MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 2469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016025	CA	3	6	218516	218521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_016025	GC	3	6	218529	218534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_016025	GC	3	6	218551	218556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_016025	GT	4	8	219177	219184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016025	GAT	2	6	219214	219219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016025	ACCC	2	8	219222	219229	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
507	NC_016025	TTG	2	6	219252	219257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016025	GCT	2	6	219288	219293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016025	GCCGT	2	10	224207	224216	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
510	NC_016025	GA	3	6	224234	224239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016025	GA	3	6	224735	224740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016025	CAA	2	6	224743	224748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016025	GCTCT	2	10	224764	224773	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
514	NC_016025	AGT	2	6	225214	225219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016025	GTGGA	2	10	225245	225254	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016025	TGGCA	2	10	225313	225322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
517	NC_016025	CTG	2	6	225332	225337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_016025	ACC	2	6	225352	225357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_016025	GTT	2	6	225443	225448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016025	TGCTT	2	10	225589	225598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_016025	GTT	2	6	225723	225728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016025	CCCA	2	8	229306	229313	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
523	NC_016025	CGT	2	6	229336	229341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016025	TGT	2	6	229343	229348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016025	GCA	2	6	229376	229381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016025	CCG	2	6	229412	229417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_016025	CGG	2	6	229438	229443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016025	GTT	2	6	229467	229472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016025	GTC	2	6	229476	229481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_016025	GCAC	2	8	229484	229491	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_016025	CCA	2	6	229527	229532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_016025	CCT	2	6	230807	230812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_016025	GAT	2	6	230870	230875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016025	ACTCC	2	10	230899	230908	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
535	NC_016025	TTG	2	6	230915	230920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016025	TCA	2	6	230934	230939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016025	TCA	2	6	230956	230961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016025	ATT	2	6	230983	230988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016025	TCT	2	6	231107	231112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016025	TAGG	2	8	231146	231153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016025	TTC	2	6	231179	231184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016025	CT	3	6	231225	231230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_016025	TGT	2	6	231454	231459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016025	CAC	2	6	231544	231549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_016025	ACA	2	6	231839	231844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016025	GTTC	2	8	231875	231882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_016025	GGTT	2	8	231901	231908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016025	TG	3	6	233922	233927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016025	CATG	2	8	234518	234525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_016025	CCG	2	6	234569	234574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_016025	GGC	2	6	234631	234636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016025	AAT	2	6	234648	234653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016025	GAC	2	6	235087	235092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016025	TGT	2	6	235208	235213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016025	ACT	2	6	235240	235245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016025	TAC	2	6	236592	236597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016025	CCG	2	6	236603	236608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_016025	TTC	2	6	236671	236676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016025	CAC	2	6	237040	237045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_016025	CGG	2	6	237207	237212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016025	GGC	2	6	237219	237224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016025	GCCG	2	8	237228	237235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_016025	A	7	7	237283	237289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016025	A	7	7	237293	237299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016025	A	6	6	237303	237308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016025	TTG	2	6	237318	237323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016025	GGT	2	6	237335	237340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016025	AGG	2	6	237374	237379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016025	AGAGC	2	10	238921	238930	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
570	NC_016025	TGG	2	6	238939	238944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016025	CGT	2	6	238952	238957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016025	GGC	2	6	238958	238963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016025	CAC	2	6	238971	238976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_016025	A	6	6	239227	239232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016025	TGG	2	6	240922	240927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016025	CGT	2	6	240935	240940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_016025	GGC	2	6	240941	240946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016025	CCGG	2	8	241099	241106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_016025	TTG	2	6	241195	241200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016025	GCCTG	2	10	242860	242869	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
581	NC_016025	CGG	2	6	242910	242915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_016025	A	7	7	244124	244130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016025	A	7	7	244134	244140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016025	TTG	2	6	244149	244154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016025	GGT	2	6	244166	244171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016025	CGG	2	6	244213	244218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016025	CGG	2	6	245818	245823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016025	CCTGA	2	10	245828	245837	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
589	NC_016025	AGC	2	6	245863	245868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016025	TTTG	2	8	245973	245980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016025	CG	3	6	246035	246040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_016025	AACGG	2	10	247616	247625	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
593	NC_016025	ACG	2	6	247664	247669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_016025	GT	3	6	248832	248837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016025	CAGC	2	8	248857	248864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
596	NC_016025	A	6	6	249174	249179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016025	GCT	2	6	250171	250176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_016025	TGG	2	6	255573	255578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016025	AGGG	2	8	255581	255588	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016025	ATG	2	6	255796	255801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016025	GCT	2	6	257114	257119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016025	AACTG	2	10	257137	257146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
603	NC_016025	CCGG	2	8	258624	258631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_016025	CTC	2	6	260047	260052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_016025	CCG	2	6	260077	260082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_016025	GGC	2	6	260087	260092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_016025	CAA	2	6	260171	260176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_016025	CCG	2	6	260199	260204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_016025	CGG	2	6	260223	260228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_016025	T	6	6	263257	263262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016025	CCG	2	6	263303	263308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_016025	AGA	2	6	263349	263354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016025	CGG	2	6	263364	263369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016025	GCG	2	6	265164	265169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016025	CCG	2	6	265483	265488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_016025	TGG	2	6	272757	272762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016025	A	6	6	278155	278160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016025	GCT	2	6	278169	278174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016025	GCC	2	6	278180	278185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_016025	AC	3	6	281608	281613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_016025	ACC	2	6	281679	281684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016025	GTTT	2	8	281725	281732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016025	ATT	2	6	281759	281764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016025	CAAT	2	8	281809	281816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_016025	TCG	2	6	281827	281832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_016025	GAT	2	6	282665	282670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_016025	CGG	2	6	282712	282717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016025	GAC	2	6	283628	283633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016025	AAC	2	6	283638	283643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016025	TGG	2	6	284680	284685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016025	CTG	2	6	284696	284701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016025	TGA	2	6	284718	284723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016025	TG	3	6	284734	284739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016025	CGC	2	6	287624	287629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_016025	CAT	2	6	287674	287679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016025	ACA	2	6	287681	287686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_016025	CGC	2	6	288609	288614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_016025	GC	3	6	297134	297139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_016025	CCCG	2	8	297145	297152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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643	NC_016025	G	6	6	297315	297320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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653	NC_016025	GCC	2	6	305076	305081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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912	NC_016025	TAACC	2	10	423446	423455	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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