MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	AAATAA	2	12	4917	4928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016627	GTAAAG	2	12	11316	11327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016627	TTTATT	2	12	12979	12990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016627	TCTTAA	2	12	14974	14985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016627	CTTATA	2	12	26283	26294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016627	TGAAAA	2	12	26359	26370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016627	TATTTT	2	12	34441	34452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016627	ATTTTT	2	12	46496	46507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016627	TGGAAT	2	12	105597	105608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016627	TTTATC	2	12	109739	109750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016627	TATAAA	2	12	129087	129098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016627	TTTATA	2	12	142343	142354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016627	TAAAAA	2	12	154538	154549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016627	GAATAT	2	12	164153	164164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016627	AATTGA	2	12	169835	169846	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016627	ACAAAA	2	12	171750	171761	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016627	AATTAA	2	12	179122	179133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016627	ATAAAA	2	12	179988	179999	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016627	GATAAA	2	12	185439	185450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016627	TTTTAA	2	12	189684	189695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016627	TAGATA	2	12	209328	209339	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016627	GTTTTA	2	12	222589	222600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016627	AAGAAA	2	12	223084	223095	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016627	TAAAAA	2	12	224915	224926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016627	AGAAAA	2	12	225930	225941	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016627	AAAGGG	2	12	231384	231395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016627	AAGAAT	2	12	236375	236386	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016627	AAAATG	2	12	236546	236557	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016627	TAAAAA	2	12	329663	329674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016627	TAGTAT	2	12	333714	333725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016627	TATTAA	2	12	342299	342310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016627	ATAAAT	2	12	342337	342348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016627	GATGAG	2	12	364972	364983	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016627	GAAGAG	2	12	367814	367825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016627	TCTCCT	2	12	384825	384836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016627	TTATAA	2	12	400331	400342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016627	GTTGAA	2	12	412316	412327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016627	AAAAAT	2	12	412993	413004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016627	GACAAA	2	12	421951	421962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016627	ATTTTA	2	12	421989	422000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016627	TTTAAC	2	12	425284	425295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016627	TAAATA	2	12	426616	426627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016627	TAAAGT	2	12	441906	441917	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016627	TTACGA	2	12	447787	447798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016627	AAATAA	2	12	448838	448849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016627	TTTATT	2	12	483265	483276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016627	TGTTTT	2	12	494254	494265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016627	TTTATA	2	12	507231	507242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016627	ATTAAT	2	12	510424	510435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016627	TCTGCT	2	12	510779	510790	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016627	GAAAAA	2	12	510869	510880	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016627	AATTAT	2	12	511269	511280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016627	GGAATG	2	12	513558	513569	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016627	GTTTTA	2	12	527817	527828	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016627	TATTTA	2	12	531344	531355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016627	GAAAAA	2	12	540182	540193	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016627	TTTAAA	2	12	549673	549684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016627	CTCATC	2	12	560862	560873	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016627	AATTAA	2	12	564130	564141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016627	CGTATC	2	12	570982	570993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016627	CAAAAC	2	12	582214	582225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016627	AAAGTG	2	12	585434	585445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016627	CAAATA	2	12	606750	606761	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016627	TTAATA	2	12	615487	615498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016627	AGTGGC	2	12	627226	627237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016627	GTGAGA	2	12	671152	671163	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016627	TAGATT	2	12	675474	675485	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016627	ACTGGT	2	12	714673	714684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016627	ATGACC	2	12	716528	716539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016627	TATTTG	2	12	719692	719703	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016627	TGAATA	2	12	744018	744029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016627	CTATGT	2	12	761985	761996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016627	AAAAAT	2	12	791814	791825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016627	ATAAAA	2	12	792140	792151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016627	GCTTCC	2	12	798614	798625	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016627	ATTGAA	2	12	812656	812667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016627	TACTGA	2	12	813528	813539	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016627	TATATT	2	12	816823	816834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016627	GATGAG	2	12	822293	822304	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016627	TGCTAT	2	12	842328	842339	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016627	ATACAT	2	12	852104	852115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016627	TTTTAT	2	12	908079	908090	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016627	CAAAAC	2	12	924149	924160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016627	ATTTTG	2	12	936048	936059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016627	CGAATT	2	12	937585	937596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_016627	TTACAG	2	12	942978	942989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016627	CAAAAC	2	12	949575	949586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016627	ACTATG	2	12	952020	952031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016627	CTCATC	2	12	954064	954075	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016627	GAATTT	2	12	954820	954831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016627	AAGTAA	2	12	972548	972559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016627	AAATTC	2	12	978812	978823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016627	ATAATT	2	12	979390	979401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016627	ATGAAG	2	12	980926	980937	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016627	AAGCTG	2	12	981771	981782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016627	TTAGAT	2	12	982995	983006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016627	ATAAAG	2	12	1008600	1008611	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016627	CAAAAA	2	12	1011696	1011707	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016627	CTCATC	2	12	1011888	1011899	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016627	TTACAG	2	12	1016131	1016142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016627	TTAATA	2	12	1021568	1021579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016627	ATGATA	2	12	1021668	1021679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016627	GTAATG	2	12	1028052	1028063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016627	TAAAAT	2	12	1035438	1035449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016627	GATATT	2	12	1035850	1035861	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016627	GATTTT	2	12	1046852	1046863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016627	TTTGGT	2	12	1061495	1061506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016627	TGCTTA	2	12	1072315	1072326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016627	ATAATG	2	12	1087026	1087037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016627	ATGATA	2	12	1087539	1087550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016627	CTCATC	2	12	1095436	1095447	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016627	AATTAA	2	12	1098054	1098065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016627	TTTTGG	2	12	1105454	1105465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016627	GGAAGA	2	12	1140897	1140908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016627	ATTTAT	2	12	1151784	1151795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016627	TATTAA	2	12	1156789	1156800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016627	ATTTTA	2	12	1158335	1158346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016627	ATTTGC	2	12	1159791	1159802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016627	TATGTT	2	12	1176523	1176534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016627	GATTTT	2	12	1194732	1194743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016627	AATATA	2	12	1228796	1228807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016627	CTTTAT	2	12	1242729	1242740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016627	CAAAAA	2	12	1249827	1249838	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016627	CTCATC	2	12	1250019	1250030	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016627	TTTAAA	2	12	1279666	1279677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016627	TAAATA	2	12	1304113	1304124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016627	TATTAA	2	12	1321884	1321895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016627	GAAAAA	2	12	1322786	1322797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016627	ATGGAG	2	12	1359611	1359622	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016627	GCTCCT	2	12	1363553	1363564	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016627	GCTCCT	2	12	1365554	1365565	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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256	NC_016627	ATTTAT	2	12	2836867	2836878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.