MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 14862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016791	ATGT	2	8	1563734	1563741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016791	CATG	2	8	1563751	1563758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_016791	GCT	2	6	1563790	1563795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_016791	GCA	2	6	1563847	1563852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_016791	GAA	2	6	1563908	1563913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016791	GGT	2	6	1564023	1564028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_016791	ACA	2	6	1564064	1564069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_016791	GACA	2	8	1564093	1564100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_016791	AAT	2	6	1564138	1564143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016791	TAT	2	6	1564157	1564162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_016791	TGT	2	6	1564321	1564326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016791	CTA	2	6	1564365	1564370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_016791	ATA	2	6	1564371	1564376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_016791	A	6	6	1564418	1564423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016791	ATA	2	6	1564449	1564454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016791	ACA	2	6	1564510	1564515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_016791	ATT	2	6	1564520	1564525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_016791	AAT	2	6	1564531	1564536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_016791	GGC	2	6	1564553	1564558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_016791	TAT	2	6	1564564	1564569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016791	ATA	2	6	1564587	1564592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016791	TCT	2	6	1564630	1564635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_016791	A	7	7	1564723	1564729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_016791	ATAA	2	8	1564755	1564762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_016791	A	6	6	1564781	1564786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_016791	T	6	6	1564816	1564821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016791	AAT	2	6	1564854	1564859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016791	AAT	2	6	1564865	1564870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_016791	TAA	2	6	1564876	1564881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_016791	GAAG	2	8	1564889	1564896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016791	ATT	2	6	1564898	1564903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016791	AG	3	6	1565900	1565905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_016791	TTTAA	2	10	1566341	1566350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_016791	A	6	6	1566378	1566383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_016791	TAAT	2	8	1566461	1566468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_016791	AAT	2	6	1566503	1566508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_016791	A	6	6	1566510	1566515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_016791	GGT	2	6	1566516	1566521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016791	T	6	6	1567179	1567184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_016791	GTA	2	6	1567220	1567225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_016791	TAA	2	6	1567259	1567264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016791	ATGTTT	2	12	1567570	1567581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016791	T	7	7	1567668	1567674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016791	TTA	2	6	1567721	1567726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016791	A	6	6	1567729	1567734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_016791	TAATA	2	10	1567794	1567803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_016791	ATTTAC	2	12	1567829	1567840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4548	NC_016791	AG	3	6	1567861	1567866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_016791	CTTT	2	8	1567897	1567904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_016791	CCT	2	6	1567932	1567937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_016791	TAT	2	6	1567958	1567963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_016791	A	6	6	1568053	1568058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_016791	GTA	2	6	1568123	1568128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016791	AATG	2	8	1568138	1568145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016791	TTG	2	6	1568159	1568164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016791	TTA	2	6	1568182	1568187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016791	A	6	6	1568200	1568205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_016791	AGA	2	6	1568241	1568246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_016791	CCA	2	6	1569119	1569124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_016791	TA	3	6	1569146	1569151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_016791	GAT	2	6	1569206	1569211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_016791	TGA	2	6	1569239	1569244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_016791	TC	3	6	1570602	1570607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_016791	CAGC	2	8	1570954	1570961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_016791	GCTG	2	8	1570972	1570979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_016791	TAA	2	6	1570981	1570986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016791	TAT	2	6	1570991	1570996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016791	TAA	2	6	1571042	1571047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_016791	GGA	2	6	1571124	1571129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_016791	ATC	2	6	1571155	1571160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_016791	TAT	2	6	1571175	1571180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016791	CTG	2	6	1571205	1571210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_016791	AGC	2	6	1571284	1571289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_016791	TGT	2	6	1571305	1571310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_016791	CAA	2	6	1571316	1571321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_016791	TTC	2	6	1571350	1571355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_016791	TAGT	2	8	1571370	1571377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016791	TTC	2	6	1571416	1571421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_016791	TAT	2	6	1571490	1571495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016791	TAAA	2	8	1571527	1571534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016791	ATT	2	6	1571555	1571560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016791	TAT	2	6	1571588	1571593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016791	TAA	2	6	1571626	1571631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016791	AGG	2	6	1571640	1571645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016791	TG	3	6	1571693	1571698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016791	A	6	6	1571713	1571718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_016791	TGC	2	6	1571770	1571775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_016791	ATAGT	2	10	1571824	1571833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016791	TGA	3	9	1571924	1571932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4591	NC_016791	A	7	7	1572014	1572020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016791	TTGG	2	8	1572122	1572129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_016791	A	8	8	1572155	1572162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_016791	GAA	2	6	1572275	1572280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_016791	TGA	2	6	1572415	1572420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_016791	AGA	2	6	1572421	1572426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_016791	ATGGA	2	10	1572429	1572438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016791	AAT	2	6	1572524	1572529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_016791	TGA	2	6	1572541	1572546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016791	GTA	2	6	1572579	1572584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016791	TA	3	6	1572587	1572592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_016791	TAGAA	2	10	1572610	1572619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_016791	GC	3	6	1573381	1573386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_016791	TA	4	8	1573418	1573425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_016791	AT	3	6	1573476	1573481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016791	TAT	2	6	1573484	1573489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4608	NC_016791	TAA	2	6	1573520	1573525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016791	TAATT	2	10	1573696	1573705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_016791	ATT	2	6	1573750	1573755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016791	T	6	6	1573777	1573782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_016791	CCA	2	6	1573923	1573928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_016791	TATT	2	8	1573939	1573946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_016791	AAC	2	6	1573981	1573986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_016791	TAAG	2	8	1573989	1573996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_016791	TA	4	8	1574030	1574037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016791	TAA	2	6	1574111	1574116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_016791	AGA	2	6	1574117	1574122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016791	CAA	2	6	1574130	1574135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_016791	T	6	6	1574195	1574200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016791	ACG	2	6	1574222	1574227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016791	ACT	2	6	1574707	1574712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_016791	ATAA	2	8	1574762	1574769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_016791	AT	3	6	1574813	1574818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_016791	ATTA	2	8	1575048	1575055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_016791	A	6	6	1575087	1575092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_016791	TAT	2	6	1575160	1575165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016791	T	6	6	1575516	1575521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_016791	GTA	2	6	1575613	1575618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_016791	T	6	6	1575921	1575926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_016791	ATT	2	6	1575938	1575943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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