MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 5535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016786	ACA	2	6	1726	1731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016786	A	7	7	1767	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016786	GT	3	6	1796	1801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016786	CCA	3	9	2012	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016786	CG	4	8	2137	2144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016786	AGCG	2	8	2146	2153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016786	AAG	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016786	CTC	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016786	GATC	2	8	2279	2286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016786	GAG	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016786	CGC	2	6	7453	7458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016786	TTC	2	6	8100	8105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016786	ACA	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016786	TCA	2	6	11734	11739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016786	GCA	2	6	11745	11750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016786	TAT	2	6	11766	11771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016786	CCA	2	6	11881	11886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016786	T	6	6	12001	12006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016786	CCT	2	6	12027	12032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016786	CG	3	6	12073	12078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016786	TAATCC	2	12	12950	12961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016786	CAGG	2	8	14707	14714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016786	TGT	2	6	14808	14813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016786	TGA	2	6	14816	14821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016786	TG	3	6	14822	14827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016786	AAT	2	6	14853	14858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016786	A	8	8	14881	14888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016786	GT	3	6	14984	14989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016786	CCGG	2	8	14995	15002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016786	CCA	2	6	19131	19136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016786	CCAG	2	8	19230	19237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016786	T	6	6	19251	19256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016786	TG	3	6	19260	19265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016786	CCT	2	6	19276	19281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016786	GGA	2	6	19370	19375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016786	CAA	2	6	19389	19394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016786	TGTGA	2	10	19424	19433	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016786	GGT	2	6	19498	19503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016786	GTG	2	6	19520	19525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016786	TGG	2	6	19539	19544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016786	TGA	3	9	19557	19565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016786	CG	3	6	19605	19610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016786	TTG	2	6	19623	19628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016786	ACC	2	6	19682	19687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016786	AAG	2	6	20086	20091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016786	AAGCTA	2	12	20137	20148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016786	CGGGGA	2	12	20157	20168	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016786	GTT	2	6	20200	20205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016786	CCAG	2	8	20296	20303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016786	TG	3	6	20326	20331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016786	CCT	2	6	20342	20347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016786	GCAC	2	8	20378	20385	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016786	CTT	2	6	20399	20404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016786	GAG	2	6	20428	20433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016786	GTG	2	6	21130	21135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016786	CAG	2	6	21197	21202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016786	GGA	2	6	21281	21286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016786	ACG	2	6	25451	25456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016786	GAA	2	6	25685	25690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016786	TCA	2	6	25697	25702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016786	CCA	2	6	25747	25752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016786	TAAC	2	8	25764	25771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016786	T	8	8	26535	26542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016786	CA	3	6	26557	26562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016786	ATAA	2	8	26569	26576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016786	CAG	2	6	26586	26591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016786	GTT	2	6	26610	26615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016786	ACG	2	6	26659	26664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016786	GTG	2	6	27055	27060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016786	TGG	2	6	27090	27095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016786	AGAT	2	8	27189	27196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016786	AAG	2	6	27211	27216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016786	CCA	2	6	27242	27247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016786	TG	3	6	27276	27281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016786	GGT	2	6	27323	27328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016786	GTT	2	6	27387	27392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016786	GGC	2	6	27414	27419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016786	AGTG	2	8	27446	27453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016786	GAAG	2	8	27536	27543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016786	AG	3	6	27542	27547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016786	CAC	2	6	31107	31112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016786	CAAC	2	8	31188	31195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016786	ACC	2	6	31222	31227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016786	ACC	2	6	31244	31249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016786	GGA	2	6	31273	31278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016786	TAAT	2	8	34879	34886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016786	TTAA	2	8	34948	34955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016786	CCG	2	6	35005	35010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016786	A	6	6	39560	39565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016786	T	6	6	39581	39586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016786	GAT	2	6	39637	39642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016786	TGG	2	6	39654	39659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016786	CAG	2	6	39692	39697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016786	GCAG	3	12	39694	39705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016786	A	6	6	39774	39779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016786	ACC	2	6	39837	39842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016786	CAG	2	6	39955	39960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016786	CGC	2	6	40152	40157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016786	TGT	2	6	40210	40215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016786	TTC	2	6	40287	40292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016786	GGTGG	2	10	40336	40345	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016786	CGG	2	6	40419	40424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016786	ACT	2	6	40704	40709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016786	ACG	2	6	40855	40860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016786	AAGAG	2	10	40884	40893	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016786	CCA	2	6	40910	40915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016786	AGA	2	6	41111	41116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016786	CA	4	8	41927	41934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016786	AAC	2	6	41935	41940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016786	CT	3	6	41949	41954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016786	GTT	2	6	42017	42022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016786	AAAT	2	8	42038	42045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016786	A	7	7	42058	42064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016786	TAA	2	6	42212	42217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016786	ACA	2	6	42218	42223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016786	TAC	2	6	42268	42273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016786	AAC	2	6	42288	42293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016786	TTGT	2	8	42417	42424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016786	CG	3	6	42451	42456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016786	GT	3	6	42468	42473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016786	CTAA	2	8	42510	42517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016786	AAG	2	6	42549	42554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016786	TTG	2	6	42840	42845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016786	GCC	2	6	42891	42896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016786	AGC	2	6	42902	42907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016786	GCA	2	6	42921	42926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016786	CAG	2	6	42928	42933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016786	CCT	2	6	52119	52124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016786	ACA	2	6	52149	52154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016786	TTGACA	2	12	52253	52264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016786	TAG	2	6	52293	52298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016786	A	6	6	52308	52313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016786	CAC	2	6	52321	52326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016786	C	7	7	52400	52406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_016786	AG	3	6	52460	52465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016786	TCT	2	6	52480	52485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016786	CGGA	2	8	52544	52551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016786	GGA	2	6	52557	52562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016786	GT	3	6	53989	53994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016786	TAG	2	6	54278	54283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016786	GACCC	2	10	54625	54634	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_016786	CA	3	6	54636	54641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016786	AAC	2	6	54642	54647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016786	TCG	2	6	54696	54701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016786	AGT	2	6	54708	54713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016786	CA	4	8	54751	54758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016786	CT	3	6	54771	54776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016786	TGG	2	6	54793	54798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_016786	AAT	2	6	56477	56482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_016786	AGAA	2	8	56728	56735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016786	CTT	2	6	57788	57793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_016786	CG	3	6	58232	58237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_016786	TCT	2	6	59634	59639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_016786	GGA	2	6	71131	71136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_016786	CAA	2	6	102294	102299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_016786	GGT	2	6	102318	102323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_016786	AGC	2	6	102348	102353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_016786	AGT	2	6	102358	102363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016786	GTT	2	6	102372	102377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016786	TTG	3	9	102383	102391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016786	G	6	6	102411	102416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016786	GAA	2	6	104135	104140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016786	TA	3	6	104166	104171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016786	AT	3	6	104207	104212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016786	TGC	2	6	104303	104308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_016786	ACT	2	6	104314	104319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_016786	GC	3	6	108639	108644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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322	NC_016786	TCT	2	6	124566	124571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_016786	AGT	2	6	124620	124625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_016786	TCC	2	6	125231	125236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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404	NC_016786	TG	3	6	164932	164937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_016786	GTG	2	6	166436	166441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
412	NC_016786	TG	3	6	166507	166512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
413	NC_016786	AT	3	6	166537	166542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_016786	TA	3	6	166559	166564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_016786	TGG	2	6	166618	166623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_016786	CAA	2	6	166646	166651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_016786	ACC	2	6	166672	166677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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420	NC_016786	ACT	2	6	166777	166782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_016786	CAGG	2	8	173340	173347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
422	NC_016786	GTA	2	6	173381	173386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_016786	GGGC	2	8	173401	173408	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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