MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 5161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016024	GCG	2	6	1366245	1366250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_016024	CTGC	2	8	1366267	1366274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_016024	CCAG	2	8	1366291	1366298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_016024	GGC	2	6	1366312	1366317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_016024	CGTGT	2	10	1366344	1366353	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2507	NC_016024	GT	3	6	1367555	1367560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_016024	TCG	2	6	1367577	1367582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_016024	T	7	7	1367649	1367655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_016024	TGG	2	6	1367682	1367687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_016024	CAT	2	6	1367721	1367726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_016024	TG	4	8	1368903	1368910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_016024	CAG	2	6	1368940	1368945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2517	NC_016024	CCG	2	6	1372342	1372347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_016024	TGG	2	6	1372373	1372378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016024	GCG	2	6	1372387	1372392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_016024	CG	3	6	1372391	1372396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2523	NC_016024	GCT	2	6	1372459	1372464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2543	NC_016024	CGGG	2	8	1390380	1390387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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2550	NC_016024	CGG	2	6	1394800	1394805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2557	NC_016024	TGG	2	6	1396003	1396008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2612	NC_016024	AGGC	2	8	1443266	1443273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_016024	T	6	6	1443703	1443708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2625	NC_016024	A	6	6	1445957	1445962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_016024	A	6	6	1445966	1445971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_016024	GAC	2	6	1447715	1447720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2631	NC_016024	GTT	2	6	1447754	1447759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_016024	CGC	2	6	1447769	1447774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2633	NC_016024	GA	3	6	1448560	1448565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_016024	TCC	2	6	1450602	1450607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2635	NC_016024	CAG	2	6	1452587	1452592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_016024	GCA	2	6	1452593	1452598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2637	NC_016024	GGC	2	6	1452651	1452656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2638	NC_016024	GT	4	8	1452679	1452686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_016024	CGC	2	6	1452717	1452722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2642	NC_016024	CCT	2	6	1456152	1456157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2643	NC_016024	GA	3	6	1457142	1457147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_016024	AC	3	6	1457159	1457164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2645	NC_016024	AC	3	6	1457170	1457175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2646	NC_016024	CCGC	2	8	1457185	1457192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2647	NC_016024	GTCA	2	8	1457198	1457205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2652	NC_016024	CTGC	2	8	1457401	1457408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2653	NC_016024	CAC	2	6	1459269	1459274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2654	NC_016024	GCTG	2	8	1459287	1459294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2655	NC_016024	ATGG	2	8	1460118	1460125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2660	NC_016024	AGG	2	6	1469410	1469415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2662	NC_016024	CT	3	6	1469473	1469478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2663	NC_016024	GGTT	2	8	1470668	1470675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_016024	TGGCTC	2	12	1470694	1470705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2668	NC_016024	CCT	2	6	1476579	1476584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2670	NC_016024	GTAA	2	8	1476661	1476668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2671	NC_016024	GCCG	2	8	1476683	1476690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2672	NC_016024	GGCC	2	8	1476703	1476710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2673	NC_016024	GCC	2	6	1477319	1477324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2674	NC_016024	CA	3	6	1477325	1477330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2675	NC_016024	GGC	2	6	1477794	1477799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2677	NC_016024	CTTC	2	8	1481829	1481836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2681	NC_016024	CGG	2	6	1484467	1484472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2728	NC_016024	CATT	2	8	1514385	1514392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2730	NC_016024	TG	4	8	1514727	1514734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2731	NC_016024	TCAG	2	8	1514764	1514771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2732	NC_016024	CAA	2	6	1518349	1518354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2752	NC_016024	AAAAC	2	10	1525918	1525927	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2753	NC_016024	GCT	2	6	1526349	1526354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2756	NC_016024	AGCAA	2	10	1526388	1526397	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2757	NC_016024	ATT	2	6	1526403	1526408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2758	NC_016024	A	8	8	1526426	1526433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2759	NC_016024	GCG	2	6	1527477	1527482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2760	NC_016024	A	6	6	1531500	1531505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2761	NC_016024	A	6	6	1531550	1531555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2763	NC_016024	CAA	2	6	1531669	1531674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2764	NC_016024	T	6	6	1531696	1531701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2765	NC_016024	CGGC	2	8	1531706	1531713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2766	NC_016024	CGTA	2	8	1531744	1531751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2795	NC_016024	CA	3	6	1551827	1551832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2808	NC_016024	CTGC	3	12	1552786	1552797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2883	NC_016024	TGAC	2	8	1593006	1593013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2884	NC_016024	CAA	2	6	1593031	1593036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2885	NC_016024	ATT	2	6	1597245	1597250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2889	NC_016024	CTTA	2	8	1600598	1600605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2890	NC_016024	CCAA	2	8	1600616	1600623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2891	NC_016024	CTG	3	9	1600661	1600669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2892	NC_016024	TGG	2	6	1600678	1600683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2894	NC_016024	AG	3	6	1604786	1604791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2895	NC_016024	GCACG	2	10	1604800	1604809	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2896	NC_016024	CAC	2	6	1605850	1605855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2897	NC_016024	TTC	2	6	1605862	1605867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2898	NC_016024	TCA	2	6	1606159	1606164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2899	NC_016024	CA	3	6	1608293	1608298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2900	NC_016024	TCA	2	6	1611267	1611272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2901	NC_016024	TCA	2	6	1611279	1611284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2933	NC_016024	GGCG	2	8	1626025	1626032	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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2998	NC_016024	TTCTTG	2	12	1667311	1667322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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