MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016786	TGTGA	2	10	19424	19433	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016786	GGTGG	2	10	40336	40345	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016786	AAGAG	2	10	40884	40893	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016786	GACCC	2	10	54625	54634	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_016786	CCCAA	2	10	54814	54823	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016786	TCGTG	2	10	75776	75785	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016786	GAGCT	2	10	101693	101702	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016786	TCCAC	2	10	108624	108633	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016786	TGCAC	2	10	116485	116494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016786	GTTTC	2	10	124631	124640	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016786	TAATT	2	10	144086	144095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016786	TTAGC	2	10	146139	146148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016786	TTGGT	2	10	178489	178498	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016786	CCGCC	2	10	198399	198408	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_016786	GCAGG	2	10	233286	233295	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016786	GCGGT	2	10	233296	233305	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016786	CACGA	2	10	242691	242700	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016786	ATAAC	2	10	244855	244864	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016786	GAAAA	2	10	268133	268142	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016786	GTCTC	2	10	280136	280145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016786	TCCTT	2	10	290964	290973	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016786	TGATG	2	10	292549	292558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016786	GTGCT	2	10	353086	353095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016786	CACAC	2	10	355568	355577	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016786	TCTGC	2	10	386452	386461	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016786	TATAA	2	10	417978	417987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016786	TGATG	2	10	436520	436529	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016786	TTTCC	2	10	444059	444068	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016786	CCATT	2	10	444188	444197	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016786	GGGGT	2	10	452098	452107	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016786	CAGTG	2	10	460316	460325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016786	ATTTT	2	10	470764	470773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016786	CGCTA	2	10	470887	470896	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016786	AGGAA	2	10	475579	475588	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016786	TGATG	2	10	536299	536308	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016786	TTTTG	2	10	547922	547931	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016786	TGTCT	2	10	547941	547950	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016786	GCCTT	2	10	556156	556165	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016786	GTTTT	2	10	563894	563903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016786	CTTTC	2	10	572736	572745	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016786	TGAGC	2	10	584046	584055	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016786	AGCCA	2	10	591616	591625	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016786	GCTGC	2	10	604575	604584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016786	GGGAA	2	10	635980	635989	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016786	GCGCT	2	10	685136	685145	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016786	TCGTG	2	10	691133	691142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016786	CGTCA	2	10	691469	691478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016786	GGGAG	2	10	692536	692545	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016786	TGGCA	2	10	695160	695169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016786	TGTGG	2	10	695343	695352	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016786	TAGTT	2	10	703559	703568	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016786	ATGCG	2	10	704681	704690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016786	GTCCA	2	10	725565	725574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016786	GGGGC	2	10	727966	727975	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016786	ATCCT	2	10	728130	728139	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016786	GTGAA	2	10	735457	735466	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016786	TTCAA	3	15	735488	735502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016786	AATTT	2	10	735844	735853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016786	CCGGG	2	10	741081	741090	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016786	TAGTG	2	10	748344	748353	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016786	CCTGT	2	10	758623	758632	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016786	CTTTC	2	10	771894	771903	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016786	TGGGG	2	10	774385	774394	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016786	TGCTG	2	10	796359	796368	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016786	TTTCC	2	10	810122	810131	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016786	GGAGG	2	10	812133	812142	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016786	TGCAA	2	10	843061	843070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016786	AGTCG	2	10	843183	843192	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016786	ATTCG	2	10	843213	843222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016786	GAAAG	2	10	844466	844475	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016786	TGGCG	2	10	852709	852718	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016786	AGCTG	2	10	880105	880114	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016786	TGATC	2	10	880459	880468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016786	CGGAA	2	10	909852	909861	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016786	GAGAA	2	10	973116	973125	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016786	GCACT	2	10	1009226	1009235	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016786	GCCTC	2	10	1033372	1033381	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_016786	GATCG	2	10	1053584	1053593	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016786	AACCT	2	10	1054325	1054334	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016786	GATTC	2	10	1060034	1060043	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016786	CACTA	2	10	1068222	1068231	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016786	CTGAC	2	10	1092262	1092271	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016786	ACACT	2	10	1114111	1114120	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016786	CTTGG	2	10	1127451	1127460	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016786	CATTT	2	10	1136739	1136748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016786	TCGTG	2	10	1143340	1143349	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016786	CGTCA	2	10	1143676	1143685	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016786	GGGAG	2	10	1144743	1144752	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016786	TGGCA	2	10	1147367	1147376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016786	TTTTC	2	10	1147569	1147578	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016786	TTCGT	2	10	1198674	1198683	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016786	CCTAC	2	10	1202352	1202361	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_016786	CCTTA	2	10	1226277	1226286	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016786	GCAAC	2	10	1249315	1249324	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016786	TCAAG	2	10	1263784	1263793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016786	AAGCC	2	10	1264111	1264120	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016786	AAAAG	2	10	1272388	1272397	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016786	GCCAT	2	10	1284993	1285002	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016786	ACCGT	2	10	1285094	1285103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016786	CGACG	2	10	1306184	1306193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016786	CAAAT	2	10	1309179	1309188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016786	AAAAT	2	10	1333764	1333773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016786	CGAGG	2	10	1351055	1351064	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016786	AATGG	2	10	1351551	1351560	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016786	AACGC	2	10	1351952	1351961	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016786	GCTCA	2	10	1354811	1354820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_016786	AAACA	2	10	1369663	1369672	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016786	TTTAT	2	10	1370660	1370669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016786	AATGT	2	10	1382227	1382236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016786	AGCAA	2	10	1398128	1398137	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016786	CTAAT	2	10	1405434	1405443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016786	TGTTT	2	10	1411351	1411360	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016786	AGAAT	2	10	1443047	1443056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016786	CGTAA	2	10	1443167	1443176	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016786	AGTGG	2	10	1452669	1452678	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016786	AATTG	2	10	1452733	1452742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016786	GCGCC	2	10	1452756	1452765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_016786	CAGTA	2	10	1460001	1460010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016786	CAAAA	2	10	1464542	1464551	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016786	AAGTT	2	10	1521406	1521415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016786	AAACC	2	10	1530165	1530174	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016786	TAACC	2	10	1532728	1532737	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_016786	GCAGC	2	10	1541304	1541313	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016786	AGACA	2	10	1549890	1549899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016786	CATGG	2	10	1565799	1565808	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016786	AGCAC	2	10	1585646	1585655	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016786	CTTTA	2	10	1610758	1610767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016786	ACCAA	2	10	1626245	1626254	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_016786	TTTAT	2	10	1657983	1657992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016786	CGTTT	2	10	1660536	1660545	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016786	ACAAG	2	10	1668990	1668999	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016786	TTTCA	2	10	1679578	1679587	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016786	GAGTT	2	10	1680687	1680696	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016786	CATCT	2	10	1688231	1688240	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016786	TTAGG	2	10	1690154	1690163	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016786	ATCAC	2	10	1699364	1699373	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016786	AGAAA	2	10	1708043	1708052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016786	TTCAA	2	10	1733077	1733086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016786	TGGCT	2	10	1789693	1789702	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016786	GTGTG	2	10	1790698	1790707	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016786	ATCTC	2	10	1790869	1790878	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_016786	CAACG	2	10	1810059	1810068	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_016786	GAATC	2	10	1824463	1824472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016786	TTTCT	2	10	1827187	1827196	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_016786	GGTCG	2	10	2149255	2149264	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_016786	GACGA	2	10	2176212	2176221	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_016786	AATCG	2	10	2193087	2193096	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_016786	TACCC	2	10	2199821	2199830	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
185	NC_016786	TTCTA	2	10	2216973	2216982	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_016786	CACAT	2	10	2239394	2239403	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
187	NC_016786	CAAAC	2	10	2292900	2292909	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
188	NC_016786	TGCCA	2	10	2314057	2314066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
189	NC_016786	CTCCC	2	10	2316681	2316690	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
190	NC_016786	CACAC	2	10	2317514	2317523	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
191	NC_016786	TGACG	2	10	2317748	2317757	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_016786	CACGA	2	10	2318084	2318093	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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194	NC_016786	TGGGT	2	10	2324426	2324435	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
195	NC_016786	GTACA	2	10	2324533	2324542	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
196	NC_016786	GCAGC	2	10	2349867	2349876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
197	NC_016786	TCTAA	2	10	2350885	2350894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_016786	TCCTT	2	10	2368351	2368360	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
199	NC_016786	AAAAC	2	10	2378244	2378253	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
200	NC_016786	TGGTC	2	10	2379650	2379659	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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203	NC_016786	AAGGA	2	10	2420146	2420155	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
204	NC_016786	GCACA	2	10	2421356	2421365	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
205	NC_016786	ACCGC	2	10	2425635	2425644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
206	NC_016786	AATGA	2	10	2426611	2426620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
207	NC_016786	AAAAT	2	10	2426867	2426876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.