MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC02 chromosome

Total Repeats: 5854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016802	CCT	2	6	1261327	1261332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_016802	A	6	6	1261402	1261407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016802	TC	3	6	1261520	1261525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_016802	TTG	2	6	1261547	1261552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016802	TAC	2	6	1262866	1262871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_016802	TCAAG	2	10	1264722	1264731	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3007	NC_016802	AC	3	6	1264744	1264749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_016802	ATT	2	6	1264822	1264827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016802	TAAT	2	8	1264875	1264882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016802	TGC	2	6	1264917	1264922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_016802	AT	3	6	1264973	1264978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016802	ACA	2	6	1265042	1265047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_016802	CGA	2	6	1265202	1265207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_016802	CAA	2	6	1265235	1265240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016802	TCT	2	6	1265244	1265249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_016802	TC	3	6	1268231	1268236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_016802	AGT	2	6	1268850	1268855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016802	AAG	2	6	1269659	1269664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016802	T	6	6	1271383	1271388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016802	AAAG	2	8	1271506	1271513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016802	TAAG	2	8	1271530	1271537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016802	CGA	2	6	1271548	1271553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_016802	CT	3	6	1271592	1271597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_016802	GA	3	6	1271608	1271613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016802	AAAAG	2	10	1273321	1273330	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016802	CTT	2	6	1279661	1279666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_016802	CCT	2	6	1279687	1279692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_016802	AATC	2	8	1279715	1279722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_016802	ATTC	2	8	1279799	1279806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_016802	TC	3	6	1279860	1279865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_016802	TTC	2	6	1279891	1279896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_016802	ACGA	2	8	1280063	1280070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_016802	CAA	2	6	1280090	1280095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_016802	C	6	6	1280113	1280118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3036	NC_016802	ATG	2	6	1284864	1284869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016802	ATC	2	6	1284878	1284883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016802	GCCAT	2	10	1285925	1285934	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3039	NC_016802	ACCGT	2	10	1286026	1286035	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3040	NC_016802	AAT	2	6	1286044	1286049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016802	GA	3	6	1286093	1286098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016802	T	6	6	1286123	1286128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016802	CTA	2	6	1286155	1286160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_016802	T	6	6	1286177	1286182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016802	GTT	2	6	1288371	1288376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3047	NC_016802	TGT	2	6	1288412	1288417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016802	AAT	2	6	1289564	1289569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016802	ACC	2	6	1289587	1289592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_016802	CGAG	2	8	1291258	1291265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3052	NC_016802	TTA	2	6	1293352	1293357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016802	TCCT	2	8	1294250	1294257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_016802	AAC	2	6	1294278	1294283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016802	AGGT	2	8	1294294	1294301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3060	NC_016802	TTA	2	6	1295676	1295681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3062	NC_016802	T	6	6	1296847	1296852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016802	GAA	2	6	1296881	1296886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016802	TTG	2	6	1296957	1296962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016802	ATT	2	6	1302709	1302714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016802	T	6	6	1305270	1305275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016802	CGACG	2	10	1307115	1307124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3070	NC_016802	AT	3	6	1310129	1310134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_016802	GATT	2	8	1313454	1313461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_016802	CT	3	6	1324943	1324948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_016802	TAAG	2	8	1325002	1325009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_016802	AAT	2	6	1325101	1325106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016802	CGAT	2	8	1327157	1327164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_016802	AAT	2	6	1327218	1327223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_016802	ATAA	2	8	1327400	1327407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016802	TGG	2	6	1327410	1327415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_016802	AAGA	2	8	1327449	1327456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016802	CTT	2	6	1328646	1328651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3100	NC_016802	TAT	2	6	1333319	1333324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_016802	GAA	2	6	1333381	1333386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016802	GAA	2	6	1333390	1333395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016802	CAA	2	6	1333438	1333443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_016802	TGC	2	6	1333466	1333471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_016802	AGCA	2	8	1333624	1333631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_016802	GAC	2	6	1333660	1333665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_016802	CAC	2	6	1333701	1333706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_016802	AAAAT	2	10	1334694	1334703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016802	ATT	2	6	1335942	1335947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016802	TAT	2	6	1335989	1335994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016802	AACA	2	8	1336618	1336625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_016802	ACG	2	6	1336681	1336686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_016802	AAT	2	6	1336697	1336702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016802	CGA	2	6	1336736	1336741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_016802	ATT	2	6	1336749	1336754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016802	AAAT	2	8	1336782	1336789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016802	CAG	2	6	1339530	1339535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_016802	GATC	2	8	1339566	1339573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_016802	ATC	2	6	1339597	1339602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_016802	GCCC	2	8	1344234	1344241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3122	NC_016802	TGAT	2	8	1344315	1344322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016802	CTC	2	6	1344393	1344398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_016802	ATG	2	6	1344417	1344422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016802	ATT	2	6	1348071	1348076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016802	TCATT	2	10	1348077	1348086	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3127	NC_016802	GTT	2	6	1348108	1348113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_016802	ATC	2	6	1351004	1351009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_016802	TC	3	6	1351018	1351023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_016802	AAT	2	6	1353104	1353109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_016802	CAC	2	6	1353128	1353133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_016802	CAA	2	6	1354450	1354455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_016802	ACG	2	6	1355646	1355651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_016802	TTG	2	6	1356742	1356747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_016802	AGT	2	6	1356764	1356769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_016802	TCC	2	6	1357078	1357083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_016802	GT	3	6	1357106	1357111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_016802	AC	3	6	1357133	1357138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3139	NC_016802	G	6	6	1357150	1357155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_016802	TGT	2	6	1357173	1357178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_016802	GTG	2	6	1357600	1357605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_016802	GTG	2	6	1357667	1357672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_016802	CGG	2	6	1357674	1357679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3146	NC_016802	TTC	2	6	1357693	1357698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3149	NC_016802	AAC	2	6	1360212	1360217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3150	NC_016802	AGTT	2	8	1362609	1362616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_016802	TCAA	2	8	1362634	1362641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3152	NC_016802	AACT	2	8	1365546	1365553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3156	NC_016802	GGCG	2	8	1365754	1365761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3164	NC_016802	GGT	3	9	1370455	1370463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_016802	ATT	2	6	1370482	1370487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3246	NC_016802	TCC	2	6	1412256	1412261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3250	NC_016802	ATA	2	6	1413373	1413378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_016802	TGG	2	6	1413383	1413388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3255	NC_016802	TG	3	6	1414517	1414522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_016802	AG	3	6	1418502	1418507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_016802	CTT	2	6	1418517	1418522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_016802	CTA	2	6	1419067	1419072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_016802	ACA	2	6	1419498	1419503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_016802	ATA	2	6	1419527	1419532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_016802	T	6	6	1419588	1419593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_016802	ATC	2	6	1419662	1419667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_016802	AAAT	2	8	1419718	1419725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_016802	CAA	2	6	1419728	1419733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3265	NC_016802	AAT	2	6	1419753	1419758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_016802	T	6	6	1420592	1420597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_016802	T	7	7	1420630	1420636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_016802	GTTT	2	8	1420648	1420655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3287	NC_016802	TGC	2	6	1425907	1425912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3362	NC_016802	TCAC	2	8	1444065	1444072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3389	NC_016802	CA	3	6	1459295	1459300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3390	NC_016802	ATC	2	6	1461722	1461727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3391	NC_016802	GCTT	2	8	1461734	1461741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3393	NC_016802	GCC	2	6	1461801	1461806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3394	NC_016802	GGC	2	6	1461837	1461842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3395	NC_016802	GTT	2	6	1461846	1461851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3396	NC_016802	AAT	2	6	1462206	1462211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3397	NC_016802	CTG	2	6	1462235	1462240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3399	NC_016802	GGAT	2	8	1463309	1463316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3400	NC_016802	CCT	2	6	1466716	1466721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3402	NC_016802	CTG	2	6	1468100	1468105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3413	NC_016802	CAAA	2	8	1472948	1472955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3432	NC_016802	TG	3	6	1484135	1484140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_016802	GAG	2	6	1486024	1486029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3481	NC_016802	GC	3	6	1511144	1511149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3482	NC_016802	A	6	6	1512981	1512986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3483	NC_016802	CTT	2	6	1512999	1513004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3498	NC_016802	CTTT	2	8	1529225	1529232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3499	NC_016802	AGACA	2	10	1529262	1529271	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3500	NC_016802	TCC	2	6	1535582	1535587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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