MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae INCA 402 chromosome

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016783	TAATCC	2	12	12940	12951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016783	TACTGC	2	12	19589	19600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016783	GGGGAT	2	12	20145	20156	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016783	TGGTTT	2	12	56597	56608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016783	GCGCTG	2	12	92288	92299	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016783	GTCATC	2	12	101718	101729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016783	CACTTC	2	12	148242	148253	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016783	AAAACA	2	12	180558	180569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016783	CCTATT	2	12	233674	233685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016783	GCCACC	2	12	285364	285375	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016783	TTATGG	2	12	334559	334570	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016783	ACAAGG	2	12	411877	411888	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016783	CGCTAT	2	12	458595	458606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016783	GGGGTG	2	12	474167	474178	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016783	GCACCT	2	12	477596	477607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016783	GGGGCA	2	12	562706	562717	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016783	TAAGCG	2	12	590794	590805	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016783	CTCCAA	2	12	599378	599389	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016783	GCCTCG	2	12	681094	681105	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016783	GTTTGG	2	12	684292	684303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016783	AGCGAA	2	12	708519	708530	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016783	GCGTAG	2	12	711239	711250	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016783	TGGGTG	2	12	711435	711446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016783	ATGTGG	2	12	937557	937568	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016783	ATGGAT	2	12	1069685	1069696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016783	TTGCGC	2	12	1076864	1076875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016783	CTGGAA	3	18	1088457	1088474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016783	AGCGAA	2	12	1135217	1135228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016783	GACAGT	2	12	1201392	1201403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016783	TTGAGG	2	12	1205868	1205879	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016783	AAAAAC	2	12	1259383	1259394	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016783	ACCAGC	2	12	1395183	1395194	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016783	ACAGAA	2	12	1401950	1401961	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016783	TCGCCC	2	12	1461343	1461354	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016783	TCAATG	2	12	1462413	1462424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016783	CTGCAT	2	12	1504650	1504661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016783	TGCAGC	2	12	1511436	1511447	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016783	CCAGCC	2	12	1559657	1559668	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016783	AGGCCG	2	12	1574491	1574502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016783	CAGCGC	2	12	1576250	1576261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016783	CTGCCC	2	12	1576267	1576278	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016783	GCTGTG	4	24	1792687	1792710	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016783	CACACC	2	12	1910555	1910566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016783	TTCGCT	2	12	1913298	1913309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016783	TGCCAC	2	12	2081811	2081822	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016783	GCCTAC	2	12	2143802	2143813	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016783	TTCGCT	2	12	2146528	2146539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016783	GGGTTT	2	12	2176286	2176297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016783	AAAGGA	2	12	2250781	2250792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016783	ACGCCA	2	12	2258850	2258861	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016783	GCCTAC	2	12	2315457	2315468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016783	TTCGCT	2	12	2318181	2318192	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016783	ATTGTT	2	12	2327072	2327083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016783	CATCGA	2	12	2378238	2378249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016783	TCCCTT	2	12	2397154	2397165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016783	CGCCAT	2	12	2397209	2397220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.