MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 2963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016798	ACA	2	6	181634	181639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016798	TCTA	2	8	181675	181682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_016798	GAA	2	6	181754	181759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016798	ATT	2	6	181790	181795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016798	AATT	2	8	181809	181816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016798	TGT	2	6	181833	181838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016798	T	6	6	181937	181942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016798	TTGAA	2	10	181963	181972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016798	TTTG	2	8	181977	181984	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016798	ATC	2	6	182074	182079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016798	TGCA	2	8	182095	182102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_016798	TGT	2	6	182113	182118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016798	AGT	2	6	182132	182137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016798	CT	3	6	182177	182182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_016798	T	6	6	182182	182187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016798	CTC	2	6	182211	182216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_016798	GA	3	6	182256	182261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016798	GAT	2	6	182311	182316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016798	AAAG	2	8	182464	182471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016798	CA	3	6	182569	182574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_016798	ACA	2	6	182627	182632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_016798	CGA	2	6	182645	182650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016798	AAT	2	6	182671	182676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016798	ATT	2	6	182711	182716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016798	GTTT	2	8	182767	182774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016798	TTTGC	2	10	182839	182848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
527	NC_016798	CTT	2	6	182855	182860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016798	AGA	2	6	182935	182940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016798	TG	3	6	182968	182973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016798	AGGG	2	8	182974	182981	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016798	GA	3	6	183012	183017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016798	AGG	2	6	183040	183045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016798	AGA	2	6	183052	183057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016798	GAA	2	6	183065	183070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016798	AGA	3	9	183109	183117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016798	AGAAA	2	10	183151	183160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016798	AAGA	2	8	183172	183179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016798	T	8	8	183196	183203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016798	AGAAAA	2	12	183214	183225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016798	A	7	7	183222	183228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016798	TCG	2	6	183263	183268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016798	TGT	2	6	183275	183280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016798	T	6	6	183293	183298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016798	T	7	7	183300	183306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016798	AAG	2	6	183353	183358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016798	TCT	2	6	183401	183406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016798	AGG	2	6	183455	183460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016798	GGA	2	6	183489	183494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016798	TTGAG	2	10	183534	183543	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016798	GAATG	2	10	183559	183568	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016798	CT	3	6	183609	183614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_016798	TGA	2	6	183623	183628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016798	GA	4	8	183651	183658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016798	AAC	2	6	183706	183711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016798	TGA	2	6	183725	183730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016798	TGC	2	6	183761	183766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016798	CCAG	2	8	183781	183788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
558	NC_016798	TTG	2	6	183790	183795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016798	GAT	2	6	183829	183834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016798	GA	3	6	183855	183860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016798	GCG	2	6	183863	183868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016798	ACT	2	6	183911	183916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016798	TAG	2	6	183945	183950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016798	GCA	2	6	184000	184005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016798	TCGC	2	8	184043	184050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_016798	AGA	2	6	184054	184059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016798	GCA	2	6	184063	184068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016798	TA	3	6	184098	184103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016798	GAA	2	6	184133	184138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016798	AGA	2	6	184172	184177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016798	GA	3	6	184211	184216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016798	GTT	2	6	184228	184233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016798	GTT	2	6	184263	184268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016798	CTT	2	6	184271	184276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016798	GA	3	6	184314	184319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016798	GTT	2	6	184325	184330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016798	GAG	2	6	184346	184351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016798	GAA	2	6	184366	184371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016798	TTG	2	6	184377	184382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016798	AGG	2	6	184416	184421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016798	AAG	2	6	184511	184516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016798	TGA	2	6	184534	184539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016798	CAG	3	9	184607	184615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016798	GTA	2	6	184650	184655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016798	GTTG	2	8	184690	184697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016798	GGA	3	9	184705	184713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016798	TC	3	6	184721	184726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_016798	ATT	2	6	184740	184745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016798	A	7	7	184770	184776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016798	T	8	8	184782	184789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016798	ATA	2	6	184832	184837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016798	A	6	6	184837	184842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016798	TAT	2	6	184913	184918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016798	GA	3	6	184953	184958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016798	GTT	3	9	186675	186683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016798	T	6	6	186689	186694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016798	T	7	7	186697	186703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016798	T	7	7	186709	186715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016798	T	7	7	186759	186765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016798	A	7	7	186781	186787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016798	T	6	6	186804	186809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016798	ATC	2	6	188493	188498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016798	CGATA	2	10	188521	188530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
604	NC_016798	T	6	6	188534	188539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016798	TAT	2	6	188848	188853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016798	T	6	6	188867	188872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016798	GCA	2	6	188920	188925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_016798	CTT	2	6	188935	188940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016798	GGAC	2	8	188962	188969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_016798	AAG	2	6	189072	189077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016798	TTG	2	6	189094	189099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016798	CAT	2	6	189104	189109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_016798	TCC	2	6	189805	189810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_016798	CAG	2	6	189813	189818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016798	A	6	6	189832	189837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016798	AGA	2	6	189847	189852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016798	GAA	2	6	189853	189858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016798	GGA	2	6	189859	189864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016798	CTT	2	6	189867	189872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016798	AGA	2	6	189928	189933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016798	TAAA	2	8	189981	189988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016798	AT	3	6	194368	194373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016798	TGT	2	6	194382	194387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016798	ATGC	2	8	194742	194749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_016798	GTT	2	6	194750	194755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016798	GCA	2	6	194803	194808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016798	CTTT	2	8	194883	194890	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_016798	AAG	2	6	194930	194935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016798	T	6	6	194980	194985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016798	ATT	2	6	194993	194998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016798	T	6	6	195009	195014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016798	AAAC	2	8	196245	196252	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_016798	GGC	2	6	196310	196315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016798	AGG	2	6	196331	196336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016798	AAG	2	6	196485	196490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016798	TA	3	6	196503	196508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016798	CTA	2	6	196510	196515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_016798	GT	3	6	196578	196583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_016798	GA	3	6	196759	196764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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