MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016025	GGCCG	2	10	1803	1812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016025	GGCCG	2	10	6388	6397	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016025	GTGGC	2	10	15310	15319	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016025	ACTGC	2	10	15389	15398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016025	GTTTT	2	10	37836	37845	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016025	GCGCG	2	10	53809	53818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016025	GACGG	2	10	53931	53940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016025	CCTTC	2	10	60440	60449	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016025	TTGAA	2	10	60594	60603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016025	CGGAA	2	10	61513	61522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016025	GTGAT	2	10	69815	69824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016025	TGGGG	2	10	77261	77270	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016025	GCCCG	2	10	83772	83781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_016025	GGTAA	2	10	84802	84811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016025	GCCGG	2	10	93750	93759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016025	CCCCG	2	10	94659	94668	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17	NC_016025	CTGCG	2	10	97079	97088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016025	AGGTG	2	10	102567	102576	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016025	GTGCA	2	10	116784	116793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016025	TTGGA	2	10	116796	116805	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016025	GGTAA	2	10	118006	118015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016025	TTCCT	2	10	127716	127725	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016025	GTCTT	2	10	129124	129133	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016025	CAGTT	2	10	158315	158324	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016025	AGGCA	2	10	159924	159933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016025	AGGCA	2	10	170728	170737	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016025	GGGAA	2	10	184089	184098	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016025	ACGGC	2	10	193680	193689	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016025	GCCGT	2	10	224207	224216	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016025	GCTCT	2	10	224764	224773	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016025	GTGGA	2	10	225245	225254	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016025	TGGCA	2	10	225313	225322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016025	TGCTT	2	10	225589	225598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016025	ACTCC	2	10	230899	230908	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_016025	AGAGC	2	10	238921	238930	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016025	GCCTG	2	10	242860	242869	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016025	CCTGA	2	10	245828	245837	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016025	AACGG	2	10	247616	247625	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016025	AACTG	2	10	257137	257146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016025	GTTCA	2	10	315060	315069	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016025	TTCCT	2	10	323753	323762	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016025	AAGGG	2	10	345765	345774	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016025	GCCCC	2	10	353137	353146	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
44	NC_016025	AAAGC	2	10	353380	353389	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016025	GCCCG	2	10	364135	364144	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_016025	CCCAA	2	10	378477	378486	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_016025	ACCAT	2	10	378652	378661	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016025	TGCAC	2	10	389990	389999	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_016025	CTTCC	2	10	400185	400194	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_016025	CCCCA	2	10	408852	408861	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_016025	TGTGG	2	10	408885	408894	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016025	TAACC	2	10	423446	423455	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016025	TGGGT	2	10	423943	423952	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016025	GTTTC	2	10	427162	427171	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016025	TCCCC	2	10	428232	428241	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
56	NC_016025	GGACA	2	10	428299	428308	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016025	AATTC	2	10	464544	464553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016025	AATTC	2	10	464770	464779	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016025	CACAG	2	10	466325	466334	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016025	AAAGT	2	10	499607	499616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016025	GTTGG	2	10	514686	514695	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016025	CCTGA	2	10	517561	517570	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016025	TAACG	2	10	522884	522893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016025	GGCCG	2	10	522901	522910	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016025	GCACT	2	10	525588	525597	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016025	CACGT	2	10	550830	550839	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016025	CTGCT	2	10	559590	559599	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016025	ACCAG	2	10	559723	559732	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016025	AGGGC	2	10	564462	564471	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016025	CCGGG	2	10	564674	564683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016025	GTCAG	2	10	572344	572353	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016025	TCTTT	2	10	585489	585498	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016025	TTGCG	2	10	601829	601838	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016025	GCAAA	2	10	601865	601874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016025	CTATC	2	10	607520	607529	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016025	GCACG	2	10	607816	607825	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016025	GCGCT	2	10	618990	618999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016025	GGTTT	2	10	619147	619156	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016025	AGGAA	2	10	624313	624322	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016025	ACGCT	2	10	636809	636818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016025	TTTCA	2	10	656203	656212	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016025	CGGCG	2	10	666068	666077	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016025	ATGCC	2	10	682383	682392	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016025	AGGAA	2	10	685802	685811	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016025	TGTGG	2	10	696426	696435	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016025	GCAAC	2	10	746346	746355	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016025	TTTCC	2	10	751975	751984	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016025	CGTGT	2	10	752223	752232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016025	TCCTG	2	10	761867	761876	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016025	CCGGC	2	10	794172	794181	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_016025	CCGGG	2	10	807144	807153	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016025	TGACC	2	10	807964	807973	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016025	TAAAA	2	10	814601	814610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016025	GGCAG	2	10	814723	814732	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016025	GTTAT	2	10	815102	815111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016025	GAATT	2	10	816952	816961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016025	GTTAT	2	10	817257	817266	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016025	AGATG	2	10	817546	817555	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016025	ACTTA	2	10	817878	817887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016025	TCCAG	2	10	818104	818113	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016025	GGCAG	2	10	818181	818190	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016025	CAAAG	2	10	846311	846320	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016025	CGCAG	2	10	851107	851116	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016025	GGAAG	2	10	861558	861567	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016025	GGAAG	2	10	861594	861603	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016025	TCCTG	2	10	865534	865543	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_016025	CTGAC	2	10	866076	866085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016025	TTCCT	2	10	876898	876907	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016025	CAGTG	2	10	893896	893905	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016025	GTGCA	2	10	900747	900756	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016025	CTTTC	2	10	912464	912473	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016025	GAACC	2	10	933372	933381	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016025	ACGGC	2	10	958241	958250	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016025	CGGCG	2	10	959125	959134	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_016025	CGCTG	2	10	962507	962516	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016025	CGACA	2	10	987033	987042	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016025	GACAA	2	10	988567	988576	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016025	CCGGG	2	10	992866	992875	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016025	GAAAG	2	10	1002302	1002311	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016025	CTCTT	2	10	1010962	1010971	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.