MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016012	ATTTA	2	10	2717	2726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016012	TTAAA	2	10	12601	12610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016012	ATTTT	2	10	12710	12719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016012	TAATA	2	10	20928	20937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016012	TAATT	2	10	22782	22791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016012	ACTTC	2	10	28869	28878	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016012	TACCT	2	10	30539	30548	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016012	CTATA	2	10	31507	31516	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016012	TTTTC	2	10	31888	31897	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016012	TTTTA	2	10	42831	42840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016012	AATTT	2	10	43216	43225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016012	TATAT	2	10	43294	43303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016012	TCGTG	2	10	47081	47090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016012	TGGAA	2	10	48933	48942	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016012	AGGAT	2	10	49200	49209	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016012	AAGAG	2	10	49233	49242	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016012	AAGAT	2	10	50508	50517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016012	TCGTG	2	10	55302	55311	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016012	TGGAA	2	10	57154	57163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016012	AGGAT	2	10	57421	57430	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016012	AAGAG	2	10	57454	57463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016012	AAGAT	2	10	58729	58738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016012	TATAA	2	10	60478	60487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016012	TACAA	2	10	61699	61708	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016012	ATTTA	2	10	65080	65089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016012	GTTAT	2	10	76976	76985	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016012	CATAA	2	10	104536	104545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016012	TAAAT	2	10	104555	104564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016012	ATTTT	2	10	117014	117023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016012	ATTAA	2	10	121451	121460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016012	TAAAA	2	10	133316	133325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016012	TTTTA	2	10	133335	133344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016012	ATTAA	2	10	133614	133623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016012	TCGTG	2	10	143285	143294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016012	TGGAA	2	10	145137	145146	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016012	AGGAT	2	10	145404	145413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016012	AAGAG	2	10	145437	145446	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016012	AAGAT	2	10	146712	146721	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016012	ATAAA	2	10	160283	160292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016012	TTATT	2	10	165986	165995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016012	CCTTT	2	10	179969	179978	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016012	AATAA	2	10	181049	181058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016012	TTAAA	2	10	188574	188583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016012	ATTAA	2	10	197669	197678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016012	TTATA	2	10	197727	197736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016012	AATAA	2	10	198242	198251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016012	TAAAA	2	10	212930	212939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016012	TTTTA	2	10	212949	212958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016012	ATGAA	2	10	214286	214295	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016012	AAAAT	2	10	237049	237058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016012	TAAAA	2	10	243157	243166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016012	TTTTA	2	10	243178	243187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016012	TAAAT	2	10	249567	249576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016012	AATTT	2	10	249597	249606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016012	TCTTT	2	10	249613	249622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016012	TATTT	2	10	257366	257375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016012	ATATT	2	10	258256	258265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016012	AGTAG	2	10	262497	262506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016012	TCGTG	2	10	263642	263651	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016012	TGGAA	2	10	265686	265695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016012	AGGAT	2	10	265953	265962	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016012	AAGAG	2	10	265986	265995	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016012	AAGAT	2	10	267261	267270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016012	TCGTG	2	10	268765	268774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016012	TGGAA	2	10	270617	270626	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016012	AGGAT	2	10	270884	270893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016012	AAGAG	2	10	270917	270926	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016012	AAGAT	2	10	272192	272201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016012	ATTAT	2	10	284468	284477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016012	ATTTT	2	10	297906	297915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016012	ATTTT	2	10	302697	302706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016012	ATATT	2	10	303931	303940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016012	TATTT	2	10	320189	320198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016012	TATAA	2	10	320208	320217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016012	ATGAT	2	10	322539	322548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016012	AATAT	2	10	322554	322563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016012	ATATA	2	10	322614	322623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016012	CTTAT	2	10	322735	322744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016012	TTATT	2	10	323847	323856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016012	AAATT	2	10	326949	326958	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016012	AAATT	2	10	329351	329360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016012	ATTTA	2	10	330511	330520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016012	ATTTT	2	10	336414	336423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016012	AAAAT	2	10	348388	348397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016012	AGATA	2	10	353553	353562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016012	ATATA	2	10	367341	367350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016012	TAAAT	2	10	375081	375090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016012	TTATA	2	10	382572	382581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016012	TTTTA	2	10	385060	385069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016012	GTTTG	2	10	389138	389147	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016012	ATTAT	2	10	389863	389872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016012	AGGAG	2	10	390131	390140	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016012	TGAAT	2	10	390846	390855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016012	ATTTA	2	10	396844	396853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016012	ATTAT	2	10	399101	399110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016012	AAATT	2	10	405590	405599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016012	TAATT	2	10	406430	406439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016012	TAAAT	2	10	411653	411662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016012	CTTTT	2	10	418846	418855	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016012	TATCT	2	10	428989	428998	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016012	ATATA	2	10	431054	431063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016012	TAGTG	2	10	435047	435056	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016012	TATTT	2	10	443750	443759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016012	TAATT	2	10	450710	450719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016012	ATTTA	2	10	454543	454552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016012	AATAA	3	15	466648	466662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016012	AAACT	2	10	466692	466701	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016012	ATTTT	2	10	466707	466716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016012	CTTTT	2	10	471277	471286	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016012	ATTTA	2	10	474860	474869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016012	AGATA	2	10	474893	474902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016012	ATTTT	2	10	474925	474934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016012	GTTGT	2	10	485265	485274	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016012	GAGTA	2	10	503422	503431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016012	AAATT	2	10	510070	510079	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016012	GATTT	2	10	523306	523315	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016012	TAATT	2	10	523338	523347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016012	TTTTA	2	10	530353	530362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016012	AAATA	2	10	536939	536948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016012	TAAAT	2	10	540605	540614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016012	ATATA	2	10	540616	540625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016012	ATTTA	2	10	543247	543256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016012	AATTA	2	10	543572	543581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016012	ATTTT	2	10	547277	547286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016012	ATAAG	2	10	556970	556979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016012	TTTTA	2	10	557334	557343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016012	TAGTA	2	10	579710	579719	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016012	ATGAT	2	10	581174	581183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016012	GTGAT	2	10	581897	581906	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016012	TTTTA	2	10	583119	583128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016012	TTTTA	2	10	583614	583623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016012	TATAT	2	10	584499	584508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016012	TATTT	2	10	585731	585740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016012	AATTA	2	10	596905	596914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016012	TAATT	2	10	596919	596928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016012	GAAAG	2	10	597019	597028	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016012	ATTAA	2	10	597522	597531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016012	ATAAA	2	10	602630	602639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016012	TTAAA	2	10	612512	612521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016012	ATATT	2	10	623233	623242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016012	ATGTT	2	10	626177	626186	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016012	ATAAC	2	10	628164	628173	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016012	GTAAT	2	10	647849	647858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016012	TAGTA	2	10	673289	673298	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016012	AAAGG	2	10	673390	673399	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016012	TATAT	2	10	691273	691282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016012	TTTGT	2	10	695223	695232	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016012	CAATG	2	10	706523	706532	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_016012	ATTTT	2	10	718358	718367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016012	TTTTG	2	10	726847	726856	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_016012	ATTTA	2	10	750740	750749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_016012	TAAAT	2	10	882018	882027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.