MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 5161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016024	TC	3	6	1667375	1667380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_016024	AGC	2	6	1667470	1667475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_016024	CAC	2	6	1667524	1667529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_016024	TGG	2	6	1667590	1667595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016024	TAC	2	6	1667606	1667611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_016024	TAC	2	6	1667627	1667632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016024	TG	3	6	1667638	1667643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016024	GCG	2	6	1667651	1667656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_016024	GAC	2	6	1667664	1667669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_016024	GTA	2	6	1667691	1667696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016024	CCAG	2	8	1667721	1667728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_016024	CAT	2	6	1667729	1667734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_016024	GAT	3	9	1667750	1667758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016024	TTC	2	6	1667770	1667775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016024	CCA	2	6	1667813	1667818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_016024	T	6	6	1668698	1668703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016024	CAG	2	6	1668723	1668728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_016024	TGCC	2	8	1668740	1668747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_016024	CAC	2	6	1668753	1668758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_016024	CCT	2	6	1669168	1669173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_016024	ACC	2	6	1670242	1670247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_016024	CCTG	2	8	1671076	1671083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_016024	TGGC	2	8	1672601	1672608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_016024	TGCC	2	8	1674640	1674647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_016024	ACG	2	6	1674696	1674701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016024	TCC	2	6	1675571	1675576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_016024	TGG	2	6	1677347	1677352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3029	NC_016024	GAC	2	6	1678779	1678784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016024	CCT	2	6	1682322	1682327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_016024	GTT	2	6	1682414	1682419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016024	GCCG	2	8	1682448	1682455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_016024	AAC	2	6	1682468	1682473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_016024	GCCG	2	8	1682478	1682485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_016024	GCG	2	6	1682513	1682518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_016024	GCAG	2	8	1685409	1685416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_016024	CGG	2	6	1685428	1685433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_016024	GA	3	6	1685468	1685473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016024	CCA	2	6	1686700	1686705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_016024	TGA	2	6	1686734	1686739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016024	CCA	2	6	1687465	1687470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_016024	CAC	2	6	1687961	1687966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_016024	GGC	2	6	1688019	1688024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3045	NC_016024	ACCGG	2	10	1689858	1689867	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3046	NC_016024	GGCCG	2	10	1689886	1689895	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3047	NC_016024	TTG	2	6	1691986	1691991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3050	NC_016024	CAGC	2	8	1692053	1692060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_016024	T	6	6	1692115	1692120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016024	GCC	2	6	1692121	1692126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_016024	AGGAA	2	10	1694009	1694018	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016024	TGC	2	6	1694026	1694031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016024	CGG	2	6	1694803	1694808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_016024	CTG	2	6	1695777	1695782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_016024	GCCG	2	8	1697118	1697125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_016024	GC	4	8	1697703	1697710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_016024	CAG	2	6	1697719	1697724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_016024	CGT	2	6	1697753	1697758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_016024	CAG	2	6	1697762	1697767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_016024	AGC	2	6	1697769	1697774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_016024	CGCT	2	8	1698449	1698456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_016024	AC	3	6	1698463	1698468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_016024	CCGC	2	8	1698482	1698489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3066	NC_016024	TC	3	6	1701059	1701064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_016024	ATC	2	6	1701111	1701116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_016024	CAG	2	6	1703947	1703952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_016024	GTTTG	2	10	1703988	1703997	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016024	CAC	2	6	1704016	1704021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_016024	GTC	2	6	1704054	1704059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_016024	GT	3	6	1704060	1704065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016024	ATG	2	6	1705232	1705237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016024	TCC	2	6	1705254	1705259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_016024	CGG	2	6	1705279	1705284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_016024	TCG	2	6	1705991	1705996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_016024	G	6	6	1705996	1706001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_016024	GCCG	2	8	1706026	1706033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_016024	ACGT	2	8	1706111	1706118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_016024	AG	3	6	1706146	1706151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016024	TTG	2	6	1706158	1706163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016024	GGAAG	2	10	1706174	1706183	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016024	TGCT	2	8	1706245	1706252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_016024	GGC	2	6	1706453	1706458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_016024	GTC	2	6	1706461	1706466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_016024	CGGG	2	8	1706484	1706491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_016024	GTG	2	6	1706496	1706501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_016024	CCA	2	6	1706622	1706627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_016024	GCA	2	6	1706659	1706664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_016024	TGCC	2	8	1706698	1706705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_016024	TGCC	2	8	1706790	1706797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_016024	CCG	2	6	1706798	1706803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_016024	GGGC	2	8	1706825	1706832	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_016024	ATCA	2	8	1707333	1707340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_016024	GTA	2	6	1707375	1707380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016024	GC	3	6	1707477	1707482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_016024	T	6	6	1707549	1707554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016024	TG	3	6	1707568	1707573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016024	CGC	2	6	1707608	1707613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_016024	AGCC	2	8	1707632	1707639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_016024	ACT	2	6	1707759	1707764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_016024	CGG	2	6	1707853	1707858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_016024	GCG	2	6	1707878	1707883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_016024	AGC	2	6	1707915	1707920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_016024	GTTCT	2	10	1707921	1707930	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3106	NC_016024	CGA	2	6	1707979	1707984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_016024	CAC	2	6	1709196	1709201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_016024	T	6	6	1713786	1713791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016024	TGA	2	6	1713793	1713798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016024	AC	3	6	1713802	1713807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_016024	ACG	2	6	1713844	1713849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_016024	ATC	2	6	1713870	1713875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_016024	CGG	2	6	1713895	1713900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_016024	TCC	2	6	1713906	1713911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_016024	CCT	2	6	1713922	1713927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_016024	CAC	2	6	1719511	1719516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3119	NC_016024	GC	3	6	1719608	1719613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_016024	CAG	2	6	1720536	1720541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_016024	CACGG	2	10	1720549	1720558	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3122	NC_016024	CCG	2	6	1720571	1720576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_016024	GA	3	6	1720590	1720595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016024	CGGC	2	8	1720661	1720668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_016024	GC	3	6	1720682	1720687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_016024	GGC	2	6	1721442	1721447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_016024	ACGA	2	8	1721456	1721463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_016024	CCG	2	6	1722505	1722510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_016024	CAT	2	6	1724172	1724177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3131	NC_016024	GC	3	6	1729119	1729124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3255	NC_016024	CTTC	2	8	1778978	1778985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_016024	CTT	2	6	1778987	1778992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_016024	TAA	2	6	1779179	1779184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_016024	AGT	2	6	1779256	1779261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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