MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae CDCE 8392 chromosome

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016785	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016785	TCGAC	2	10	14721	14730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016785	CCGCA	2	10	35315	35324	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_016785	TTTTG	2	10	56113	56122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016785	GACTA	2	10	57353	57362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016785	TTTGA	2	10	57458	57467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016785	GCCTA	2	10	73061	73070	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016785	TCCAC	2	10	92728	92737	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016785	TGCAC	2	10	100788	100797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016785	GAGCG	2	10	101964	101973	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016785	GAGGC	2	10	106335	106344	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016785	CTGTT	2	10	106480	106489	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016785	TAATT	2	10	124838	124847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016785	TTAGC	2	10	126891	126900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016785	GAACA	2	10	149000	149009	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016785	TGGGG	2	10	205356	205365	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016785	TCCTG	2	10	205465	205474	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016785	TCCTG	2	10	206422	206431	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016785	TTGGG	2	10	221209	221218	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016785	AGCCA	2	10	221507	221516	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016785	CACGA	2	10	257537	257546	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016785	ATAAC	2	10	259702	259711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016785	GCGGT	2	10	280578	280587	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016785	TTTGG	2	10	292163	292172	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016785	ATGTT	2	10	292247	292256	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016785	TCCTT	2	10	312857	312866	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016785	TGATG	2	10	314433	314442	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016785	TGTGG	2	10	317590	317599	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016785	GTGCT	2	10	375289	375298	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016785	CACAC	2	10	377770	377779	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016785	TCTGC	2	10	403310	403319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016785	GGGGT	2	10	426797	426806	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016785	TATAA	2	10	434835	434844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016785	TGATG	2	10	453376	453385	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016785	TTTCC	2	10	460916	460925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016785	CCATT	2	10	461046	461055	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016785	GGGGT	2	10	465768	465777	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016785	CAGTG	2	10	473986	473995	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016785	ATTTT	2	10	484464	484473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016785	AGGAA	2	10	489199	489208	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016785	ACGAT	2	10	532948	532957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016785	TGGGG	2	10	542115	542124	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016785	TGATG	2	10	550396	550405	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016785	CACAA	2	10	557526	557535	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016785	TTTTG	2	10	562019	562028	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016785	GCCTT	2	10	571614	571623	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016785	CAGTT	2	10	573986	573995	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016785	GTTTT	2	10	579186	579195	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016785	CTTTC	2	10	587974	587983	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016785	TGAGC	2	10	599303	599312	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016785	AGCCA	2	10	606873	606882	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016785	GGGGA	2	10	609184	609193	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016785	TTTTG	2	10	609385	609394	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016785	GGGAA	2	10	652533	652542	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016785	GCACC	2	10	659241	659250	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_016785	CGACC	2	10	685905	685914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_016785	CGGTG	2	10	688295	688304	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016785	GCGCT	2	10	709208	709217	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016785	TCGTG	2	10	712542	712551	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016785	CGTCA	2	10	712878	712887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016785	GGGAG	2	10	713953	713962	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016785	AGCCA	2	10	715020	715029	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016785	TGGCA	2	10	716565	716574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016785	TAGTT	2	10	722847	722856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016785	ATGCG	2	10	723993	724002	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016785	GTCCA	2	10	744878	744887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016785	TAGTG	2	10	750822	750831	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016785	CCTGT	2	10	761101	761110	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016785	TGCTG	2	10	798292	798301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016785	GCCCA	2	10	806609	806618	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_016785	TTTCC	2	10	812055	812064	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016785	GGAGG	2	10	814067	814076	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016785	ATGGG	2	10	815174	815183	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016785	TGCAA	2	10	845621	845630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016785	ATTCG	2	10	845773	845782	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016785	GAAAG	2	10	847026	847035	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016785	TGGCG	2	10	855268	855277	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016785	ATTGG	2	10	939823	939832	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016785	GAGAA	2	10	975461	975470	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016785	TGGCT	2	10	993499	993508	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016785	GCACT	2	10	1011557	1011566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016785	GCCTC	2	10	1035700	1035709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_016785	GATCG	2	10	1056013	1056022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016785	AACCT	2	10	1056754	1056763	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016785	GATTC	2	10	1062463	1062472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016785	CACTA	2	10	1070651	1070660	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016785	ACACT	2	10	1094327	1094336	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016785	CATTT	2	10	1116951	1116960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016785	TCGTG	2	10	1123557	1123566	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016785	CGTCA	2	10	1123893	1123902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016785	GGGAG	2	10	1124968	1124977	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016785	AGCCA	2	10	1126035	1126044	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016785	TGGCA	2	10	1127579	1127588	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016785	TTTTC	2	10	1127783	1127792	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016785	TTCGT	2	10	1178755	1178764	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016785	CCTAC	2	10	1182433	1182442	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_016785	CCTTA	2	10	1206356	1206365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016785	TCAAG	2	10	1245404	1245413	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016785	AAAAG	2	10	1254007	1254016	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016785	GCCAT	2	10	1266612	1266621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016785	ACCGT	2	10	1266713	1266722	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016785	CGACG	2	10	1287802	1287811	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016785	CAAAT	2	10	1290797	1290806	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016785	AAAAT	2	10	1315378	1315387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016785	TCACT	2	10	1328761	1328770	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016785	TTTAT	2	10	1350173	1350182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016785	AATGT	2	10	1360146	1360155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016785	AGCAA	2	10	1376016	1376025	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016785	GAACG	2	10	1376124	1376133	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016785	TCTCT	2	10	1376215	1376224	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016785	TGTTT	2	10	1389239	1389248	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016785	GCATT	2	10	1391949	1391958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016785	AGAAT	2	10	1420951	1420960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016785	CGTAA	2	10	1421071	1421080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016785	AGTGG	2	10	1430572	1430581	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016785	AATTG	2	10	1430636	1430645	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016785	GCGCC	2	10	1430659	1430668	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_016785	ACAGT	2	10	1437905	1437914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016785	CAAAA	2	10	1442447	1442456	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016785	AAGTT	2	10	1499225	1499234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016785	GCAGC	2	10	1513534	1513543	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016785	AGACA	2	10	1522288	1522297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016785	CCCCA	2	10	1532332	1532341	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_016785	AGCAC	2	10	1558045	1558054	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016785	TTCGT	2	10	1561496	1561505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016785	CTTTA	2	10	1583157	1583166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016785	ACCAA	2	10	1598645	1598654	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016785	AGAAA	2	10	1627602	1627611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016785	TTTAT	2	10	1630381	1630390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016785	CGTTT	2	10	1632597	1632606	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016785	CATCT	2	10	1644985	1644994	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016785	TTAGG	2	10	1646908	1646917	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016785	AGAAA	2	10	1665251	1665260	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016785	TTCAA	2	10	1690336	1690345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016785	TTGCG	2	10	1704352	1704361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016785	AGAAA	2	10	1743584	1743593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016785	GTGTG	2	10	1744749	1744758	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016785	CAACG	2	10	1750743	1750752	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_016785	GCGAC	2	10	1752359	1752368	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_016785	CCCCA	2	10	1761542	1761551	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
141	NC_016785	CAAAG	2	10	1767263	1767272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016785	CAACG	2	10	1767748	1767757	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_016785	TTTCT	2	10	1784886	1784895	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016785	TCCCC	2	10	1792857	1792866	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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194	NC_016785	GTGCA	2	10	2169706	2169715	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_016785	GCGGG	2	10	2198989	2198998	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
197	NC_016785	TACCC	2	10	2217929	2217938	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
198	NC_016785	TTCTA	2	10	2236329	2236338	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_016785	CACAT	2	10	2261416	2261425	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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208	NC_016785	TGACG	2	10	2321841	2321850	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
209	NC_016785	CACGA	2	10	2322177	2322186	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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225	NC_016785	ACCGC	2	10	2431812	2431821	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
226	NC_016785	AAAAT	2	10	2433044	2433053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.