MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 6489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016781	ACT	2	6	2211940	2211945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_016781	CAA	2	6	2211962	2211967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_016781	ACC	2	6	2212001	2212006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_016781	CTT	2	6	2212032	2212037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_016781	CTC	2	6	2212066	2212071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_016781	CAG	2	6	2212090	2212095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016781	CCCT	2	8	2212178	2212185	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6008	NC_016781	ACTG	2	8	2212273	2212280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_016781	CAG	2	6	2212318	2212323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_016781	GAGCA	2	10	2212354	2212363	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6011	NC_016781	CAT	2	6	2212372	2212377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_016781	ACC	2	6	2212442	2212447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_016781	GGCT	2	8	2212491	2212498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_016781	AGA	2	6	2212521	2212526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016781	TTC	2	6	2212561	2212566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_016781	GCG	2	6	2212576	2212581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_016781	CGATGC	2	12	2212591	2212602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_016781	T	6	6	2212653	2212658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016781	GAA	2	6	2212670	2212675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016781	TCTT	2	8	2212680	2212687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_016781	TCT	2	6	2212695	2212700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_016781	TCC	2	6	2212713	2212718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_016781	GTC	2	6	2212772	2212777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_016781	CGA	2	6	2212843	2212848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016781	CCG	2	6	2212854	2212859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_016781	CCG	2	6	2212890	2212895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_016781	AGC	2	6	2213073	2213078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_016781	CAT	2	6	2213084	2213089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_016781	CGTC	2	8	2213145	2213152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_016781	GTG	2	6	2213229	2213234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016781	GTT	2	6	2213276	2213281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016781	TGA	2	6	2213284	2213289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016781	GAA	2	6	2213309	2213314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016781	GAC	2	6	2213315	2213320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_016781	GAA	2	6	2213321	2213326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016781	CTG	2	6	2213360	2213365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_016781	TTG	2	6	2213382	2213387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016781	TCT	2	6	2213392	2213397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_016781	TTA	2	6	2213464	2213469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016781	AAC	2	6	2213497	2213502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_016781	ACA	2	6	2213523	2213528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_016781	CAG	2	6	2213562	2213567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_016781	CGC	2	6	2215233	2215238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_016781	CAG	2	6	2215316	2215321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_016781	ACG	2	6	2216799	2216804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_016781	CCA	2	6	2216882	2216887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_016781	AT	3	6	2216906	2216911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_016781	CA	3	6	2216985	2216990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_016781	GTT	2	6	2216995	2217000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016781	GA	3	6	2217044	2217049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016781	TACG	2	8	2217056	2217063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_016781	AAC	2	6	2217073	2217078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_016781	T	6	6	2217776	2217781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016781	T	6	6	2218024	2218029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_016781	ATA	2	6	2218065	2218070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016781	CAC	2	6	2218581	2218586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_016781	GC	3	6	2218589	2218594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_016781	TGA	2	6	2219246	2219251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016781	CTTT	2	8	2219258	2219265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_016781	AC	3	6	2219296	2219301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_016781	AACT	2	8	2219302	2219309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_016781	GTAA	2	8	2219322	2219329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_016781	AGAT	2	8	2219368	2219375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016781	AGGT	2	8	2222425	2222432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016781	AGT	2	6	2222436	2222441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016781	ACT	2	6	2222466	2222471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_016781	TAC	2	6	2222497	2222502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_016781	TCG	2	6	2222546	2222551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_016781	CTTC	2	8	2224431	2224438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_016781	TAA	2	6	2224451	2224456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_016781	TAC	2	6	2224470	2224475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_016781	ACT	2	6	2224481	2224486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_016781	CAG	2	6	2224499	2224504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_016781	ACGAT	2	10	2224589	2224598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6075	NC_016781	GAG	2	6	2225350	2225355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_016781	TTG	2	6	2225374	2225379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_016781	AAT	2	6	2225655	2225660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_016781	TAC	2	6	2225714	2225719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_016781	AGGCT	2	10	2225725	2225734	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6080	NC_016781	ACG	2	6	2225819	2225824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_016781	AT	3	6	2225831	2225836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016781	CGA	2	6	2225873	2225878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_016781	ATA	2	6	2225943	2225948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_016781	GCAA	2	8	2225977	2225984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_016781	CTA	2	6	2226935	2226940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_016781	ACCC	2	8	2226951	2226958	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6087	NC_016781	TGG	2	6	2226961	2226966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_016781	CA	3	6	2227002	2227007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_016781	TAC	2	6	2227033	2227038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_016781	AGG	2	6	2228206	2228211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_016781	GGGT	2	8	2228236	2228243	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_016781	AC	3	6	2228252	2228257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_016781	CACC	2	8	2228267	2228274	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6094	NC_016781	GGC	2	6	2228300	2228305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_016781	ACC	2	6	2228404	2228409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_016781	ACA	2	6	2228421	2228426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_016781	CATGT	2	10	2228437	2228446	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_016781	CAA	2	6	2228471	2228476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_016781	T	6	6	2228488	2228493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016781	CA	4	8	2228518	2228525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_016781	GTT	2	6	2228530	2228535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016781	CGTA	2	8	2228681	2228688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_016781	CGTC	2	8	2228735	2228742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_016781	CTT	2	6	2228768	2228773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_016781	CGG	2	6	2228790	2228795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_016781	ACG	2	6	2228815	2228820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_016781	CGA	2	6	2228895	2228900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_016781	CAC	2	6	2229090	2229095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_016781	AGG	2	6	2229146	2229151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016781	CCA	2	6	2229173	2229178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_016781	CCA	2	6	2229256	2229261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_016781	GCG	2	6	2229268	2229273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_016781	CG	3	6	2229364	2229369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_016781	CAG	2	6	2229420	2229425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_016781	ACC	2	6	2229501	2229506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_016781	TAA	2	6	2229640	2229645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016781	ACC	2	6	2229672	2229677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_016781	CAA	2	6	2229700	2229705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_016781	ACC	2	6	2229792	2229797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_016781	A	6	6	2229875	2229880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016781	AGC	2	6	2229908	2229913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_016781	CTA	2	6	2230001	2230006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_016781	CA	4	8	2230030	2230037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_016781	CA	3	6	2230040	2230045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_016781	CAC	2	6	2230090	2230095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_016781	CAC	2	6	2230105	2230110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_016781	CGG	2	6	2230218	2230223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_016781	CA	3	6	2230272	2230277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_016781	CAC	2	6	2230304	2230309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_016781	ACG	2	6	2230314	2230319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_016781	CAAC	2	8	2230330	2230337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_016781	CGG	2	6	2230360	2230365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_016781	GCT	2	6	2230440	2230445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_016781	CCT	2	6	2230456	2230461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6135	NC_016781	CAAC	2	8	2230639	2230646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6149	NC_016781	CA	3	6	2231295	2231300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6150	NC_016781	CGTT	2	8	2231347	2231354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6153	NC_016781	CA	3	6	2231462	2231467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6154	NC_016781	A	6	6	2231597	2231602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6157	NC_016781	A	6	6	2231623	2231628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6158	NC_016781	ATT	2	6	2231653	2231658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6160	NC_016781	ACC	2	6	2231693	2231698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6164	NC_016781	CAC	2	6	2231728	2231733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6165	NC_016781	CAA	2	6	2231739	2231744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6166	NC_016781	CAT	2	6	2231772	2231777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6168	NC_016781	AAC	2	6	2231809	2231814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6169	NC_016781	CAACA	2	10	2231827	2231836	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6170	NC_016781	CA	3	6	2231835	2231840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6171	NC_016781	ACA	3	9	2231838	2231846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6172	NC_016781	CA	3	6	2231853	2231858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6173	NC_016781	CCA	2	6	2231870	2231875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6254	NC_016781	GACGC	2	10	2246064	2246073	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6258	NC_016781	ATA	2	6	2248431	2248436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_016781	ATGCA	2	10	2248526	2248535	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6260	NC_016781	AATA	2	8	2248557	2248564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_016781	CAT	2	6	2248576	2248581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_016781	GCA	2	6	2248584	2248589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6264	NC_016781	CCAT	2	8	2248633	2248640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6397	NC_016781	CCA	2	6	2298926	2298931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6398	NC_016781	AGC	2	6	2299084	2299089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6399	NC_016781	AGC	2	6	2299096	2299101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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