MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	ATATT	2	10	8607	8616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	GATTT	2	10	10582	10591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016791	AAATA	2	10	13492	13501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016791	AACAA	2	10	22913	22922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016791	TTTTA	2	10	24738	24747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016791	ATATT	2	10	45837	45846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016791	ATATT	2	10	49189	49198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016791	GGTTT	2	10	51243	51252	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016791	ATTTT	2	10	51933	51942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016791	TTTTA	2	10	53720	53729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016791	AATAA	2	10	60425	60434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016791	TAAAC	2	10	69447	69456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016791	TAAAT	2	10	73293	73302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016791	ATATT	2	10	75728	75737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016791	GATAA	2	10	75791	75800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016791	TAATA	2	10	83467	83476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016791	AATAG	2	10	83505	83514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016791	CAATT	2	10	117659	117668	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016791	AAATT	2	10	118282	118291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016791	TTTTA	2	10	123701	123710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016791	AAACC	2	10	170891	170900	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016791	TTAAT	2	10	184813	184822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016791	ATTGG	2	10	186917	186926	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016791	AGGAT	2	10	211322	211331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016791	TTGGA	2	10	212699	212708	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016791	TTAAT	2	10	212781	212790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016791	ATTCA	2	10	215897	215906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016791	TTTTA	2	10	215922	215931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016791	TGAAA	2	10	233000	233009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016791	TAAAA	2	10	252323	252332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016791	TACAA	2	10	260375	260384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016791	AAAAT	2	10	262074	262083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016791	AATTT	2	10	268890	268899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016791	TAATA	2	10	271979	271988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016791	ATTTT	2	10	279064	279073	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016791	TAAAA	2	10	279143	279152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016791	ATATA	2	10	281370	281379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016791	AAAAC	2	10	282557	282566	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016791	TAACA	2	10	282754	282763	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016791	AAAAT	2	10	282821	282830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016791	TGTTT	2	10	284619	284628	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016791	TAAAA	2	10	286816	286825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016791	AAGCT	2	10	295744	295753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016791	ATTAA	2	10	295778	295787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016791	ATAAC	2	10	321462	321471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016791	TGGTA	2	10	336098	336107	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016791	TAATT	2	10	338309	338318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016791	TATAT	2	10	339507	339516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016791	TAATT	2	10	353600	353609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016791	TTAGT	2	10	374720	374729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016791	TAAGG	2	10	387328	387337	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016791	AACAT	2	10	390962	390971	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016791	TTTTG	2	10	398724	398733	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016791	ATTAT	2	10	420039	420048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016791	AAATA	2	10	433774	433783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016791	TAATA	2	10	444076	444085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016791	TGAAA	2	10	446537	446546	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016791	TGATA	2	10	463399	463408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016791	ACAAT	2	10	470746	470755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016791	TCGTG	2	10	476977	476986	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016791	AAGCT	2	10	477162	477171	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016791	CCAAA	2	10	478508	478517	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016791	GGGAG	2	10	478770	478779	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016791	AAGTA	2	10	481581	481590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016791	ATTAG	2	10	492933	492942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016791	ATTGT	2	10	494460	494469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016791	AAATA	2	10	498742	498751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016791	TAAAT	2	10	502952	502961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016791	TAATA	2	10	507077	507086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016791	AAAGG	2	10	507529	507538	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016791	ATAAA	2	10	508815	508824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016791	GTATT	2	10	526122	526131	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016791	GAAAT	2	10	528744	528753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016791	ATAAA	2	10	574062	574071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016791	TAATA	2	10	581296	581305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016791	ATAAA	2	10	581805	581814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016791	AAATA	2	10	583138	583147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016791	ATAAC	2	10	589099	589108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016791	ATTTT	2	10	590755	590764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016791	AATGC	2	10	592313	592322	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016791	TTTAT	2	10	597101	597110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016791	CGAGC	2	10	620723	620732	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016791	GGAAA	2	10	620947	620956	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016791	CAAAC	2	10	626289	626298	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016791	ATAGT	2	10	626700	626709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016791	TATAA	2	10	630651	630660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016791	ATTTT	2	10	637349	637358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016791	ACTTT	2	10	638883	638892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016791	ACAGT	2	10	658634	658643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016791	AAATA	2	10	672851	672860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016791	GAAAA	2	10	673119	673128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016791	AAAAT	2	10	673141	673150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016791	TCAAT	2	10	673263	673272	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016791	TGTTT	2	10	683911	683920	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016791	ATTAT	2	10	688426	688435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016791	TTAAT	2	10	704633	704642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016791	TATGT	2	10	704669	704678	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016791	ATTTT	2	10	706917	706926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016791	AAGTA	2	10	715648	715657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016791	AATAT	2	10	715894	715903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016791	AAATT	2	10	742592	742601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016791	TAATT	2	10	747278	747287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016791	TATTG	2	10	755617	755626	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016791	TTTAA	2	10	756124	756133	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016791	ATAGT	2	10	778878	778887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016791	TAAAA	2	10	789157	789166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016791	TATAA	2	10	790228	790237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016791	ATTTA	2	10	792205	792214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016791	ATTAT	2	10	804755	804764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016791	GCATC	2	10	806633	806642	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016791	TAATA	2	10	807745	807754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016791	TTATG	2	10	829698	829707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016791	GTTAT	2	10	831911	831920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016791	TATAA	2	10	856585	856594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016791	AATAA	2	10	863777	863786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016791	ATTTA	2	10	866205	866214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016791	TTTAA	2	10	866271	866280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016791	ATTTT	2	10	873397	873406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016791	GACCA	2	10	876299	876308	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_016791	ATTAA	2	10	881338	881347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016791	TATTT	2	10	888661	888670	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016791	TTACG	2	10	901086	901095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016791	AAAAT	2	10	908660	908669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016791	AAAAG	2	10	913259	913268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016791	ATAAA	2	10	918356	918365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016791	TATTT	2	10	918388	918397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016791	CAAAA	2	10	918565	918574	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016791	ATCAT	2	10	918619	918628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016791	ATTAT	2	10	922140	922149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016791	TGATT	2	10	922257	922266	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016791	TTATA	2	10	924436	924445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016791	TAAAT	2	10	925807	925816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016791	TAAAC	2	10	925868	925877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016791	TCGTG	2	10	927363	927372	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016791	AAGCT	2	10	927548	927557	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016791	CCAAA	2	10	928774	928783	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016791	GGGAG	2	10	929036	929045	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016791	TTAGA	2	10	933852	933861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016791	GCGAA	2	10	953204	953213	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016791	GTAAA	2	10	953292	953301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016791	AGAGA	2	10	953757	953766	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016791	TAAGA	2	10	954271	954280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016791	AAACT	2	10	954984	954993	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016791	CAAAT	2	10	958093	958102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016791	AATTA	2	10	959878	959887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016791	TAAGA	2	10	959930	959939	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_016791	TAATG	2	10	982861	982870	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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