MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae C7 (beta) chromosome

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016801	TAATCC	2	12	12931	12942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016801	TACTGC	2	12	19571	19582	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016801	GGGGAT	2	12	20127	20138	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016801	TCGCCG	2	12	43044	43055	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016801	TGGTTT	2	12	53204	53215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016801	ACTGAG	2	12	81130	81141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016801	CACTTC	2	12	132288	132299	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016801	CCCGCA	2	12	166428	166439	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016801	GAGTTC	2	12	170619	170630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016801	GGCCTT	2	12	182504	182515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016801	TGCATA	2	12	226869	226880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016801	ACGATG	2	12	228126	228137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016801	CCTATT	2	12	248279	248290	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016801	GCCACC	2	12	300799	300810	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016801	TTATGG	2	12	349299	349310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016801	ACAAGG	2	12	425191	425202	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016801	CGCTAT	2	12	480659	480670	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016801	CTTGCT	2	12	543540	543551	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016801	AAAAAC	2	12	548721	548732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016801	GGGGCA	2	12	582444	582455	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016801	GAGCCT	2	12	604530	604541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016801	TAAGCG	2	12	609148	609159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016801	TTGTGG	2	12	694736	694747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016801	GTTTGG	2	12	697275	697286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016801	TGTTGG	2	12	712805	712816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016801	AGCGAA	2	12	717617	717628	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016801	GCGTGT	3	18	720345	720362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016801	CGCATG	2	12	720365	720376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016801	TGTAAG	2	12	892761	892772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016801	AATCCT	2	12	896063	896074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016801	ATGTGG	2	12	949905	949916	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016801	AAAAGT	2	12	964950	964961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016801	GGTGAA	2	12	1062361	1062372	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016801	ATGGAT	2	12	1084846	1084857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016801	ATTGAT	2	12	1108902	1108913	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016801	GACCAT	2	12	1130974	1130985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016801	AGCGAA	2	12	1190109	1190120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016801	GACAGT	2	12	1220582	1220593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016801	TTGAGG	2	12	1225058	1225069	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016801	AAAAAC	2	12	1278574	1278585	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016801	ACCAGC	2	12	1416003	1416014	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016801	ACAGAA	2	12	1422857	1422868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016801	GTCAAC	2	12	1424934	1424945	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016801	TCAATG	2	12	1483605	1483616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016801	CTGCAT	2	12	1525965	1525976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016801	TGCAGC	2	12	1532756	1532767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016801	GACGGT	2	12	1575422	1575433	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016801	CAGCGC	2	12	1596887	1596898	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016801	CTGCCC	2	12	1596904	1596915	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016801	GATGTT	2	12	1799411	1799422	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016801	GCTGTG	2	12	1816709	1816720	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016801	GGCGGG	2	12	1872615	1872626	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016801	TTCGCT	2	12	1932916	1932927	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016801	GCAGTG	2	12	1948783	1948794	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016801	CGGTGA	2	12	1952650	1952661	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016801	GCCTAG	2	12	2020178	2020189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016801	ATCACC	2	12	2032870	2032881	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016801	CCTTTT	2	12	2063185	2063196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016801	AGGTTT	2	12	2123601	2123612	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016801	ACACCA	2	12	2166011	2166022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016801	TTCGCT	2	12	2211485	2211496	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016801	AAAGGA	2	12	2308640	2308651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016801	TTCGCT	2	12	2381406	2381417	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016801	ATTGTT	2	12	2390296	2390307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016801	TCCCTT	2	12	2447143	2447154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016801	CGCCAT	2	12	2447250	2447261	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.