MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 482

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016024	AC	3	6	3593	3598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016024	CA	3	6	4401	4406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016024	GT	3	6	5861	5866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016024	CG	3	6	24226	24231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016024	GT	3	6	32215	32220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016024	CG	3	6	37347	37352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016024	GC	3	6	37375	37380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016024	GC	3	6	46169	46174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016024	AC	3	6	46252	46257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016024	GC	5	10	46330	46339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016024	GT	3	6	53951	53956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016024	GC	3	6	54968	54973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016024	GC	3	6	67404	67409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016024	CA	3	6	82201	82206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016024	GC	3	6	88853	88858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016024	CG	3	6	99722	99727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016024	GT	3	6	99744	99749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016024	CG	3	6	103070	103075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016024	AC	3	6	104295	104300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016024	AC	3	6	104465	104470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016024	GT	3	6	104821	104826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016024	CT	3	6	110124	110129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016024	GT	4	8	113961	113968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016024	AG	3	6	114054	114059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016024	AC	3	6	155044	155049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016024	AC	3	6	155931	155936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016024	GT	3	6	160499	160504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016024	CA	3	6	164734	164739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016024	TG	3	6	166302	166307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016024	GT	3	6	183532	183537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016024	GC	3	6	183872	183877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016024	TC	3	6	186706	186711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016024	GC	3	6	189853	189858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016024	TC	3	6	196741	196746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016024	GC	3	6	200819	200824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016024	CG	3	6	203178	203183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016024	GC	3	6	221538	221543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016024	GT	4	8	225454	225461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016024	CG	3	6	232680	232685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016024	CA	3	6	233074	233079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016024	TG	3	6	240579	240584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016024	CA	3	6	241350	241355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016024	CG	3	6	241484	241489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016024	CG	3	6	241501	241506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016024	CG	3	6	241706	241711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016024	TG	3	6	241854	241859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016024	AC	3	6	242190	242195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016024	CA	3	6	249969	249974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016024	TC	3	6	256086	256091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016024	TG	3	6	256294	256299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016024	TG	3	6	264504	264509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016024	GC	3	6	264597	264602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016024	GA	3	6	275319	275324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016024	GT	4	8	282227	282234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016024	CG	3	6	284295	284300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016024	GC	4	8	296560	296567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016024	CG	3	6	311389	311394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016024	GT	3	6	311462	311467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016024	TC	3	6	314098	314103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016024	AG	3	6	316499	316504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016024	GT	3	6	317925	317930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016024	CG	3	6	327630	327635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016024	CT	3	6	329271	329276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016024	AC	4	8	339595	339602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016024	GC	3	6	349005	349010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016024	GA	4	8	353327	353334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016024	CG	3	6	357261	357266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016024	AC	3	6	371444	371449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016024	AC	3	6	383781	383786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016024	AG	4	8	388375	388382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016024	CG	3	6	398369	398374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016024	GT	3	6	403169	403174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016024	AG	3	6	418343	418348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016024	CG	3	6	422304	422309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016024	TC	3	6	424445	424450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016024	TG	3	6	436329	436334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016024	AG	3	6	442419	442424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016024	CT	3	6	446414	446419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016024	AT	3	6	452248	452253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016024	GC	3	6	453247	453252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016024	CA	3	6	461778	461783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016024	AC	3	6	461816	461821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016024	CG	3	6	475849	475854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016024	CG	3	6	475957	475962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016024	GT	3	6	487401	487406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016024	TC	3	6	510793	510798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016024	CG	3	6	511811	511816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016024	GT	3	6	511828	511833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016024	AG	3	6	518917	518922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016024	GT	3	6	522398	522403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016024	CG	4	8	528583	528590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016024	GT	3	6	535352	535357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016024	GC	3	6	535371	535376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016024	AC	3	6	537082	537087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016024	GC	3	6	537145	537150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016024	CT	4	8	537153	537160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016024	CA	3	6	543984	543989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016024	CG	3	6	553183	553188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016024	CT	3	6	557907	557912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016024	GT	3	6	560856	560861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016024	GA	3	6	566615	566620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016024	GT	3	6	566640	566645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016024	GC	3	6	570941	570946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016024	CG	3	6	572823	572828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016024	CT	3	6	576022	576027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016024	CT	3	6	576742	576747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016024	TG	3	6	576775	576780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016024	GT	3	6	578797	578802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016024	TC	3	6	579621	579626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016024	AT	3	6	579751	579756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016024	AG	3	6	593525	593530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016024	CA	3	6	593793	593798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016024	CA	3	6	618834	618839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016024	AG	3	6	630556	630561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016024	CT	3	6	651984	651989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016024	AC	3	6	655224	655229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016024	TG	4	8	655385	655392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016024	CA	3	6	661762	661767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016024	GT	3	6	661791	661796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016024	CG	3	6	666282	666287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016024	GT	3	6	667810	667815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016024	TG	4	8	673349	673356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016024	GT	3	6	679906	679911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016024	GT	3	6	681267	681272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016024	TG	3	6	686868	686873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016024	AG	3	6	693368	693373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016024	TG	3	6	713175	713180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016024	TC	3	6	714720	714725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016024	TC	3	6	754212	754217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016024	CG	3	6	757960	757965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016024	GT	3	6	762660	762665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016024	CT	3	6	763643	763648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016024	CA	3	6	765641	765646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016024	GC	3	6	774586	774591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016024	CA	3	6	791017	791022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016024	TC	3	6	801790	801795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016024	GC	3	6	801860	801865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016024	CG	3	6	807065	807070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016024	GA	3	6	811817	811822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016024	AC	3	6	815254	815259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016024	GC	3	6	816845	816850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016024	GT	3	6	837578	837583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016024	GA	3	6	842416	842421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016024	GC	3	6	867998	868003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016024	GT	3	6	868543	868548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016024	AG	3	6	868800	868805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016024	TC	3	6	875393	875398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016024	AG	3	6	876454	876459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016024	TG	3	6	878603	878608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016024	CA	3	6	878767	878772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016024	TG	3	6	899421	899426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016024	GT	3	6	900108	900113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016024	GC	3	6	900344	900349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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449	NC_016024	TC	3	6	2461697	2461702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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451	NC_016024	CA	3	6	2474778	2474783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_016024	TG	4	8	2475013	2475020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_016024	CA	3	6	2488862	2488867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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467	NC_016024	GC	3	6	2559858	2559863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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476	NC_016024	CG	3	6	2635244	2635249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_016024	GC	3	6	2662201	2662206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
482	NC_016024	AC	3	6	2681096	2681101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.