MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 26566

< Previous12...42434445464748495051525354Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_016627	CTT	2	6	4885776	4885781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26502	NC_016627	TGC	2	6	4885796	4885801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26503	NC_016627	CTG	2	6	4885835	4885840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26504	NC_016627	TCG	2	6	4885910	4885915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26505	NC_016627	GTTAT	2	10	4886008	4886017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26506	NC_016627	TG	3	6	4886053	4886058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26507	NC_016627	CCG	2	6	4886089	4886094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26508	NC_016627	GTT	2	6	4886188	4886193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26509	NC_016627	CGC	2	6	4886278	4886283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26510	NC_016627	CT	3	6	4886311	4886316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26511	NC_016627	A	7	7	4886317	4886323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26512	NC_016627	TTAC	2	8	4886391	4886398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26513	NC_016627	TTCCT	2	10	4886437	4886446	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26514	NC_016627	GCGA	2	8	4886501	4886508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26515	NC_016627	TA	3	6	4886513	4886518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26516	NC_016627	T	7	7	4886548	4886554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26517	NC_016627	T	7	7	4886556	4886562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26518	NC_016627	TGC	2	6	4886576	4886581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26519	NC_016627	TAA	2	6	4886623	4886628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26520	NC_016627	ATT	2	6	4886643	4886648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26521	NC_016627	TAA	2	6	4886657	4886662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26522	NC_016627	CT	3	6	4886666	4886671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26523	NC_016627	AT	3	6	4886688	4886693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26524	NC_016627	TCT	2	6	4886712	4886717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26525	NC_016627	TAAA	2	8	4886759	4886766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26526	NC_016627	AGA	2	6	4886788	4886793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26527	NC_016627	AAT	2	6	4886811	4886816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26528	NC_016627	AGTA	2	8	4886832	4886839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26529	NC_016627	TC	3	6	4886892	4886897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26530	NC_016627	AAT	2	6	4886898	4886903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26531	NC_016627	TA	3	6	4886906	4886911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26532	NC_016627	ATT	2	6	4886978	4886983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26533	NC_016627	TAT	2	6	4889550	4889555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26534	NC_016627	AT	4	8	4889578	4889585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26535	NC_016627	TAA	2	6	4889588	4889593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26536	NC_016627	T	6	6	4889614	4889619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26537	NC_016627	TTA	2	6	4889626	4889631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26538	NC_016627	CTTA	2	8	4889638	4889645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26539	NC_016627	ATAA	2	8	4889665	4889672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26540	NC_016627	T	6	6	4889761	4889766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26541	NC_016627	ATT	2	6	4890739	4890744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26542	NC_016627	ATA	2	6	4890764	4890769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26543	NC_016627	T	8	8	4890793	4890800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26544	NC_016627	TCGT	2	8	4890811	4890818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26545	NC_016627	TAAT	2	8	4891592	4891599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26546	NC_016627	ATTT	2	8	4891618	4891625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26547	NC_016627	TGT	2	6	4891631	4891636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26548	NC_016627	TCC	2	6	4894973	4894978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26549	NC_016627	AAAT	2	8	4894989	4894996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26550	NC_016627	CA	3	6	4895001	4895006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26551	NC_016627	TAT	2	6	4895017	4895022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26552	NC_016627	A	6	6	4895029	4895034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26553	NC_016627	AATT	2	8	4895044	4895051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26554	NC_016627	AAT	2	6	4895074	4895079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26555	NC_016627	TTAT	2	8	4895106	4895113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26556	NC_016627	AAT	2	6	4895120	4895125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26557	NC_016627	TTA	2	6	4895149	4895154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26558	NC_016627	T	6	6	4897255	4897260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26559	NC_016627	TAA	2	6	4897287	4897292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26560	NC_016627	TAT	3	9	4897293	4897301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26561	NC_016627	ATA	2	6	4897306	4897311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26562	NC_016627	TTTA	2	8	4897568	4897575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26563	NC_016627	T	7	7	4897582	4897588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26564	NC_016627	AAAT	2	8	4897590	4897597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26565	NC_016627	CTT	2	6	4897601	4897606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26566	NC_016627	AAT	2	6	4897616	4897621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...42434445464748495051525354Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.