MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 5320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016790	TG	3	6	1162857	1162862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016790	TAAT	2	8	1164025	1164032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016790	CGC	2	6	1164046	1164051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_016790	CAA	2	6	1164210	1164215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_016790	TTA	2	6	1164223	1164228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016790	TAA	2	6	1164242	1164247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016790	TTG	2	6	1164255	1164260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016790	TC	3	6	1165203	1165208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_016790	CGG	2	6	1165298	1165303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_016790	TTCGT	2	10	1165508	1165517	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2511	NC_016790	GCC	2	6	1165662	1165667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_016790	TC	3	6	1165706	1165711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2513	NC_016790	GAA	2	6	1165720	1165725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_016790	TCC	2	6	1166220	1166225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_016790	CTC	2	6	1167071	1167076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_016790	GAG	2	6	1168486	1168491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_016790	AGC	2	6	1168503	1168508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_016790	A	6	6	1168561	1168566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016790	GCT	2	6	1168617	1168622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_016790	CCTAC	2	10	1169186	1169195	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2521	NC_016790	GC	3	6	1172876	1172881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_016790	ATG	2	6	1173148	1173153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016790	TTG	2	6	1173201	1173206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016790	ACT	2	6	1173217	1173222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_016790	ATT	2	6	1176613	1176618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_016790	TTG	2	6	1178136	1178141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_016790	CA	3	6	1181391	1181396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_016790	TGA	2	6	1184253	1184258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_016790	TGG	2	6	1184263	1184268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_016790	AGC	2	6	1184807	1184812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_016790	TGC	2	6	1184831	1184836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_016790	AT	3	6	1185998	1186003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_016790	CTTT	2	8	1186306	1186313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_016790	TTA	2	6	1187333	1187338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_016790	TTA	2	6	1190023	1190028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_016790	CCTTA	2	10	1193111	1193120	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2537	NC_016790	T	6	6	1193169	1193174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_016790	TAA	2	6	1198524	1198529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_016790	TGT	2	6	1200172	1200177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_016790	AGTG	2	8	1200178	1200185	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_016790	TAAT	2	8	1200238	1200245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_016790	CTG	2	6	1200265	1200270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_016790	TTAG	2	8	1200271	1200278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_016790	AAAAAC	2	12	1200316	1200327	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2545	NC_016790	TGG	2	6	1200342	1200347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016790	GAT	2	6	1200409	1200414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_016790	CGA	2	6	1201796	1201801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_016790	CTTC	2	8	1201849	1201856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_016790	TAGT	2	8	1201988	1201995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_016790	ATTT	2	8	1202075	1202082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_016790	A	6	6	1202085	1202090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_016790	ACCT	2	8	1202998	1203005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_016790	CTG	2	6	1209384	1209389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_016790	GCA	2	6	1209392	1209397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_016790	GAA	2	6	1210383	1210388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_016790	CT	3	6	1210406	1210411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_016790	CA	3	6	1211450	1211455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_016790	GTT	2	6	1212604	1212609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016790	AGCT	2	8	1212690	1212697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2560	NC_016790	ATT	2	6	1212746	1212751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_016790	CAG	3	9	1213602	1213610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_016790	ACT	2	6	1213624	1213629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_016790	AATC	2	8	1213641	1213648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_016790	ACT	2	6	1213665	1213670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_016790	CTA	2	6	1213797	1213802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_016790	C	6	6	1213823	1213828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2567	NC_016790	AG	3	6	1213843	1213848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_016790	CT	3	6	1213868	1213873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2569	NC_016790	GT	3	6	1213929	1213934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_016790	GTC	2	6	1213946	1213951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_016790	TCC	2	6	1215416	1215421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2572	NC_016790	TCCG	2	8	1215427	1215434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_016790	CG	3	6	1215482	1215487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_016790	GCA	2	6	1215489	1215494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_016790	ATA	2	6	1215561	1215566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_016790	GAC	2	6	1215600	1215605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_016790	GGCG	2	8	1215620	1215627	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_016790	ACT	2	6	1215658	1215663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_016790	TC	3	6	1215679	1215684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_016790	TAC	2	6	1215690	1215695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_016790	CTG	2	6	1215743	1215748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_016790	CTC	2	6	1215791	1215796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2583	NC_016790	TAA	2	6	1215823	1215828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_016790	GCG	2	6	1215830	1215835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_016790	GAA	2	6	1215881	1215886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_016790	AAG	2	6	1215912	1215917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_016790	TG	3	6	1215969	1215974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_016790	AAG	2	6	1217366	1217371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016790	AAC	2	6	1222782	1222787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_016790	TGCC	2	8	1224205	1224212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2591	NC_016790	GGCA	2	8	1224248	1224255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2592	NC_016790	CAT	2	6	1226975	1226980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2594	NC_016790	ATTT	2	8	1227041	1227048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_016790	AGA	2	6	1227052	1227057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_016790	GAA	2	6	1227174	1227179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_016790	CCG	2	6	1227201	1227206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_016790	CGA	2	6	1227210	1227215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_016790	CCT	2	6	1227221	1227226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_016790	A	6	6	1227296	1227301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_016790	TC	3	6	1227414	1227419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_016790	TTG	2	6	1227441	1227446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_016790	GACA	2	8	1230608	1230615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2604	NC_016790	TCAAG	2	10	1230616	1230625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2605	NC_016790	AC	3	6	1230638	1230643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_016790	ATT	2	6	1230716	1230721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_016790	TAAT	2	8	1230769	1230776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_016790	TGC	2	6	1230811	1230816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_016790	CATA	2	8	1230864	1230871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2610	NC_016790	A	6	6	1230919	1230924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_016790	ACA	2	6	1230937	1230942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_016790	CGA	2	6	1231097	1231102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_016790	CAA	2	6	1231130	1231135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_016790	TCT	2	6	1231139	1231144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_016790	TC	3	6	1234128	1234133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_016790	AGT	2	6	1234747	1234752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_016790	AAG	2	6	1235556	1235561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016790	T	6	6	1237280	1237285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_016790	AAAG	2	8	1237403	1237410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_016790	TAAG	2	8	1237427	1237434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_016790	CGA	2	6	1237445	1237450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_016790	CT	3	6	1237489	1237494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_016790	GA	3	6	1237505	1237510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_016790	AAAAG	2	10	1239218	1239227	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_016790	CTT	2	6	1245558	1245563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_016790	CCT	2	6	1245584	1245589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2627	NC_016790	AATC	2	8	1245612	1245619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2628	NC_016790	ATTC	2	8	1245696	1245703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2629	NC_016790	TC	3	6	1245757	1245762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_016790	TTC	2	6	1245788	1245793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_016790	ACGA	2	8	1245960	1245967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_016790	CAA	2	6	1245987	1245992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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