MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 6489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016781	CAA	2	6	1180588	1180593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_016781	TAAT	2	8	1180672	1180679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016781	AGA	2	6	1182852	1182857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016781	TTA	2	6	1182879	1182884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016781	TAAA	2	8	1182890	1182897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016781	ACC	2	6	1182905	1182910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_016781	TCT	2	6	1182941	1182946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_016781	CGG	2	6	1184639	1184644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_016781	TGG	2	6	1184706	1184711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016781	ATA	2	6	1186891	1186896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016781	TCAG	2	8	1186941	1186948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_016781	TTC	2	6	1191275	1191280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_016781	ATTC	2	8	1191342	1191349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_016781	AC	3	6	1191361	1191366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_016781	AACC	2	8	1191393	1191400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_016781	ATC	2	6	1191416	1191421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_016781	TAA	2	6	1191486	1191491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016781	TTC	2	6	1191492	1191497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_016781	CCA	2	6	1191502	1191507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_016781	GTA	2	6	1196285	1196290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016781	AAGG	2	8	1196295	1196302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016781	T	6	6	1196345	1196350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016781	TTA	2	6	1196360	1196365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016781	TCC	2	6	1197343	1197348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_016781	TCA	2	6	1197378	1197383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016781	T	6	6	1197438	1197443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016781	CTT	2	6	1197525	1197530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_016781	ATTA	2	8	1197586	1197593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016781	GAA	2	6	1197609	1197614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016781	CTTT	2	8	1197648	1197655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3031	NC_016781	CAAA	2	8	1197676	1197683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_016781	GGAC	2	8	1197701	1197708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_016781	TCA	2	6	1199814	1199819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_016781	TCA	2	6	1201006	1201011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_016781	AAT	2	6	1201103	1201108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016781	GTAG	2	8	1201115	1201122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016781	TGAA	2	8	1201135	1201142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016781	CAGA	2	8	1204506	1204513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_016781	CAC	2	6	1204869	1204874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_016781	AAGCTC	2	12	1207591	1207602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_016781	ATG	2	6	1207637	1207642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016781	CTTT	2	8	1207649	1207656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_016781	ACT	2	6	1207681	1207686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_016781	ATG	2	6	1208588	1208593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016781	TCG	2	6	1209827	1209832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_016781	TGC	2	6	1209837	1209842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_016781	AGA	2	6	1209950	1209955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016781	ATC	2	6	1211012	1211017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_016781	GAA	2	6	1211022	1211027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016781	T	6	6	1211127	1211132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016781	ACC	2	6	1211159	1211164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_016781	TGT	2	6	1211196	1211201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016781	CA	3	6	1211230	1211235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_016781	GGA	2	6	1211260	1211265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_016781	TTG	2	6	1211293	1211298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016781	AGCT	2	8	1212415	1212422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_016781	ACT	2	6	1212457	1212462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_016781	AGA	2	6	1213322	1213327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016781	CGT	2	6	1213333	1213338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_016781	AGA	2	6	1213364	1213369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016781	CGC	2	6	1213417	1213422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_016781	AGTC	2	8	1217196	1217203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_016781	GCT	2	6	1217216	1217221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_016781	GTT	2	6	1217224	1217229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016781	TC	3	6	1217230	1217235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_016781	ACG	2	6	1217281	1217286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_016781	GAT	2	6	1219131	1219136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016781	TCC	2	6	1219787	1219792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_016781	TGC	2	6	1219815	1219820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_016781	AC	3	6	1219856	1219861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_016781	AAG	2	6	1221690	1221695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016781	A	6	6	1221726	1221731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016781	CTT	2	6	1224196	1224201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_016781	T	6	6	1224756	1224761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016781	CTG	2	6	1224805	1224810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_016781	CTTT	2	8	1224835	1224842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_016781	ACC	2	6	1226948	1226953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_016781	GAA	2	6	1226976	1226981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016781	CTTA	2	8	1228223	1228230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_016781	ATA	2	6	1228306	1228311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016781	TAA	2	6	1228326	1228331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016781	GAA	2	6	1228341	1228346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016781	GAA	2	6	1229658	1229663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016781	TG	3	6	1230092	1230097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016781	CTG	2	6	1230113	1230118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_016781	TCC	2	6	1231045	1231050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_016781	TAT	2	6	1231062	1231067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_016781	CTA	2	6	1231374	1231379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_016781	CCT	2	6	1239857	1239862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_016781	CT	3	6	1239870	1239875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_016781	AT	3	6	1239902	1239907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016781	TAG	2	6	1240030	1240035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016781	TTG	2	6	1240101	1240106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016781	TCT	2	6	1240153	1240158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_016781	CAC	2	6	1240159	1240164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_016781	TCG	2	6	1242629	1242634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_016781	AACT	2	8	1242683	1242690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_016781	CTT	2	6	1243914	1243919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_016781	CTT	2	6	1245199	1245204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_016781	TC	3	6	1249284	1249289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_016781	CCT	2	6	1250193	1250198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_016781	CAG	2	6	1250265	1250270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_016781	CTGAA	2	10	1252049	1252058	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3104	NC_016781	ATA	2	6	1252156	1252161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016781	CA	3	6	1252219	1252224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_016781	TGCGC	2	10	1252338	1252347	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3107	NC_016781	TTG	2	6	1255044	1255049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016781	AGC	2	6	1255080	1255085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_016781	CTT	2	6	1255134	1255139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_016781	CTA	2	6	1255171	1255176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_016781	ATTCC	2	10	1255198	1255207	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3112	NC_016781	CTC	3	9	1256610	1256618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_016781	AG	3	6	1256667	1256672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016781	AG	3	6	1256697	1256702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016781	TAA	2	6	1256742	1256747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016781	CTC	2	6	1258127	1258132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_016781	TGC	2	6	1258143	1258148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_016781	CAAA	2	8	1258176	1258183	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_016781	GAT	3	9	1258192	1258200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016781	CG	3	6	1260128	1260133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_016781	CTT	2	6	1260324	1260329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_016781	CCT	2	6	1261272	1261277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_016781	CTC	2	6	1264082	1264087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_016781	CTGT	2	8	1267033	1267040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_016781	GCA	2	6	1269765	1269770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_016781	CAT	2	6	1269811	1269816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_016781	CAAA	2	8	1269837	1269844	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_016781	ACTT	2	8	1269846	1269853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_016781	TGA	2	6	1269902	1269907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_016781	GATT	2	8	1270844	1270851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_016781	CCG	2	6	1270889	1270894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_016781	CTT	2	6	1270895	1270900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_016781	AAT	2	6	1270914	1270919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_016781	TAA	2	6	1270926	1270931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_016781	CTA	2	6	1270958	1270963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3139	NC_016781	CTG	2	6	1271284	1271289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3141	NC_016781	CTAC	2	8	1272013	1272020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3163	NC_016781	CTTAA	2	10	1277699	1277708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3164	NC_016781	AATT	2	8	1278066	1278073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_016781	CGA	2	6	1318801	1318806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3259	NC_016781	TCC	2	6	1318900	1318905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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