MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 5161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2014	NC_016024	GTG	2	6	1136159	1136164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2132	NC_016024	GACC	2	8	1192721	1192728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2133	NC_016024	ACC	2	6	1192767	1192772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2134	NC_016024	CGC	2	6	1193262	1193267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2135	NC_016024	CTG	2	6	1193349	1193354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_016024	GGC	2	6	1193362	1193367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_016024	GCT	2	6	1193428	1193433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2138	NC_016024	CAG	2	6	1193442	1193447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_016024	ACT	2	6	1193453	1193458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2140	NC_016024	GCG	2	6	1193524	1193529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_016024	TG	3	6	1196176	1196181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_016024	TCA	3	9	1197789	1197797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2143	NC_016024	AG	3	6	1197807	1197812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_016024	GAG	2	6	1197818	1197823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_016024	GGC	2	6	1197891	1197896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_016024	CAG	2	6	1197910	1197915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2147	NC_016024	TTC	2	6	1197930	1197935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_016024	TGC	2	6	1197938	1197943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2149	NC_016024	AGT	2	6	1197947	1197952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2150	NC_016024	TC	3	6	1197968	1197973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2151	NC_016024	ACT	2	6	1198256	1198261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2152	NC_016024	GAA	2	6	1198263	1198268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_016024	CTG	2	6	1198294	1198299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2154	NC_016024	ATT	2	6	1198422	1198427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2155	NC_016024	GA	5	10	1198451	1198460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2156	NC_016024	TGC	2	6	1198476	1198481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2157	NC_016024	AAG	2	6	1198573	1198578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2158	NC_016024	GAA	2	6	1198806	1198811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2159	NC_016024	CTA	3	9	1198836	1198844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2160	NC_016024	GAA	2	6	1198908	1198913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2161	NC_016024	CCA	2	6	1198980	1198985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2162	NC_016024	T	6	6	1198988	1198993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2163	NC_016024	CGT	2	6	1199010	1199015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2164	NC_016024	GTT	2	6	1199046	1199051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_016024	AT	3	6	1199073	1199078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_016024	A	8	8	1199094	1199101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2167	NC_016024	CTCA	2	8	1199124	1199131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2168	NC_016024	TGT	2	6	1199234	1199239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2174	NC_016024	CAA	2	6	1206477	1206482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2175	NC_016024	GAG	2	6	1206545	1206550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2176	NC_016024	GTT	2	6	1206558	1206563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2192	NC_016024	CAGG	2	8	1209917	1209924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2201	NC_016024	CACG	2	8	1214870	1214877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2202	NC_016024	GCAG	2	8	1214912	1214919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2203	NC_016024	GCCCC	2	10	1221459	1221468	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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2228	NC_016024	GAT	2	6	1238053	1238058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2230	NC_016024	AT	3	6	1238537	1238542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2231	NC_016024	GCC	2	6	1240182	1240187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2232	NC_016024	GGGCCA	2	12	1240198	1240209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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2237	NC_016024	TGT	2	6	1243704	1243709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2238	NC_016024	ACGC	2	8	1243723	1243730	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2240	NC_016024	TTGA	2	8	1243768	1243775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2241	NC_016024	GTTG	2	8	1243780	1243787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2242	NC_016024	T	6	6	1243800	1243805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_016024	AAC	2	6	1243848	1243853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_016024	TTGCTG	2	12	1243927	1243938	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2245	NC_016024	GTT	2	6	1245822	1245827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2246	NC_016024	GTG	2	6	1245853	1245858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2247	NC_016024	A	7	7	1247542	1247548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2248	NC_016024	CAC	2	6	1247584	1247589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2249	NC_016024	GGC	2	6	1248827	1248832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2250	NC_016024	CGT	2	6	1248842	1248847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_016024	CGA	2	6	1250929	1250934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_016024	CTG	2	6	1250968	1250973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_016024	A	6	6	1250984	1250989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_016024	GTGG	2	8	1251003	1251010	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_016024	CCG	2	6	1251013	1251018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2256	NC_016024	TGTCG	2	10	1257114	1257123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2257	NC_016024	GGTT	2	8	1257165	1257172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2258	NC_016024	GA	4	8	1258826	1258833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_016024	CCT	2	6	1259746	1259751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2260	NC_016024	AAC	2	6	1259824	1259829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_016024	AGG	2	6	1261845	1261850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2262	NC_016024	AGA	2	6	1261855	1261860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_016024	GCA	2	6	1261904	1261909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2264	NC_016024	GCA	2	6	1265390	1265395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2265	NC_016024	GTT	2	6	1265401	1265406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2266	NC_016024	TTG	2	6	1265479	1265484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2267	NC_016024	TCA	3	9	1265506	1265514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2268	NC_016024	GC	3	6	1265521	1265526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2269	NC_016024	GTG	2	6	1265654	1265659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2270	NC_016024	TGCC	2	8	1265908	1265915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2275	NC_016024	CAA	3	9	1270942	1270950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2292	NC_016024	TTTCAG	2	12	1271669	1271680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2295	NC_016024	ACC	2	6	1271752	1271757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2353	NC_016024	CTCAA	2	10	1281844	1281853	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2354	NC_016024	G	8	8	1281878	1281885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2374	NC_016024	GCGG	2	8	1283882	1283889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2375	NC_016024	GAT	2	6	1285054	1285059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2377	NC_016024	GAA	2	6	1285179	1285184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2378	NC_016024	ATC	2	6	1285199	1285204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2380	NC_016024	GGA	2	6	1287996	1288001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2382	NC_016024	CAGA	2	8	1289276	1289283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2383	NC_016024	CGG	2	6	1289311	1289316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2384	NC_016024	CCG	2	6	1290322	1290327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2385	NC_016024	CGG	2	6	1290364	1290369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2386	NC_016024	CGG	2	6	1290427	1290432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2387	NC_016024	GT	3	6	1290466	1290471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2388	NC_016024	TTGG	2	8	1290474	1290481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2389	NC_016024	TTGC	2	8	1290499	1290506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2390	NC_016024	GCGG	2	8	1290508	1290515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2391	NC_016024	GAA	2	6	1290523	1290528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2392	NC_016024	TCCG	2	8	1290542	1290549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2393	NC_016024	GCT	2	6	1290768	1290773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2394	NC_016024	GGT	2	6	1292674	1292679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2395	NC_016024	TG	3	6	1293752	1293757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_016024	TGG	2	6	1293812	1293817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_016024	CGG	2	6	1293829	1293834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2398	NC_016024	GTG	2	6	1295329	1295334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2399	NC_016024	ATC	2	6	1295371	1295376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2400	NC_016024	A	7	7	1295378	1295384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2401	NC_016024	GGTTCT	2	12	1295433	1295444	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2402	NC_016024	CTGAC	2	10	1295476	1295485	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2403	NC_016024	GAG	2	6	1295569	1295574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2404	NC_016024	TCG	2	6	1299623	1299628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2405	NC_016024	T	6	6	1299671	1299676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2406	NC_016024	AAG	2	6	1299686	1299691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2409	NC_016024	CGGG	2	8	1302023	1302030	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2410	NC_016024	GGT	2	6	1303024	1303029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2411	NC_016024	GCG	2	6	1303087	1303092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2413	NC_016024	GAC	2	6	1303151	1303156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2415	NC_016024	A	6	6	1305625	1305630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2416	NC_016024	A	7	7	1305639	1305645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2417	NC_016024	TGC	2	6	1311045	1311050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2418	NC_016024	GTATT	2	10	1311058	1311067	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2419	NC_016024	CTGC	2	8	1311094	1311101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2420	NC_016024	CCACTG	2	12	1311102	1311113	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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2422	NC_016024	TGCC	2	8	1312452	1312459	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2423	NC_016024	GAC	2	6	1313825	1313830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2424	NC_016024	AGCC	2	8	1313867	1313874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2425	NC_016024	CAG	2	6	1313883	1313888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2426	NC_016024	CAC	2	6	1313898	1313903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2428	NC_016024	AGAGT	2	10	1315017	1315026	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2429	NC_016024	GTTG	2	8	1315049	1315056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2431	NC_016024	CGG	2	6	1315678	1315683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2432	NC_016024	GCCG	2	8	1315691	1315698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2433	NC_016024	TCTG	2	8	1315735	1315742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2434	NC_016024	GC	3	6	1315757	1315762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2435	NC_016024	TGAT	2	8	1315979	1315986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2436	NC_016024	GGA	2	6	1316016	1316021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2441	NC_016024	GC	4	8	1317326	1317333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2442	NC_016024	GTT	2	6	1317334	1317339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2449	NC_016024	GGC	2	6	1323968	1323973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2452	NC_016024	GCCT	2	8	1324091	1324098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2453	NC_016024	CGTG	2	8	1324137	1324144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2455	NC_016024	C	6	6	1324192	1324197	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2463	NC_016024	ACG	2	6	1337122	1337127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2474	NC_016024	A	7	7	1352623	1352629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2479	NC_016024	CTG	2	6	1356284	1356289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2486	NC_016024	ACA	2	6	1357548	1357553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2489	NC_016024	ACC	2	6	1359110	1359115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2490	NC_016024	GGGT	2	8	1359122	1359129	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_016024	GT	3	6	1359220	1359225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2492	NC_016024	GCCT	2	8	1359253	1359260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2493	NC_016024	GA	3	6	1359273	1359278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_016024	G	6	6	1359297	1359302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_016024	AAC	2	6	1359318	1359323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2499	NC_016024	GTC	2	6	1364331	1364336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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