MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 5676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016788	GT	3	6	495605	495610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016788	TCT	2	6	497276	497281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016788	GTT	2	6	499533	499538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016788	AAGG	2	8	505643	505650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016788	GCA	2	6	506905	506910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016788	GCT	2	6	507375	507380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016788	TCG	2	6	507434	507439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016788	CGT	2	6	507483	507488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_016788	ACTA	2	8	508442	508449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_016788	AAGG	2	8	508458	508465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016788	AAGG	2	8	508488	508495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016788	CGG	2	6	508566	508571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016788	ATCC	2	8	508869	508876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_016788	CTG	2	6	508894	508899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016788	ACGAT	2	10	509322	509331	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1016	NC_016788	ATG	2	6	509494	509499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016788	GCT	2	6	510062	510067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016788	GTG	2	6	510121	510126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016788	TTC	2	6	510128	510133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016788	TAGC	2	8	510153	510160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_016788	AGT	2	6	510264	510269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016788	GACA	2	8	510586	510593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_016788	CA	3	6	512215	512220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_016788	GCA	2	6	512246	512251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_016788	GTA	2	6	513014	513019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016788	AGT	2	6	513031	513036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016788	ACC	2	6	514666	514671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_016788	AAAAAC	2	12	514713	514724	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1029	NC_016788	GCG	2	6	516687	516692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016788	CTTC	2	8	516765	516772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_016788	GATT	2	8	517146	517153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016788	CAT	2	6	517158	517163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_016788	TAT	2	6	517950	517955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016788	TGGGG	2	10	517988	517997	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016788	CTA	2	6	518190	518195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016788	TATTT	2	10	518212	518221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016788	TGG	2	6	518242	518247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016788	GGGT	2	8	518250	518257	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016788	GTG	2	6	520680	520685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016788	GAA	2	6	520700	520705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016788	AGA	2	6	520988	520993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016788	GA	3	6	520992	520997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016788	GAG	2	6	521033	521038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016788	AGT	2	6	523492	523497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016788	GTA	2	6	525206	525211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016788	TGATG	2	10	526268	526277	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016788	TGC	2	6	527227	527232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_016788	GGC	2	6	527261	527266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_016788	AGCG	2	8	527281	527288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_016788	A	6	6	527302	527307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016788	T	6	6	527325	527330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016788	GTC	2	6	530323	530328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016788	GCGG	2	8	530370	530377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_016788	GTG	2	6	530392	530397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016788	GGA	2	6	530439	530444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016788	GAT	2	6	530460	530465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016788	ATG	2	6	530513	530518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016788	AATA	2	8	533375	533382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016788	CA	3	6	533390	533395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_016788	T	6	6	536481	536486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016788	TGG	2	6	536506	536511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016788	ATTT	2	8	536531	536538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016788	GT	3	6	536555	536560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016788	GTC	2	6	536644	536649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_016788	AAT	2	6	536671	536676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016788	TTTTG	2	10	537890	537899	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016788	TGA	2	6	539113	539118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1070	NC_016788	GTG	2	6	539270	539275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016788	TTTA	2	8	539283	539290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016788	GTCTA	2	10	540464	540473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_016788	TTG	3	9	540474	540482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016788	CCG	2	6	540491	540496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1076	NC_016788	TTTC	2	8	541038	541045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_016788	G	6	6	541056	541061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016788	GTC	2	6	541127	541132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_016788	GAG	2	6	541232	541237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016788	TG	3	6	543028	543033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016788	TGA	2	6	545136	545141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016788	TGT	2	6	546000	546005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016788	TTAT	2	8	546088	546095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016788	GCCTT	2	10	546136	546145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_016788	AGGA	2	8	546157	546164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016788	TTCC	2	8	547169	547176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_016788	CTG	2	6	547211	547216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_016788	CAG	2	6	547227	547232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_016788	TCG	2	6	548581	548586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_016788	TTCC	2	8	548588	548595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_016788	GCAA	2	8	548612	548619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_016788	TCA	2	6	548681	548686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1097	NC_016788	GTTG	2	8	548729	548736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016788	GGGGCA	2	12	548758	548769	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1100	NC_016788	TTCC	2	8	548793	548800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_016788	T	6	6	548803	548808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016788	TCA	2	6	551055	551060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_016788	GTA	2	6	551077	551082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016788	A	6	6	551132	551137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016788	CG	3	6	551212	551217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_016788	TCA	2	6	551243	551248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_016788	GAC	2	6	553452	553457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_016788	GTA	2	6	553521	553526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016788	TTC	2	6	553770	553775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016788	GC	3	6	553802	553807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_016788	CA	3	6	553848	553853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_016788	GTTTT	2	10	553875	553884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016788	GT	3	6	553912	553917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016788	CAA	2	6	556298	556303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_016788	AAC	2	6	556310	556315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_016788	GAT	2	6	556333	556338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016788	ATG	2	6	557609	557614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016788	T	6	6	558622	558627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016788	CA	3	6	558672	558677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_016788	CAC	2	6	558687	558692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_016788	CA	3	6	558696	558701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_016788	GCT	2	6	558702	558707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_016788	TCT	2	6	558710	558715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_016788	GTC	2	6	561959	561964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_016788	ACC	2	6	562019	562024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_016788	TTTA	2	8	562046	562053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016788	CTTTC	2	10	562694	562703	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_016788	TGCA	2	8	562730	562737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_016788	GGA	2	6	564053	564058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016788	T	6	6	565623	565628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016788	TGC	2	6	565707	565712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_016788	G	8	8	565741	565748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016788	TGT	2	6	565814	565819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_016788	CGT	2	6	565907	565912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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