MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 14862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016791	AAGG	2	8	1814691	1814698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016791	CGAC	2	8	1814699	1814706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_016791	GGT	2	6	1814723	1814728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016791	AGG	2	6	1814742	1814747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016791	CTA	2	6	1814796	1814801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_016791	AGT	2	6	1815033	1815038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016791	GCGA	2	8	1815040	1815047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_016791	CCAAA	2	10	1815060	1815069	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5509	NC_016791	AGC	2	6	1815131	1815136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_016791	AGGC	2	8	1815187	1815194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_016791	ACC	2	6	1815246	1815251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_016791	GGGAG	2	10	1815322	1815331	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016791	GCA	2	6	1815428	1815433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_016791	GGA	2	6	1815561	1815566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_016791	ATG	2	6	1815763	1815768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016791	GA	3	6	1815789	1815794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_016791	AGC	2	6	1815906	1815911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_016791	TAAA	2	8	1816025	1816032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_016791	AAG	2	6	1816035	1816040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016791	AGT	2	6	1816128	1816133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_016791	GGT	2	6	1816148	1816153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_016791	TGT	2	6	1816166	1816171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016791	AGT	2	6	1816209	1816214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_016791	ACA	2	6	1816346	1816351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_016791	TAC	2	6	1816366	1816371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_016791	GA	3	6	1816385	1816390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016791	AGG	2	6	1816402	1816407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016791	CCG	2	6	1816470	1816475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_016791	AGGT	2	8	1816587	1816594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_016791	GAG	2	6	1816595	1816600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_016791	GTT	2	6	1816627	1816632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_016791	CGG	2	6	1816844	1816849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_016791	CAA	2	6	1816938	1816943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_016791	GTA	2	6	1816960	1816965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_016791	T	6	6	1817046	1817051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016791	GTG	2	6	1817078	1817083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_016791	GCCA	2	8	1817086	1817093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_016791	GA	4	8	1817293	1817300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_016791	GGT	2	6	1817338	1817343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_016791	CGT	2	6	1817534	1817539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_016791	CTGA	2	8	1817807	1817814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_016791	GA	3	6	1817887	1817892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016791	TCT	2	6	1817901	1817906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_016791	A	7	7	1817951	1817957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016791	TAA	2	6	1817960	1817965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016791	AGT	2	6	1817980	1817985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016791	TCT	2	6	1818013	1818018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_016791	ATA	2	6	1818086	1818091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_016791	TTA	2	6	1818171	1818176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_016791	CAAA	2	8	1818194	1818201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_016791	C	6	6	1818202	1818207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5552	NC_016791	CGT	2	6	1818209	1818214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_016791	G	6	6	1818222	1818227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016791	AT	3	6	1818242	1818247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_016791	TCC	2	6	1818735	1818740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_016791	CATTAA	2	12	1818747	1818758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5557	NC_016791	T	6	6	1819542	1819547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_016791	AAT	2	6	1820460	1820465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_016791	A	6	6	1820472	1820477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016791	CCG	2	6	1820489	1820494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_016791	TAA	2	6	1820514	1820519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_016791	CCA	2	6	1820545	1820550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_016791	ATG	2	6	1820559	1820564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_016791	A	6	6	1820689	1820694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_016791	AT	3	6	1820711	1820716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_016791	T	7	7	1820719	1820725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_016791	TAA	2	6	1820729	1820734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_016791	T	7	7	1820757	1820763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_016791	TATAT	2	10	1820776	1820785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_016791	A	6	6	1822539	1822544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_016791	TCC	2	6	1823951	1823956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_016791	TTG	2	6	1823997	1824002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5574	NC_016791	TATG	2	8	1824070	1824077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016791	AAT	2	6	1824080	1824085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016791	TTTAT	2	10	1824126	1824135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_016791	TTAT	2	8	1824155	1824162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_016791	ATA	3	9	1824174	1824182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_016791	GAA	2	6	1824183	1824188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_016791	TAAT	2	8	1825233	1825240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_016791	ATA	2	6	1826383	1826388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_016791	TAAA	2	8	1826403	1826410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_016791	AGG	2	6	1826419	1826424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_016791	TAAT	2	8	1826728	1826735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_016791	TATAT	2	10	1826792	1826801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_016791	A	6	6	1827232	1827237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_016791	G	7	7	1827288	1827294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_016791	T	6	6	1827520	1827525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_016791	T	6	6	1827556	1827561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_016791	AGG	2	6	1827568	1827573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5593	NC_016791	ATTA	2	8	1829552	1829559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_016791	TTAT	2	8	1829593	1829600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_016791	T	6	6	1829609	1829614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_016791	TA	3	6	1829621	1829626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_016791	TAC	2	6	1829659	1829664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5599	NC_016791	T	7	7	1832010	1832016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_016791	GTT	2	6	1832065	1832070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_016791	C	6	6	1832376	1832381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5602	NC_016791	ATT	2	6	1832400	1832405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_016791	TA	3	6	1832428	1832433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_016791	AAATA	2	10	1832466	1832475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_016791	TAA	2	6	1832505	1832510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016791	ATA	2	6	1832514	1832519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016791	ATT	2	6	1832524	1832529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_016791	A	6	6	1832534	1832539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_016791	T	6	6	1832556	1832561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_016791	AT	3	6	1832605	1832610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_016791	AT	3	6	1832615	1832620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_016791	AGG	2	6	1832645	1832650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5614	NC_016791	TTA	2	6	1833037	1833042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_016791	ATT	2	6	1833048	1833053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_016791	A	6	6	1833054	1833059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_016791	ATT	2	6	1833065	1833070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_016791	AAT	3	9	1833071	1833079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_016791	AAAT	2	8	1833115	1833122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_016791	AGG	2	6	1835017	1835022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_016791	T	7	7	1836151	1836157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_016791	ATA	2	6	1836191	1836196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_016791	ATT	2	6	1836200	1836205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_016791	TAT	2	6	1836215	1836220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_016791	TA	4	8	1836257	1836264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_016791	GAG	2	6	1836424	1836429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5628	NC_016791	T	8	8	1836539	1836546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_016791	T	6	6	1836744	1836749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_016791	TCAAA	2	10	1836759	1836768	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5631	NC_016791	ATTA	2	8	1836774	1836781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_016791	GGA	2	6	1836845	1836850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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