MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae PW8 chromosome

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016789	AGCGA	2	10	2129	2138	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016789	TGTGA	2	10	12161	12170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016789	TTGAT	2	10	32850	32859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016789	CACGC	2	10	53709	53718	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_016789	GGTGG	2	10	53999	54008	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016789	CCCAT	2	10	56744	56753	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_016789	GATCA	2	10	69486	69495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016789	ACTCC	2	10	69581	69590	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016789	GCCTA	2	10	75102	75111	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016789	CCGCA	2	10	87676	87685	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016789	TCCAC	2	10	94503	94512	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_016789	TGCAC	2	10	102563	102572	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016789	GAGCG	2	10	103719	103728	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016789	GAGGC	2	10	108090	108099	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016789	CTGTT	2	10	108235	108244	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016789	TAATT	2	10	126560	126569	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016789	TTAGC	2	10	128613	128622	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016789	GTGAT	2	10	130603	130612	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016789	TTCCT	2	10	143432	143441	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016789	GAACA	2	10	148511	148520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016789	CTGAC	2	10	177399	177408	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016789	TTCCT	2	10	181925	181934	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016789	GAACA	2	10	187008	187017	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016789	TGATC	2	10	218814	218823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016789	AATCT	2	10	221192	221201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016789	CGCGA	2	10	225657	225666	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016789	ACTGG	2	10	225707	225716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016789	CTTCG	2	10	225899	225908	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016789	CGCAG	2	10	228882	228891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016789	GGTCA	2	10	232620	232629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016789	TTGTT	2	10	233032	233041	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016789	GATGA	2	10	236194	236203	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016789	ATTCC	2	10	236878	236887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016789	ACCCA	2	10	238321	238330	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_016789	GTACC	2	10	238867	238876	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016789	GAAAT	2	10	240517	240526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016789	CTTAT	2	10	241415	241424	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016789	GCCGG	2	10	241952	241961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016789	TGAGG	2	10	242512	242521	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016789	AGCTG	2	10	250155	250164	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016789	GGGCG	2	10	277032	277041	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016789	AGCCA	2	10	277722	277731	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016789	GCAGG	2	10	304345	304354	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016789	GCGGT	2	10	304355	304364	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016789	CACGA	2	10	313759	313768	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016789	ATAAC	2	10	315923	315932	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016789	GAAAA	2	10	339836	339845	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016789	CCAGT	2	10	348708	348717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_016789	GATTT	2	10	348846	348855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016789	TTTGG	2	10	349164	349173	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016789	ATGTT	2	10	349248	349257	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016789	GTCTC	2	10	354657	354666	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016789	TCCTT	2	10	365423	365432	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016789	TGTGG	2	10	370164	370173	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016789	GTGCT	2	10	426833	426842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016789	CACAC	2	10	429315	429324	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_016789	GGGGT	2	10	472904	472913	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016789	GGAAA	2	10	474684	474693	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016789	TTTCA	2	10	483244	483253	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016789	TTTCC	2	10	516562	516571	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016789	CCATT	2	10	516692	516701	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016789	GGGGT	2	10	521354	521363	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016789	CAGTG	2	10	529572	529581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016789	ATTTT	2	10	540008	540017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016789	CGCTA	2	10	540131	540140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016789	AGGAA	2	10	544823	544832	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016789	AACCA	2	10	583075	583084	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016789	ACGAT	2	10	588579	588588	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016789	TGGGG	2	10	597148	597157	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016789	TGATG	2	10	605420	605429	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016789	CACAA	2	10	612552	612561	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016789	TTTTG	2	10	617045	617054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016789	GTCTA	2	10	619619	619628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016789	AGGTG	2	10	622095	622104	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016789	CAGTT	2	10	627579	627588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016789	GTTTT	2	10	632780	632789	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016789	TGAGC	2	10	652909	652918	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016789	GGGAA	2	10	706325	706334	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016789	GCGCT	2	10	764667	764676	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016789	TCGTG	2	10	770672	770681	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016789	CGTCA	2	10	771008	771017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016789	TGTTT	2	10	771184	771193	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016789	GGGAG	2	10	772081	772090	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016789	TGGCA	2	10	774700	774709	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016789	TAGTT	2	10	781063	781072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016789	ATGCG	2	10	782209	782218	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016789	GTCCA	2	10	803109	803118	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016789	TAGTG	2	10	809053	809062	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016789	CCTGT	2	10	819333	819342	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016789	CTTTC	2	10	832615	832624	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016789	TGCTG	2	10	857078	857087	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016789	TTTCC	2	10	870841	870850	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016789	GGAGG	2	10	872854	872863	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016789	TGCAA	2	10	903784	903793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016789	ATTCG	2	10	903936	903945	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016789	GAAAG	2	10	905190	905199	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016789	GGAGT	2	10	911634	911643	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016789	TGGCT	2	10	986916	986925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016789	GCGCA	2	10	1021328	1021337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016789	GCCAG	2	10	1021464	1021473	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016789	GAGAA	2	10	1039079	1039088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016789	GCACT	2	10	1075194	1075203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016789	GCCTC	2	10	1099336	1099345	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_016789	GAGAA	2	10	1114633	1114642	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016789	GATCG	2	10	1121639	1121648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016789	AACCT	2	10	1122380	1122389	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_016789	GATTC	2	10	1128091	1128100	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016789	CACTA	2	10	1136267	1136276	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016789	CATTT	2	10	1180855	1180864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016789	TCGTG	2	10	1187456	1187465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016789	CGTCA	2	10	1187792	1187801	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016789	TGTTT	2	10	1187968	1187977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016789	GGGAG	2	10	1188865	1188874	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016789	TGGCA	2	10	1191484	1191493	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016789	TTTTC	2	10	1191687	1191696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016789	AGGGA	2	10	1203601	1203610	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016789	TTCGT	2	10	1242678	1242687	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016789	CCTAC	2	10	1246355	1246364	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_016789	TCTAC	2	10	1256603	1256612	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_016789	CTTAC	2	10	1270278	1270287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016789	TCATC	2	10	1288662	1288671	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016789	TCAAG	2	10	1307938	1307947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016789	AAAAG	2	10	1316537	1316546	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016789	GCCAT	2	10	1330831	1330840	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016789	ACCGT	2	10	1330932	1330941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_016789	CGACG	2	10	1352022	1352031	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016789	CAAAT	2	10	1355018	1355027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016789	AAAAT	2	10	1379603	1379612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016789	TCACT	2	10	1392986	1392995	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016789	GCTCA	2	10	1400652	1400661	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016789	TTTAT	2	10	1414370	1414379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016789	CAACA	2	10	1421478	1421487	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016789	AATGT	2	10	1427454	1427463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016789	AGCAA	2	10	1443390	1443399	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016789	GAACG	2	10	1443498	1443507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016789	TCTCT	2	10	1443588	1443597	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016789	CATCT	2	10	1454463	1454472	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016789	TGTTT	2	10	1456619	1456628	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016789	GCATT	2	10	1459301	1459310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016789	AGAAT	2	10	1488275	1488284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016789	CGTAA	2	10	1488395	1488404	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016789	AGTGG	2	10	1497895	1497904	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016789	AATTG	2	10	1497959	1497968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016789	GCGCC	2	10	1497982	1497991	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_016789	CAGTA	2	10	1505227	1505236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016789	AATCG	2	10	1510238	1510247	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016789	CAAAA	2	10	1511297	1511306	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_016789	GCAGC	2	10	1582313	1582322	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_016789	TTCAA	2	10	1787378	1787387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_016789	ATATG	2	10	1952786	1952795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_016789	TCAGC	2	10	1956725	1956734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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188	NC_016789	CACGA	2	10	1965654	1965663	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_016789	TCGTG	2	10	1980838	1980847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_016789	TGGCT	2	10	2005537	2005546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.