MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	CAAAAA	2	12	6846	6857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016798	AAAAAT	2	12	61433	61444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016798	ATCTAG	2	12	77156	77167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016798	TTTTAG	2	12	116420	116431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016798	TAAAAA	2	12	121017	121028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016798	TTGGTA	2	12	121065	121076	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016798	AGGATC	2	12	121444	121455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016798	AGAAAA	2	12	183214	183225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016798	TATGAA	2	12	196984	196995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016798	TTTTAC	2	12	222993	223004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016798	AACCCT	2	12	256706	256717	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016798	TTTTTA	2	12	257502	257513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016798	AGGAGA	2	12	272603	272614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016798	ATATTA	2	12	281501	281512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016798	AAAAAG	2	12	325657	325668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016798	AGAATA	2	12	363132	363143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016798	TTTTAA	2	12	411290	411301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016798	CGGAAT	2	12	428846	428857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016798	TAACTA	2	12	504851	504862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016798	AAGAAA	2	12	504864	504875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016798	AGAATA	2	12	510839	510850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016798	AACTAA	2	12	516576	516587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016798	TCCCTC	2	12	550892	550903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016798	AAAAAT	2	12	568865	568876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016798	TAGGGG	2	12	608028	608039	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016798	TCTTTT	2	12	620024	620035	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016798	TTATTT	2	12	651235	651246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016798	TCTGCA	2	12	747709	747720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016798	TATTTT	2	12	757187	757198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016798	GAGAAA	2	12	804638	804649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016798	TTTTCT	2	12	807096	807107	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016798	ATTTTT	2	12	810875	810886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016798	TTTTTA	2	12	837313	837324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016798	TAAGGA	2	12	858276	858287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016798	CCGGAG	2	12	859194	859205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016798	CCTCTA	2	12	872340	872351	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016798	TAAGGA	2	12	880323	880334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016798	CCGGAG	2	12	881241	881252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016798	AAACAA	2	12	925358	925369	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016798	ATTTTT	2	12	1040727	1040738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016798	TAAAAT	2	12	1044282	1044293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.