MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae 31A chromosome

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016799	AGCGA	2	10	1943	1952	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016799	CACGG	2	10	72096	72105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016799	GATCA	2	10	74788	74797	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016799	ACTCC	2	10	74883	74892	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_016799	GGTTA	2	10	79714	79723	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016799	GCTCT	2	10	80468	80477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016799	GGCCT	2	10	85849	85858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016799	AAAAG	2	10	94387	94396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016799	GCCTA	2	10	108334	108343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016799	TCCAC	2	10	127993	128002	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016799	TGCAC	2	10	135834	135843	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016799	GAGGC	2	10	141158	141167	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016799	CTGTT	2	10	141303	141312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016799	TAATT	2	10	159661	159670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016799	TTAGC	2	10	161714	161723	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016799	ACGGA	2	10	180556	180565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016799	GAACA	2	10	183750	183759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016799	AATGG	2	10	195043	195052	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016799	CCGCC	2	10	256873	256882	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_016799	TTGGG	2	10	262335	262344	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016799	TTTGG	2	10	277085	277094	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016799	TAAAT	2	10	277197	277206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016799	CACGA	2	10	311119	311128	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016799	ATAAC	2	10	313283	313292	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016799	GAAAA	2	10	336549	336558	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016799	TTTGG	2	10	345877	345886	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016799	ATGTT	2	10	345961	345970	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016799	TCCTT	2	10	367830	367839	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016799	TGATG	2	10	369413	369422	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016799	GTGCT	2	10	429186	429195	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016799	CACAC	2	10	431668	431677	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016799	TCTGC	2	10	457001	457010	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016799	TATAA	2	10	488526	488535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016799	TGATG	2	10	507066	507075	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016799	TTTCC	2	10	514607	514616	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016799	CCATT	2	10	514737	514746	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016799	CAGTG	2	10	527879	527888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016799	TCTCA	2	10	538567	538576	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016799	AGGAA	2	10	543062	543071	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016799	AACCA	2	10	582176	582185	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016799	ACGAT	2	10	587681	587690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016799	TGGGG	2	10	596250	596259	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016799	TGATG	2	10	604522	604531	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016799	TTTTG	2	10	616148	616157	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016799	TGTCT	2	10	616167	616176	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016799	TGATC	2	10	620907	620916	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016799	CTTTC	2	10	640471	640480	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016799	TGAGC	2	10	651782	651791	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016799	AGCCA	2	10	659371	659380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016799	GGGGA	2	10	661683	661692	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016799	TTTTG	2	10	661884	661893	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016799	GCTGC	2	10	673631	673640	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016799	CCATA	2	10	703918	703927	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016799	GGGAA	2	10	705083	705092	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016799	CGACG	2	10	740455	740464	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016799	ATGCA	2	10	746837	746846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016799	AGCGC	2	10	776676	776685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016799	CAACT	2	10	781948	781957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016799	TCGTG	2	10	788935	788944	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016799	CGTCA	2	10	789271	789280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016799	GGGAG	2	10	790343	790352	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016799	TGGCA	2	10	792952	792961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016799	GGGGT	2	10	793295	793304	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016799	TAGTT	2	10	799060	799069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016799	ATGCG	2	10	800182	800191	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016799	TAGTG	2	10	828460	828469	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016799	CCTGT	2	10	838739	838748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016799	CTTTC	2	10	851447	851456	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016799	TGGGG	2	10	853937	853946	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016799	TGCTG	2	10	875912	875921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016799	TTTCC	2	10	889673	889682	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016799	GGAGG	2	10	891685	891694	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016799	TGCAA	2	10	922607	922616	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016799	ATTCG	2	10	922759	922768	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016799	GAAAG	2	10	924012	924021	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016799	TGGCG	2	10	932255	932264	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016799	CGGAA	2	10	989326	989335	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016799	TGGCT	2	10	1006159	1006168	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016799	TGCGG	2	10	1006515	1006524	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016799	GTGTC	2	10	1034641	1034650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016799	GAGAA	2	10	1052659	1052668	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016799	GCACT	2	10	1088759	1088768	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016799	GCCTC	2	10	1112907	1112916	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_016799	GATCG	2	10	1132959	1132968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016799	AACCT	2	10	1133700	1133709	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016799	GATTC	2	10	1139409	1139418	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016799	CACTA	2	10	1147597	1147606	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016799	ACACT	2	10	1169566	1169575	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016799	CTTGG	2	10	1182907	1182916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016799	CATTT	2	10	1192195	1192204	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016799	TCGTG	2	10	1198794	1198803	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016799	CGTCA	2	10	1199130	1199139	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016799	GGGAG	2	10	1200202	1200211	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016799	TGGCA	2	10	1202813	1202822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016799	TTTTC	2	10	1203016	1203025	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016799	AGGGA	2	10	1214916	1214925	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016799	TTCGT	2	10	1253992	1254001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016799	CCTAC	2	10	1257669	1257678	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_016799	TCTAC	2	10	1267917	1267926	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016799	CCTTA	2	10	1281591	1281600	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016799	TCAAG	2	10	1319272	1319281	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016799	AAGCC	2	10	1319599	1319608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016799	AAAAG	2	10	1327875	1327884	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016799	GCCAT	2	10	1340480	1340489	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016799	ACCGT	2	10	1340581	1340590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016799	CGACG	2	10	1361671	1361680	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_016799	CAAAT	2	10	1364666	1364675	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016799	AAAAT	2	10	1389247	1389256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016799	TTTAT	2	10	1424013	1424022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016799	AATGT	2	10	1435569	1435578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016799	AGCAA	2	10	1449963	1449972	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016799	GAACG	2	10	1450071	1450080	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016799	TCTCT	2	10	1450161	1450170	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016799	TGTTT	2	10	1462898	1462907	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016799	GCATT	2	10	1465607	1465616	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016799	AGAAT	2	10	1494587	1494596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016799	CGTAA	2	10	1494707	1494716	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016799	AGTGG	2	10	1504199	1504208	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016799	AATTG	2	10	1504263	1504272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016799	GCGCC	2	10	1504286	1504295	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_016799	CAGTA	2	10	1511530	1511539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016799	CAAAA	2	10	1516072	1516081	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016799	AAGTT	2	10	1572941	1572950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016799	GCAGC	2	10	1587081	1587090	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016799	GCAAG	2	10	1589814	1589823	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016799	AGACA	2	10	1596081	1596090	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016799	CCCCA	2	10	1613147	1613156	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_016799	AGCAC	2	10	1638832	1638841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_016799	AGCAA	2	10	1661147	1661156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016799	CTTTA	2	10	1663944	1663953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016799	ACCAA	2	10	1679432	1679441	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016799	CGTTT	2	10	1713383	1713392	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016799	CATCT	2	10	1725811	1725820	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016799	TTAGG	2	10	1727734	1727743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016799	GCAGC	2	10	1738047	1738056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016799	GAATC	2	10	1739175	1739184	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016799	ATCAC	2	10	1741897	1741906	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016799	AGAAA	2	10	1750563	1750572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016799	TTCAA	2	10	1775602	1775611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016799	CGTTG	2	10	1786032	1786041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016799	CTACC	2	10	1786044	1786053	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_016799	TTTCG	2	10	1792742	1792751	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016799	GTGTG	2	10	1830022	1830031	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016799	ATCTC	2	10	1830192	1830201	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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230	NC_016799	AATGA	2	10	2534596	2534605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.