MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 5535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016786	GCT	2	6	517471	517476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016786	TTC	2	6	517481	517486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016786	TGG	2	6	517492	517497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016786	G	6	6	517502	517507	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016786	ATG	2	6	517525	517530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016786	TCG	2	6	517561	517566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016786	CGT	2	6	517610	517615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016786	ACTA	2	8	518569	518576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_016786	AAGG	2	8	518585	518592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016786	ATCC	2	8	518996	519003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_016786	CTG	2	6	519021	519026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_016786	GCT	2	6	520189	520194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016786	GTG	2	6	520248	520253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016786	TTC	2	6	520255	520260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016786	TAGC	2	8	520280	520287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_016786	GTC	2	6	520458	520463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_016786	AC	3	6	520489	520494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_016786	GACA	2	8	520683	520690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_016786	CA	3	6	522312	522317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_016786	GCA	2	6	522343	522348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_016786	GTA	2	6	523111	523116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016786	AGT	2	6	523128	523133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016786	ACC	2	6	524763	524768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_016786	AAAAAC	2	12	524810	524821	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1025	NC_016786	GCG	2	6	526784	526789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016786	GTTT	2	8	526810	526817	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016786	CTTC	2	8	526879	526886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_016786	CAT	2	6	527275	527280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016786	TAT	2	6	527980	527985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016786	GGA	2	6	528027	528032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016786	AGA	2	6	531019	531024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016786	GA	3	6	531023	531028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016786	AGT	2	6	533523	533528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016786	GTA	2	6	535237	535242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016786	CG	3	6	536279	536284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_016786	TGATG	2	10	536299	536308	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016786	TGC	2	6	537258	537263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016786	GGC	2	6	537292	537297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016786	AGCG	2	8	537312	537319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_016786	A	6	6	537333	537338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016786	T	6	6	537356	537361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016786	ATG	2	6	540545	540550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016786	T	6	6	546513	546518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016786	TGG	2	6	546538	546543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016786	ATTT	2	8	546563	546570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016786	GT	3	6	546587	546592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016786	GTC	2	6	546676	546681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_016786	AAT	2	6	546703	546708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016786	TTTTG	2	10	547922	547931	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016786	TGTCT	2	10	547941	547950	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_016786	GT	3	6	548622	548627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016786	GGT	2	6	549305	549310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016786	TTTA	2	8	549316	549323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016786	TTGA	2	8	551040	551047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016786	TTTC	2	8	551058	551065	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_016786	G	6	6	551076	551081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016786	GTC	2	6	551147	551152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_016786	AGAA	2	8	551242	551249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016786	GAG	2	6	551252	551257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016786	TG	3	6	553048	553053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016786	TGA	2	6	555156	555161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016786	TGT	2	6	556020	556025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016786	TTAT	2	8	556108	556115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016786	GCCTT	2	10	556156	556165	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_016786	AGGA	2	8	556177	556184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016786	TTCC	2	8	557189	557196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_016786	CTG	2	6	557231	557236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016786	CCA	2	6	557237	557242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_016786	CAG	2	6	557247	557252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_016786	TCG	2	6	558601	558606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016786	TTCC	2	8	558608	558615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_016786	GCAA	2	8	558632	558639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_016786	GTG	2	6	558728	558733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016786	GTTG	2	8	558748	558755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016786	GGGGCA	2	12	558777	558788	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1076	NC_016786	A	6	6	558790	558795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016786	TCG	2	6	558806	558811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_016786	TTCC	2	8	558813	558820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_016786	T	6	6	558823	558828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016786	TCA	2	6	561075	561080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_016786	GTA	2	6	561097	561102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016786	GAC	2	6	563472	563477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016786	GTA	2	6	563542	563547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016786	TTC	2	6	563791	563796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016786	CA	3	6	563867	563872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_016786	GTTTT	2	10	563894	563903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016786	GT	3	6	563931	563936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016786	CAA	2	6	566317	566322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_016786	AAC	2	6	566329	566334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_016786	ACA	2	6	566343	566348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_016786	AC	3	6	566356	566361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_016786	CA	3	6	568676	568681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_016786	CA	3	6	568684	568689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_016786	CA	3	6	568692	568697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_016786	CA	3	6	568700	568705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_016786	CA	3	6	568716	568721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_016786	CAC	2	6	568731	568736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_016786	GCT	2	6	568746	568751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_016786	TTC	2	6	568753	568758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_016786	GTC	2	6	572002	572007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016786	CTTTC	2	10	572736	572745	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1102	NC_016786	GGA	2	6	574096	574101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016786	T	6	6	575666	575671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016786	TGC	2	6	575750	575755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_016786	G	6	6	575784	575789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016786	TGT	2	6	575855	575860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016786	ACG	2	6	575897	575902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_016786	CGT	2	6	575948	575953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_016786	CTTT	2	8	576001	576008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_016786	CAG	2	6	579483	579488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_016786	CG	3	6	579506	579511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_016786	GCT	2	6	579525	579530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_016786	GT	3	6	579540	579545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016786	TAC	2	6	580788	580793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_016786	TGA	2	6	582703	582708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016786	TTC	2	6	582853	582858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016786	GAA	2	6	582893	582898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016786	TAT	2	6	582932	582937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016786	CGT	2	6	583016	583021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_016786	GT	3	6	583069	583074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016786	CTT	2	6	583829	583834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_016786	ATT	2	6	584000	584005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016786	CTTT	2	8	584006	584013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_016786	TGAGC	2	10	584046	584055	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_016786	TAGC	2	8	584060	584067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_016786	TG	3	6	584177	584182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016786	TTG	2	6	584183	584188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016786	GT	3	6	584200	584205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016786	CTCA	2	8	584252	584259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_016786	CTC	2	6	584298	584303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_016786	TGT	2	6	584307	584312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016786	TAAGCG	2	12	585494	585505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1133	NC_016786	TC	3	6	585520	585525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_016786	GGT	2	6	585541	585546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_016786	TGG	2	6	587792	587797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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