MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016786	TAATCC	2	12	12950	12961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016786	AAGCTA	2	12	20137	20148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016786	CGGGGA	2	12	20157	20168	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016786	TTGACA	2	12	52253	52264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016786	TGTCGA	2	12	56917	56928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016786	GTCATC	2	12	118012	118023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016786	CACTTC	2	12	156463	156474	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016786	GAGTTC	2	12	158930	158941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016786	CCTATT	2	12	230739	230750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016786	TTATGG	2	12	325345	325356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016786	ACAAGG	2	12	406234	406245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016786	GCACCT	2	12	474275	474286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016786	AAAAAC	2	12	524810	524821	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016786	GGGGCA	2	12	558777	558788	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016786	TAAGCG	2	12	585494	585505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016786	GCGTAG	2	12	588012	588023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016786	AACAAA	2	12	668297	668308	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016786	TTGTGG	2	12	669746	669757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016786	GTTTGG	2	12	672334	672345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016786	AGCGAA	2	12	692677	692688	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016786	CGCATG	2	12	695435	695446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016786	AGGTTC	2	12	725891	725902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016786	TGTGAT	2	12	809698	809709	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016786	TCCTTG	2	12	818947	818958	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016786	TCCGGA	2	12	879851	879862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016786	CAGCGC	2	12	880178	880189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016786	GGTGAA	2	12	1049494	1049505	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016786	CTGGAA	3	18	1091605	1091622	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016786	TGGCGA	2	12	1092116	1092127	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016786	AGCGAA	2	12	1144884	1144895	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016786	GACAGT	2	12	1175389	1175400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016786	TTGAGG	2	12	1179865	1179876	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016786	AAAAAC	2	12	1233482	1233493	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016786	ACCAGC	2	12	1372973	1372984	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016786	ACAGAA	2	12	1379838	1379849	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016786	TCGCCC	2	12	1441015	1441026	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016786	TCAATG	2	12	1442085	1442096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016786	CTGCAT	2	12	1484446	1484457	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016786	TGCAGC	2	12	1491233	1491244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016786	GATTCC	2	12	1566154	1566165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016786	AAACCA	2	12	1679231	1679242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016786	GCTGTG	2	12	1785518	1785529	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016786	CACACC	2	12	1897091	1897102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016786	TTCGCT	2	12	1899836	1899847	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016786	TAACCC	2	12	1919024	1919035	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016786	CCTTTT	2	12	2012972	2012983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016786	ACATTT	2	12	2029296	2029307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016786	TAGTTT	2	12	2030573	2030584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016786	GTTCGC	2	12	2091407	2091418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016786	CGACTG	2	12	2092160	2092171	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016786	CACATT	2	12	2093896	2093907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016786	TTTGCT	2	12	2096712	2096723	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016786	CACACC	2	12	2138979	2138990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016786	TTCGCT	2	12	2141724	2141735	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016786	GGGTTT	2	12	2171750	2171761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016786	GAGTAA	2	12	2192898	2192909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016786	AAACCA	2	12	2222513	2222524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016786	AAAGGA	2	12	2233733	2233744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016786	CCAATG	2	12	2237435	2237446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016786	CCGAAA	2	12	2250441	2250452	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016786	CAACAC	2	12	2253790	2253801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016786	CACACC	2	12	2313793	2313804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016786	TTCGCT	2	12	2316538	2316549	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016786	ATTGTT	2	12	2325448	2325459	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016786	CCTCAT	2	12	2378019	2378030	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.