MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 5676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016788	ACG	2	6	2383149	2383154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_016788	AAC	2	6	2383176	2383181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_016788	GTACA	2	10	2383218	2383227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5504	NC_016788	ATT	2	6	2383806	2383811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016788	TCG	2	6	2384058	2384063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_016788	TG	3	6	2384076	2384081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016788	ATTGTT	2	12	2384133	2384144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_016788	C	6	6	2386442	2386447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5509	NC_016788	GTTT	2	8	2386485	2386492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_016788	ACT	2	6	2386507	2386512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_016788	TCC	2	6	2389389	2389394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_016788	TTC	2	6	2389641	2389646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_016788	TA	3	6	2389670	2389675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016788	GCT	2	6	2389811	2389816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_016788	AGA	2	6	2389817	2389822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016788	TGT	2	6	2389908	2389913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_016788	CGT	2	6	2389937	2389942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_016788	TCA	2	6	2390445	2390450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_016788	GT	3	6	2390452	2390457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016788	GTG	2	6	2390504	2390509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_016788	ACA	2	6	2391133	2391138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_016788	TTC	2	6	2391187	2391192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_016788	TGC	2	6	2391214	2391219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_016788	GC	3	6	2391218	2391223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_016788	TCA	2	6	2391535	2391540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_016788	CCT	2	6	2391541	2391546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_016788	T	6	6	2391558	2391563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016788	AGG	2	6	2391593	2391598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_016788	ACG	2	6	2391656	2391661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_016788	AAC	2	6	2391685	2391690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_016788	AGG	2	6	2393495	2393500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_016788	GGA	2	6	2393508	2393513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_016788	CA	3	6	2395777	2395782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_016788	C	6	6	2396201	2396206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5535	NC_016788	ATA	2	6	2396216	2396221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016788	GCA	2	6	2396223	2396228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_016788	CA	3	6	2400495	2400500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_016788	CTA	2	6	2401484	2401489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_016788	ACC	2	6	2401592	2401597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_016788	CA	3	6	2401606	2401611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_016788	CGA	2	6	2402288	2402293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_016788	AGT	2	6	2402320	2402325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016788	ACT	2	6	2402400	2402405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_016788	TATT	2	8	2402965	2402972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_016788	AAC	2	6	2402992	2402997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_016788	CA	3	6	2406537	2406542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_016788	AC	3	6	2406556	2406561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_016788	CAA	2	6	2406569	2406574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_016788	CAG	3	9	2407255	2407263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_016788	TA	3	6	2407283	2407288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_016788	ACT	2	6	2407310	2407315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_016788	AAC	2	6	2408517	2408522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_016788	GCAGC	2	10	2408547	2408556	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5554	NC_016788	AGT	2	6	2408602	2408607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_016788	TGC	2	6	2408652	2408657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_016788	ACT	2	6	2408682	2408687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_016788	AT	3	6	2408730	2408735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_016788	CTT	2	6	2408753	2408758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_016788	AAG	2	6	2408786	2408791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016788	GCC	2	6	2409770	2409775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_016788	ACT	2	6	2410466	2410471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_016788	TCTAA	2	10	2410595	2410604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5563	NC_016788	TGG	2	6	2410632	2410637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_016788	AC	3	6	2412380	2412385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_016788	CAC	3	9	2412383	2412391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_016788	CGG	2	6	2412442	2412447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_016788	GTG	2	6	2412453	2412458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_016788	TTTC	2	8	2418503	2418510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_016788	ATA	2	6	2420592	2420597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_016788	AGC	2	6	2420608	2420613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_016788	T	6	6	2420615	2420620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_016788	GT	3	6	2420694	2420699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016788	CGA	2	6	2420701	2420706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_016788	TCG	2	6	2420725	2420730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_016788	CCA	2	6	2424718	2424723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_016788	TAGC	2	8	2424810	2424817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_016788	GC	3	6	2424867	2424872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_016788	CA	3	6	2424972	2424977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_016788	GTA	2	6	2427911	2427916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_016788	GAG	2	6	2427998	2428003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_016788	AGC	2	6	2428144	2428149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_016788	TGT	2	6	2428177	2428182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_016788	TTG	2	6	2430687	2430692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_016788	GTG	2	6	2430723	2430728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_016788	CAT	2	6	2430779	2430784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_016788	TAA	2	6	2430788	2430793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_016788	TTA	2	6	2430803	2430808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_016788	AGC	2	6	2430829	2430834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_016788	AGT	2	6	2433344	2433349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_016788	GGA	2	6	2433389	2433394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_016788	CAA	2	6	2433411	2433416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_016788	TCC	2	6	2435325	2435330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_016788	AAT	2	6	2435336	2435341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_016788	TCG	2	6	2435357	2435362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_016788	AAAAC	2	10	2435374	2435383	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5596	NC_016788	CAC	2	6	2435477	2435482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_016788	ATAG	2	8	2435529	2435536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_016788	CAT	2	6	2435649	2435654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_016788	AGC	2	6	2435703	2435708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_016788	AT	3	6	2436872	2436877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_016788	TTTA	2	8	2436967	2436974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_016788	AGT	2	6	2438522	2438527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_016788	GAG	2	6	2438545	2438550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_016788	GAG	2	6	2439362	2439367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_016788	GCA	2	6	2443434	2443439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_016788	AGG	2	6	2443457	2443462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016788	GCTTT	2	10	2443480	2443489	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5608	NC_016788	GAG	2	6	2444982	2444987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_016788	AAT	2	6	2446990	2446995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_016788	A	6	6	2449167	2449172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_016788	GCT	2	6	2450096	2450101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_016788	GTT	2	6	2451527	2451532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_016788	TGCG	2	8	2452181	2452188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_016788	TGG	3	9	2452241	2452249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_016788	CATT	2	8	2452277	2452284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_016788	CAA	2	6	2452304	2452309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_016788	CCA	2	6	2452330	2452335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_016788	ACA	2	6	2452371	2452376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_016788	ATG	2	6	2458450	2458455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_016788	CCG	2	6	2458463	2458468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_016788	AGT	2	6	2460528	2460533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_016788	ACT	2	6	2460557	2460562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_016788	ACG	2	6	2460583	2460588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_016788	GGT	2	6	2460609	2460614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_016788	CGCC	2	8	2460641	2460648	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5626	NC_016788	CAA	2	6	2460687	2460692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_016788	TGA	2	6	2460693	2460698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_016788	TGG	2	6	2460716	2460721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_016788	TG	3	6	2460746	2460751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_016788	CAC	2	6	2460758	2460763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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