MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 14862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016791	TCT	2	6	481348	481353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_016791	TAA	2	6	481395	481400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016791	TCT	2	6	481402	481407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_016791	ATA	2	6	481475	481480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016791	T	7	7	481554	481560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016791	A	7	7	481569	481575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016791	AAGTA	2	10	481581	481590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016791	AT	3	6	481594	481599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016791	A	6	6	481621	481626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016791	GTA	2	6	481630	481635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016791	TGT	2	6	481646	481651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016791	TA	3	6	481828	481833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016791	TTG	2	6	481873	481878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016791	GAG	2	6	481901	481906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016791	TAA	2	6	482243	482248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016791	TAG	3	9	482278	482286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016791	AGG	2	6	482321	482326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016791	GGA	2	6	482984	482989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016791	GGC	2	6	484898	484903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_016791	GGA	2	6	484908	484913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016791	T	6	6	485210	485215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016791	AGG	2	6	485244	485249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016791	AGG	2	6	485741	485746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016791	AGG	2	6	487155	487160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016791	AGG	2	6	487458	487463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016791	GGC	2	6	487847	487852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1528	NC_016791	AGG	2	6	488990	488995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016791	ATTAG	2	10	492933	492942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016791	ATTGT	2	10	494460	494469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016791	TAT	2	6	494849	494854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016791	GGA	2	6	494864	494869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016791	TA	3	6	495098	495103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016791	TAT	2	6	495112	495117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016791	TTA	2	6	495118	495123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016791	T	7	7	495160	495166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016791	TTA	2	6	495168	495173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_016791	TTTA	2	8	495324	495331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016791	AAG	2	6	495350	495355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016791	TTG	2	6	495392	495397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1543	NC_016791	GCA	2	6	495504	495509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_016791	GTAA	2	8	495527	495534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016791	AGG	2	6	495910	495915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1547	NC_016791	ATT	2	6	497027	497032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1550	NC_016791	AGGG	2	8	497094	497101	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016791	TA	3	6	498080	498085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016791	AGG	2	6	498106	498111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016791	AT	3	6	498668	498673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016791	ATT	2	6	498681	498686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016791	TA	3	6	498727	498732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016791	AAATA	2	10	498742	498751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_016791	GTG	2	6	500335	500340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016791	TAT	2	6	500386	500391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016791	A	6	6	502878	502883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016791	ACGA	2	8	502892	502899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1568	NC_016791	AG	3	6	502935	502940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016791	GA	3	6	502946	502951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016791	TAAAT	2	10	502952	502961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1575	NC_016791	AGG	2	6	503084	503089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_016791	TCCT	2	8	504130	504137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1591	NC_016791	CAA	2	6	504446	504451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_016791	TAA	2	6	504506	504511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016791	TCT	2	6	504566	504571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_016791	TTG	2	6	505142	505147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_016791	GAG	2	6	513607	513612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016791	A	6	6	513613	513618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016791	AGGA	2	8	518485	518492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016791	AAG	2	6	521395	521400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_016791	ATA	3	9	521463	521471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_016791	CA	4	8	521495	521502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_016791	TA	3	6	521507	521512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016791	TTA	2	6	521528	521533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016791	TTAA	2	8	521565	521572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016791	TA	3	6	522896	522901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016791	TAA	2	6	526103	526108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016791	GTATT	2	10	526122	526131	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016791	GAAAT	2	10	528744	528753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016791	TAT	2	6	528777	528782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_016791	AT	3	6	535943	535948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_016791	T	6	6	559135	559140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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