MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 2469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016025	TGG	2	6	613552	613557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016025	AT	3	6	613575	613580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016025	AGGG	2	8	613591	613598	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016025	AT	3	6	613619	613624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016025	TGG	2	6	613625	613630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016025	CAG	2	6	613644	613649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016025	TG	3	6	613684	613689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016025	GCGG	2	8	613709	613716	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_016025	TGG	2	6	613721	613726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016025	GGC	2	6	613746	613751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_016025	CAA	2	6	613789	613794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016025	ATG	2	6	613802	613807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016025	CCCG	2	8	613808	613815	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1514	NC_016025	TTC	2	6	614194	614199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_016025	ACA	2	6	614396	614401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016025	TGTCTT	2	12	616720	616731	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1517	NC_016025	CAA	2	6	616845	616850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_016025	GCGCT	2	10	618990	618999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1519	NC_016025	T	6	6	619112	619117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016025	CAG	3	9	619137	619145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_016025	GGTTT	2	10	619147	619156	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016025	AAGC	2	8	619285	619292	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_016025	GGCT	2	8	623204	623211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_016025	AGGAA	2	10	624313	624322	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016025	GCC	2	6	624354	624359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_016025	CTG	2	6	624406	624411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_016025	GC	3	6	624884	624889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_016025	CGGA	2	8	624907	624914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_016025	GAG	2	6	625809	625814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016025	GC	3	6	626450	626455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_016025	A	7	7	626462	626468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016025	ATTG	2	8	626492	626499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016025	T	6	6	626556	626561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016025	GCC	2	6	628604	628609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_016025	AG	3	6	628618	628623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016025	CCGG	2	8	629659	629666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_016025	GGC	2	6	629675	629680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016025	ATC	2	6	632542	632547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_016025	GAT	2	6	634645	634650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016025	CCG	2	6	634839	634844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_016025	GACG	2	8	636766	636773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_016025	CCGG	2	8	636801	636808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_016025	ACGCT	2	10	636809	636818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1544	NC_016025	CA	3	6	636868	636873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_016025	TTCA	2	8	640639	640646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_016025	TGGCGC	2	12	640961	640972	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_016025	GCA	2	6	641001	641006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_016025	CCG	2	6	641032	641037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_016025	AATG	2	8	641693	641700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016025	CAG	2	6	641972	641977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016025	GTT	2	6	642004	642009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016025	CAT	2	6	642051	642056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016025	CCTC	2	8	642082	642089	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1554	NC_016025	TGC	2	6	642429	642434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016025	T	6	6	642497	642502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016025	CGTT	2	8	642524	642531	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_016025	A	6	6	642967	642972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016025	CTG	2	6	643033	643038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_016025	GCA	2	6	645594	645599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_016025	GC	3	6	645612	645617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_016025	C	6	6	645617	645622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1562	NC_016025	GGTT	2	8	647040	647047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016025	GCC	2	6	647083	647088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_016025	CGA	2	6	647906	647911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_016025	CGG	2	6	649513	649518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_016025	GTC	2	6	651547	651552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_016025	CAG	2	6	651600	651605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_016025	C	6	6	653061	653066	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1569	NC_016025	GCCT	2	8	653078	653085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_016025	CCT	2	6	653123	653128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_016025	GCG	2	6	653172	653177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016025	AAC	2	6	656186	656191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_016025	TTTCA	2	10	656203	656212	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1574	NC_016025	TGG	2	6	656233	656238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016025	CGA	2	6	656257	656262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_016025	TAA	2	6	665349	665354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016025	GGC	2	6	665386	665391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_016025	GAAG	2	8	665438	665445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016025	CCG	2	6	665476	665481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_016025	CAA	2	6	665541	665546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_016025	GCG	2	6	665576	665581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016025	GTG	2	6	665627	665632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016025	AAG	2	6	665939	665944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016025	CAA	2	6	665990	665995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_016025	CAAC	2	8	665998	666005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_016025	GC	3	6	666054	666059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_016025	CGGCG	2	10	666068	666077	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1588	NC_016025	GGC	2	6	666124	666129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_016025	CTG	2	6	667345	667350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_016025	C	6	6	669868	669873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1593	NC_016025	GGC	2	6	677919	677924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_016025	GCC	2	6	677988	677993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_016025	ATAA	2	8	678015	678022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016025	GCG	2	6	678044	678049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_016025	CA	3	6	680420	680425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_016025	GGCT	2	8	680456	680463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_016025	AATG	2	8	682345	682352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016025	TGA	2	6	682361	682366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016025	ATGCC	2	10	682383	682392	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1602	NC_016025	C	6	6	682406	682411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1603	NC_016025	ATC	2	6	685692	685697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1605	NC_016025	AGC	2	6	685727	685732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_016025	CCTA	2	8	685772	685779	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_016025	AGGAA	2	10	685802	685811	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016025	TAA	2	6	685834	685839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016025	CGGG	2	8	688284	688291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_016025	GTG	2	6	688298	688303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016025	CGG	2	6	688339	688344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_016025	CGG	2	6	688353	688358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_016025	CCG	2	6	688364	688369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1615	NC_016025	T	6	6	689068	689073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_016025	TC	3	6	691257	691262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_016025	GCC	2	6	691306	691311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_016025	CCG	2	6	691328	691333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_016025	CCG	2	6	691343	691348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_016025	AGA	2	6	691449	691454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016025	CCAA	2	8	691501	691508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_016025	GTG	2	6	694370	694375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016025	CAT	2	6	694379	694384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_016025	TATG	2	8	694395	694402	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016025	GAT	2	6	695623	695628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016025	GTGA	2	8	695630	695637	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016025	AGG	2	6	695734	695739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016025	ACCA	2	8	695860	695867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1631	NC_016025	GCA	2	6	696015	696020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_016025	TGT	2	6	696131	696136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016025	CAGC	2	8	696170	696177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_016025	ACC	2	6	696182	696187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_016025	C	6	6	696229	696234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1637	NC_016025	CAG	2	6	696342	696347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1946	NC_016025	GCG	2	6	855256	855261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1947	NC_016025	CAAG	2	8	855269	855276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1948	NC_016025	GCG	2	6	855279	855284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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