MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	TATTAA	2	12	11447	11458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	AAAGGC	2	12	49291	49302	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016791	TTTTAT	2	12	49327	49338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016791	ATGATA	2	12	71040	71051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016791	AGTTTA	2	12	73251	73262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016791	ATTTTT	2	12	87465	87476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016791	TATTGT	2	12	118342	118353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016791	GAAGGA	2	12	169431	169442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016791	GACTAT	2	12	176231	176242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016791	AGCTTT	2	12	197686	197697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016791	ACTTTT	2	12	205864	205875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016791	ATTTAA	2	12	237393	237404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016791	AGTTTA	2	12	250602	250613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016791	TTTTAT	2	12	271965	271976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016791	AGTTAT	2	12	276237	276248	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016791	TAAAAA	2	12	276280	276291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016791	TTATAG	2	12	299512	299523	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016791	ACATTA	2	12	316226	316237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016791	CTTACA	2	12	321756	321767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016791	TTTTAT	2	12	415198	415209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016791	ATGGTT	2	12	440553	440564	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016791	TAATTT	2	12	470131	470142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016791	ATAAAA	2	12	584309	584320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016791	CATTTT	2	12	630818	630829	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016791	CAATAT	2	12	658603	658614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016791	TGATAA	2	12	659182	659193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016791	AGAAAA	2	12	671145	671156	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016791	AACATT	2	12	680402	680413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016791	ATTTGT	2	12	681707	681718	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016791	TACAAT	2	12	728913	728924	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016791	AACAAT	2	12	737605	737616	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016791	TACAAT	2	12	784804	784815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016791	AAAAGG	2	12	847930	847941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016791	ATATGG	2	12	953126	953137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016791	TTACTT	2	12	964002	964013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016791	GAATAT	2	12	1057784	1057795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016791	TATTGG	2	12	1071743	1071754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016791	TTCTTT	2	12	1113396	1113407	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016791	ATAACT	2	12	1160020	1160031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016791	TAAAAG	2	12	1161783	1161794	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016791	ATTTAA	2	12	1162282	1162293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016791	ATAAAA	2	12	1205933	1205944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016791	TAATAT	2	12	1226559	1226570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016791	TAAAGT	2	12	1243091	1243102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016791	AGGCAT	2	12	1247791	1247802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016791	CAAGCA	2	12	1266301	1266312	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016791	AATAAA	2	12	1287047	1287058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016791	TTTAAA	2	12	1316357	1316368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016791	TAATAT	2	12	1332347	1332358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016791	GTGAAT	2	12	1342104	1342115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016791	ATTATA	2	12	1362845	1362856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016791	AAAAAT	2	12	1379304	1379315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016791	ATTGGA	2	12	1383018	1383029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016791	TAAAAT	2	12	1390031	1390042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016791	ATAAAT	2	12	1423025	1423036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016791	GAAATT	2	12	1442087	1442098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016791	GTTATC	2	12	1451410	1451421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016791	AATATT	2	12	1508396	1508407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016791	TATAAT	2	12	1545033	1545044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016791	ATGTTT	2	12	1567570	1567581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016791	ATTTAC	2	12	1567829	1567840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016791	GAAAAA	2	12	1571967	1571978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016791	TAGTAT	2	12	1577943	1577954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016791	TACAGA	2	12	1586249	1586260	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016791	CAGGAT	2	12	1615186	1615197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016791	TAGTTA	2	12	1650846	1650857	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016791	CATTAA	2	12	1818747	1818758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016791	AAGTAA	2	12	1863746	1863757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016791	CTAATA	2	12	1905158	1905169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016791	TATCAT	2	12	1905659	1905670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016791	TTGTAT	2	12	1929499	1929510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016791	TTTGTT	2	12	1945653	1945664	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016791	AAATTT	2	12	1972859	1972870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016791	CATATA	2	12	1999458	1999469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016791	TAAAAA	2	12	2006777	2006788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016791	ATTTAT	2	12	2018317	2018328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016791	CTAATA	2	12	2039430	2039441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016791	AAAAAT	2	12	2046622	2046633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016791	AGTATA	2	12	2059360	2059371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016791	CTTATA	2	12	2119548	2119559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016791	TAAATA	2	12	2128281	2128292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016791	ACAGAA	2	12	2153203	2153214	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016791	TTTTGT	2	12	2203716	2203727	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016791	AGGTTT	2	12	2216453	2216464	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016791	GTATCT	2	12	2280926	2280937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_016791	TAAAAA	2	12	2294301	2294312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016791	CTTTTT	2	12	2296492	2296503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016791	TAGAAA	2	12	2296742	2296753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016791	AATTTT	2	12	2308082	2308093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016791	AATATT	2	12	2316068	2316079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016791	TATCAA	2	12	2364956	2364967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016791	TTTTGC	2	12	2492269	2492280	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016791	ATCCTG	2	12	2495392	2495403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016791	TTTATA	2	12	2502051	2502062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016791	GTTTTT	2	12	2524707	2524718	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016791	CTTTTA	2	12	2543764	2543775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016791	TAAAAA	2	12	2544092	2544103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016791	ATTTAT	2	12	2557849	2557860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016791	ATCATA	2	12	2559286	2559297	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016791	AGGTGA	2	12	2577296	2577307	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016791	TTTTTA	2	12	2596723	2596734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016791	TTTATT	2	12	2630940	2630951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016791	ATTTAA	2	12	2660048	2660059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016791	ATTTTT	2	12	2722752	2722763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016791	GTATAT	2	12	2772026	2772037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016791	TCCGGC	2	12	2778283	2778294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016791	CGAAGC	2	12	2786020	2786031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016791	AAATAT	2	12	2809019	2809030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016791	CTTTTA	2	12	2820322	2820333	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016791	ATTTTA	2	12	2840435	2840446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016791	ACCCGA	2	12	2871101	2871112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016791	TGTTTT	2	12	2912881	2912892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016791	TATATT	2	12	2919696	2919707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016791	GTTAAT	2	12	2919710	2919721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016791	AAGGTT	2	12	2953166	2953177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016791	TTGTAA	2	12	2968587	2968598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016791	AACATA	2	12	3049342	3049353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016791	TTATAT	2	12	3078336	3078347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016791	TTTCCT	2	12	3102282	3102293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016791	CCAATA	2	12	3145339	3145350	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016791	TTATAA	2	12	3237460	3237471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016791	GTTTTC	2	12	3247645	3247656	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016791	ATTTCA	2	12	3251615	3251626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016791	GTATAA	2	12	3252707	3252718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016791	CAATAA	2	12	3252975	3252986	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016791	TAAATA	2	12	3265508	3265519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016791	TTATAT	2	12	3290310	3290321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016791	TATATT	2	12	3292831	3292842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016791	TAAAAA	2	12	3292895	3292906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.