MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae C7 (beta) chromosome

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016801	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016801	TGTGA	2	10	19404	19413	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016801	AAAAG	2	10	55297	55306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016801	GCCTA	2	10	70224	70233	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016801	TCCAC	2	10	88944	88953	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016801	TGCAC	2	10	97191	97200	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016801	TAATT	2	10	119872	119881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016801	TTAGC	2	10	121924	121933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016801	GAACA	2	10	144040	144049	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016801	TAACT	2	10	178733	178742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016801	TTGGG	2	10	216222	216231	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016801	TTGGC	2	10	226206	226215	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016801	TCGGC	2	10	226512	226521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016801	TTGGG	2	10	228510	228519	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016801	AAAGC	2	10	228915	228924	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016801	CACGA	2	10	260163	260172	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016801	ATAAC	2	10	262327	262336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016801	TTTGG	2	10	294912	294921	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016801	ATGTT	2	10	294996	295005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016801	TCCTT	2	10	315620	315629	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016801	TGATG	2	10	317203	317212	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016801	TGTGG	2	10	320360	320369	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016801	GTGCT	2	10	377040	377049	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016801	CACAC	2	10	379522	379531	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016801	TCTGC	2	10	405408	405417	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016801	GGGGT	2	10	428898	428907	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016801	GGAAA	2	10	430678	430687	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016801	TTTCA	2	10	439238	439247	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016801	CAGCA	2	10	456194	456203	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016801	TTTCC	2	10	472487	472496	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016801	CCATT	2	10	472617	472626	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016801	CAGTG	2	10	485758	485767	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016801	GGTAG	2	10	493169	493178	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016801	CGCTA	2	10	496330	496339	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016801	AGGAA	2	10	501040	501049	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016801	TGATG	2	10	560211	560220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016801	TTTTG	2	10	571834	571843	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016801	TGTCT	2	10	571853	571862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016801	GTCTA	2	10	574408	574417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016801	TGATC	2	10	576593	576602	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016801	CAGTT	2	10	582363	582372	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016801	GTTTT	2	10	587563	587572	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016801	CTTTC	2	10	596389	596398	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016801	TGAGC	2	10	607700	607709	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016801	TTTTG	2	10	617781	617790	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016801	GCTGC	2	10	629528	629537	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016801	CCATA	2	10	659777	659786	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016801	GGGAA	2	10	660945	660954	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016801	GCACC	2	10	667652	667661	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_016801	GCGCT	2	10	710077	710086	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016801	TCGTG	2	10	716064	716073	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016801	CGTCA	2	10	716400	716409	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016801	TGTTT	2	10	716577	716586	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016801	GGGAG	2	10	717476	717485	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016801	TGGCA	2	10	720095	720104	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016801	TAGTT	2	10	728517	728526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016801	ATGCG	2	10	729639	729648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016801	TAGTG	2	10	756330	756339	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016801	CCTGT	2	10	766610	766619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016801	CAACG	2	10	776724	776733	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016801	CTTTC	2	10	779335	779344	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016801	TGCTG	2	10	803798	803807	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016801	TTTCC	2	10	817561	817570	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016801	GGAGG	2	10	819572	819581	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016801	TGCAA	2	10	851993	852002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016801	ATTCG	2	10	852145	852154	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016801	GAAAG	2	10	853398	853407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016801	GGAGT	2	10	859842	859851	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016801	TGCGG	2	10	935766	935775	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016801	GTGTC	2	10	963877	963886	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016801	GACGA	2	10	967340	967349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016801	GAGAA	2	10	985988	985997	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016801	GCACT	2	10	1022096	1022105	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016801	GCCTC	2	10	1046238	1046247	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016801	GCTTG	2	10	1056898	1056907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016801	GATCG	2	10	1064798	1064807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016801	AACCT	2	10	1065539	1065548	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016801	GATTC	2	10	1071248	1071257	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016801	CACTA	2	10	1079436	1079445	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016801	AAAGT	2	10	1090705	1090714	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016801	GCGGT	2	10	1122917	1122926	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016801	GGTGG	2	10	1141482	1141491	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016801	CAAAA	2	10	1146833	1146842	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016801	ACACT	2	10	1159342	1159351	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016801	CATTT	2	10	1181967	1181976	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016801	TCGTG	2	10	1188556	1188565	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016801	CGTCA	2	10	1188892	1188901	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016801	TGTTT	2	10	1189069	1189078	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016801	GGGAG	2	10	1189968	1189977	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016801	TGGCA	2	10	1192587	1192596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016801	TTTTC	2	10	1192792	1192801	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016801	TTCGT	2	10	1243770	1243779	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016801	CCTAC	2	10	1247449	1247458	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_016801	CTTAC	2	10	1271372	1271381	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016801	TCAAG	2	10	1308949	1308958	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016801	AAAAG	2	10	1317552	1317561	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016801	GCCAT	2	10	1330156	1330165	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016801	ACCGT	2	10	1330257	1330266	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016801	CGACG	2	10	1351346	1351355	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016801	CAAAT	2	10	1354341	1354350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016801	AAAAT	2	10	1378923	1378932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016801	TCACT	2	10	1392306	1392315	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016801	GCTCA	2	10	1399972	1399981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016801	TTTAT	2	10	1413690	1413699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016801	CAACA	2	10	1420798	1420807	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016801	CTGAG	2	10	1421133	1421142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016801	AATGT	2	10	1425247	1425256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016801	AGCAA	2	10	1439653	1439662	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016801	GAACG	2	10	1439761	1439770	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016801	TCTCT	2	10	1439851	1439860	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016801	TGTTT	2	10	1452882	1452891	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016801	GCATT	2	10	1455591	1455600	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016801	AGAAT	2	10	1484563	1484572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016801	CGTAA	2	10	1484683	1484692	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016801	AGTGG	2	10	1494186	1494195	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016801	AATTG	2	10	1494250	1494259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016801	GCGCC	2	10	1494273	1494282	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_016801	CAGTA	2	10	1501518	1501527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016801	CACAA	2	10	1539108	1539117	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_016801	AAGTT	2	10	1562925	1562934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016801	GCAGC	2	10	1577232	1577241	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016801	AGACA	2	10	1585986	1585995	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016801	CCCCA	2	10	1603130	1603139	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_016801	AGCAC	2	10	1628847	1628856	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016801	CTTTA	2	10	1653956	1653965	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016801	ACCAA	2	10	1669443	1669452	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016801	TTTAT	2	10	1702866	1702875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016801	CGTTT	2	10	1705086	1705095	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016801	CATCT	2	10	1717505	1717514	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016801	TTAGG	2	10	1719428	1719437	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016801	CCGCA	2	10	1727846	1727855	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_016801	AGAAA	2	10	1737731	1737740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016801	TTCAA	2	10	1764253	1764262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016801	TCCTC	2	10	1792281	1792290	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_016801	TCGGC	2	10	1799817	1799826	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016801	AGAAA	2	10	1820737	1820746	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016801	GTGTG	2	10	1821923	1821932	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016801	CAACG	2	10	1824231	1824240	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_016801	CAAAG	2	10	1840783	1840792	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016801	CAACG	2	10	1841266	1841275	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_016801	TGCAC	2	10	1855507	1855516	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_016801	GAATC	2	10	1855682	1855691	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016801	TTTCT	2	10	1858433	1858442	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016801	TCCCC	2	10	1866530	1866539	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
145	NC_016801	GCAAA	2	10	1877993	1878002	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016801	ACCTA	2	10	1879427	1879436	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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148	NC_016801	GGTTG	2	10	1892515	1892524	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016801	TTTTC	2	10	1893650	1893659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_016801	TCCCC	2	10	1910422	1910431	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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153	NC_016801	CTCCC	2	10	1933059	1933068	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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158	NC_016801	AAGTG	2	10	1947354	1947363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016801	GTGTT	2	10	1952255	1952264	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016801	TTTAT	2	10	1953420	1953429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016801	GCTGA	2	10	1958399	1958408	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_016801	TCGTG	2	10	1959563	1959572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_016801	AGCAC	2	10	1979429	1979438	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_016801	TGGCT	2	10	1982537	1982546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_016801	AGCCA	2	10	1983460	1983469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_016801	TTGGG	2	10	2030799	2030808	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016801	ACCGC	2	10	2091299	2091308	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
173	NC_016801	ACGCC	2	10	2091542	2091551	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
174	NC_016801	ACTTC	2	10	2107800	2107809	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_016801	TAAGT	2	10	2118746	2118755	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_016801	CGGTG	2	10	2123209	2123218	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
178	NC_016801	CCTAA	2	10	2128974	2128983	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_016801	CATGC	2	10	2155902	2155911	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_016801	TGGGC	2	10	2179408	2179417	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
182	NC_016801	TGCGG	2	10	2180059	2180068	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
183	NC_016801	ATGTG	2	10	2188849	2188858	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016801	CAGCA	2	10	2195605	2195614	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
185	NC_016801	CCACA	2	10	2198498	2198507	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
186	NC_016801	GAACC	2	10	2203440	2203449	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
187	NC_016801	TGGGC	2	10	2207208	2207217	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
188	NC_016801	TGCCA	2	10	2209009	2209018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
189	NC_016801	CTCCC	2	10	2211628	2211637	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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191	NC_016801	TGACG	2	10	2212704	2212713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_016801	CACGA	2	10	2213040	2213049	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_016801	CCACC	2	10	2250285	2250294	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
194	NC_016801	GCGGG	2	10	2255039	2255048	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
195	NC_016801	TACCC	2	10	2273976	2273985	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
196	NC_016801	CCGCA	2	10	2279301	2279310	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
197	NC_016801	TTCTA	2	10	2290768	2290777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_016801	CATCA	2	10	2308541	2308550	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
199	NC_016801	CACAT	2	10	2320995	2321004	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
200	NC_016801	GTTTG	2	10	2323301	2323310	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
201	NC_016801	GTTTT	2	10	2331678	2331687	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
202	NC_016801	AAAGC	2	10	2332003	2332012	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
203	NC_016801	AAACC	2	10	2357810	2357819	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
204	NC_016801	TGCCA	2	10	2378930	2378939	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
205	NC_016801	CTCCC	2	10	2381549	2381558	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
206	NC_016801	CACAC	2	10	2382389	2382398	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
207	NC_016801	TGACG	2	10	2382625	2382634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
208	NC_016801	CACGA	2	10	2382961	2382970	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
209	NC_016801	AAAAG	2	10	2386911	2386920	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
210	NC_016801	TGGGT	2	10	2389272	2389281	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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214	NC_016801	TCCTT	2	10	2437127	2437136	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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217	NC_016801	AGCCA	2	10	2451495	2451504	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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219	NC_016801	AAGGA	2	10	2492179	2492188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
220	NC_016801	GCACA	2	10	2493390	2493399	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.