	613772	613777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1479	NC_016932	AGC	2	6	613958	613963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1482	NC_016932	GT	3	6	614331	614336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1483	NC_016932	ATG	2	6	614996	615001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1485	NC_016932	G	7	7	615022	615028	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_016932	T	7	7	615029	615035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_016932	AGA	2	6	619323	619328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1488	NC_016932	AATA	2	8	619360	619367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_016932	TACG	2	8	619382	619389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1490	NC_016932	CGT	2	6	619416	619421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1491	NC_016932	G	6	6	619451	619456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1492	NC_016932	GCT	3	9	619494	619502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1494	NC_016932	GCC	2	6	620195	620200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1496	NC_016932	CACG	2	8	620273	620280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1497	NC_016932	CTG	2	6	620323	620328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_016932	GTT	2	6	620334	620339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1499	NC_016932	GTTG	2	8	620344	620351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_016932	GTT	2	6	620638	620643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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