MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 5320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016790	GCA	2	6	249291	249296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016790	AC	3	6	249360	249365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_016790	GCC	2	6	249383	249388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_016790	GGC	2	6	249449	249454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016790	AGA	2	6	249472	249477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016790	TTG	2	6	249528	249533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016790	A	6	6	249590	249595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016790	GGA	2	6	249611	249616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016790	CATG	2	8	249642	249649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_016790	GACA	2	8	249666	249673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_016790	GAG	2	6	249676	249681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016790	TGC	2	6	249691	249696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016790	GC	3	6	249716	249721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_016790	AGCT	2	8	249778	249785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_016790	CCA	2	6	249825	249830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_016790	AGA	2	6	249850	249855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016790	TCAT	2	8	249977	249984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_016790	AAC	2	6	249995	250000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_016790	TGA	2	6	250030	250035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016790	CAG	2	6	250133	250138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016790	A	6	6	250140	250145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016790	GAA	2	6	250211	250216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016790	GAA	2	6	250250	250255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016790	ATAG	2	8	250334	250341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016790	AAC	2	6	250473	250478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016790	TA	3	6	250488	250493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016790	ATG	2	6	250520	250525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016790	AAT	2	6	250549	250554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016790	ATC	2	6	250580	250585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_016790	CTG	2	6	250807	250812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016790	TG	3	6	250811	250816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016790	TG	3	6	250846	250851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016790	CTGC	2	8	250874	250881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
534	NC_016790	TGCT	2	8	251370	251377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_016790	TGG	3	9	251383	251391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016790	GCT	2	6	251409	251414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016790	CTT	2	6	251800	251805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016790	TCT	2	6	251871	251876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016790	GTT	2	6	251963	251968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016790	CT	3	6	252213	252218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_016790	CCAGT	2	10	252285	252294	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
542	NC_016790	TG	3	6	252317	252322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016790	CAGA	2	8	252332	252339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_016790	GAA	2	6	252398	252403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016790	GATTT	2	10	252423	252432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016790	TGAT	2	8	252694	252701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016790	TGT	2	6	252721	252726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016790	T	6	6	252732	252737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016790	TTTGG	2	10	252741	252750	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016790	ATGTT	2	10	252825	252834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016790	TCG	2	6	252839	252844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016790	TGC	2	6	252845	252850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016790	GATT	2	8	253422	253429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016790	T	6	6	253483	253488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016790	T	6	6	253518	253523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016790	TTG	2	6	253546	253551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016790	GTC	2	6	254102	254107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_016790	GC	3	6	255311	255316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_016790	TCG	2	6	255317	255322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_016790	TGC	2	6	255347	255352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016790	CAG	2	6	255386	255391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016790	TTG	2	6	257013	257018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016790	CG	3	6	257033	257038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_016790	GACT	2	8	257062	257069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_016790	CTAC	2	8	257153	257160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_016790	GTCTG	2	10	257205	257214	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
567	NC_016790	TCA	2	6	257642	257647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016790	ACC	2	6	257659	257664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_016790	TGG	2	6	257667	257672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016790	GCTA	2	8	257675	257682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_016790	TCT	2	6	257697	257702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016790	ATT	2	6	257728	257733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016790	GCTG	2	8	257782	257789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_016790	ACG	2	6	257813	257818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016790	ATG	2	6	257849	257854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016790	TTTA	2	8	257860	257867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016790	TC	3	6	258410	258415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_016790	TGG	2	6	258442	258447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016790	TGC	2	6	258632	258637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016790	CAG	2	6	258665	258670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016790	T	7	7	258721	258727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016790	TCG	2	6	259512	259517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016790	ACTA	2	8	259573	259580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_016790	ATT	2	6	259649	259654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016790	TCC	2	6	259700	259705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_016790	G	6	6	259715	259720	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016790	GGA	2	6	259730	259735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016790	ACT	2	6	259794	259799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_016790	TCGCT	2	10	259820	259829	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
590	NC_016790	ACG	2	6	259837	259842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_016790	GTCC	2	8	259867	259874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_016790	CAT	2	6	259927	259932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016790	AGA	2	6	260035	260040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016790	TA	3	6	260068	260073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016790	AAC	2	6	269616	269621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016790	TCAA	2	8	272637	272644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
597	NC_016790	TCCTT	2	10	277031	277040	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
598	NC_016790	TAA	2	6	277046	277051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016790	A	6	6	277050	277055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016790	CGA	2	6	278221	278226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_016790	TAG	2	6	278232	278237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016790	AAG	2	6	278252	278257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016790	AGA	2	6	278282	278287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016790	AGA	2	6	278289	278294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016790	TTC	2	6	278519	278524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_016790	TGATG	2	10	278616	278625	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016790	CTC	2	6	280068	280073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_016790	TGG	2	6	281714	281719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016790	ATT	2	6	281723	281728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016790	GAT	2	6	281927	281932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016790	GTC	2	6	281941	281946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016790	ATG	2	6	282038	282043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016790	TTC	2	6	285721	285726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016790	TCA	2	6	286138	286143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016790	CA	3	6	286142	286147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_016790	GTG	2	6	286149	286154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016790	CCG	2	6	286158	286163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_016790	ATA	2	6	286292	286297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016790	ACC	2	6	290016	290021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_016790	CAGG	2	8	290032	290039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_016790	TGG	2	6	290040	290045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016790	TGA	2	6	290325	290330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016790	GGA	2	6	290342	290347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016790	AC	3	6	292663	292668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_016790	TAA	2	6	292685	292690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016790	A	6	6	292693	292698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016790	TCG	2	6	292749	292754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016790	TAA	2	6	294162	294167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016790	TTGG	2	8	299163	299170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016790	TAA	2	6	299172	299177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016790	AAT	2	6	300478	300483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016790	TGC	2	6	300502	300507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016790	CTTT	2	8	305706	305713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_016790	TGT	2	6	305738	305743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016790	GAT	2	6	305778	305783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016790	CGTG	2	8	305881	305888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
637	NC_016790	GC	3	6	305916	305921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_016790	TTG	2	6	305925	305930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_016790	CG	3	6	306256	306261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
641	NC_016790	GTAC	2	8	306289	306296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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649	NC_016790	GA	3	6	326258	326263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
650	NC_016790	CAG	2	6	326270	326275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_016790	TTTTC	2	10	326431	326440	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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