MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 1403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	TGAT	2	8	6293	6300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015949	TAAG	2	8	8885	8892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015949	TTCT	2	8	9123	9130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015949	GATA	2	8	9370	9377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015949	AAAT	2	8	9800	9807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015949	AAGT	2	8	10031	10038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015949	AACT	2	8	10362	10369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015949	GAAA	2	8	10391	10398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015949	GAGT	2	8	12615	12622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015949	TATG	2	8	17084	17091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015949	CATT	2	8	29923	29930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015949	GTAA	2	8	30293	30300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015949	TAAA	2	8	30386	30393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015949	ATTT	2	8	33600	33607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015949	TTAA	2	8	33660	33667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015949	GAAC	2	8	40153	40160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015949	TTTG	2	8	40446	40453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015949	TCAT	2	8	40488	40495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015949	GGAT	2	8	49702	49709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015949	GGGA	2	8	54566	54573	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015949	AGGG	2	8	58208	58215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015949	TTAA	2	8	60030	60037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015949	TAAA	2	8	62707	62714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015949	TAAA	2	8	70871	70878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015949	TAGA	2	8	70883	70890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015949	TGTA	2	8	70950	70957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015949	ACAA	2	8	71447	71454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015949	CTTT	2	8	72492	72499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015949	TAAA	2	8	72531	72538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015949	TATT	2	8	75529	75536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015949	TTAT	2	8	75570	75577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015949	GTAT	2	8	75711	75718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015949	TTTA	2	8	83274	83281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015949	AAAT	2	8	88000	88007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015949	AGTG	2	8	98338	98345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015949	TTTA	2	8	106244	106251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015949	ATTT	2	8	110159	110166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015949	GGGA	2	8	112520	112527	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015949	TTTA	2	8	115082	115089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015949	AAAT	2	8	118796	118803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015949	ATGG	2	8	124618	124625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015949	GATA	2	8	126353	126360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015949	TATG	2	8	126735	126742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015949	ATTG	2	8	131735	131742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015949	TCTA	2	8	132315	132322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015949	GAAG	2	8	132373	132380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015949	TGTT	2	8	135921	135928	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015949	TTTG	2	8	137231	137238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015949	TTTA	2	8	139334	139341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015949	TTTA	2	8	140455	140462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015949	GGGA	2	8	141971	141978	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015949	AGAT	2	8	142143	142150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015949	AGAC	2	8	142306	142313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015949	ATGA	2	8	142463	142470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015949	TATG	2	8	142747	142754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015949	TGGA	2	8	142953	142960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015949	ACCA	2	8	143008	143015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015949	TCTA	2	8	143117	143124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015949	CTCC	2	8	144274	144281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015949	AGGG	2	8	144355	144362	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015949	CTAT	2	8	145839	145846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015949	GTAA	2	8	151937	151944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015949	TGAT	2	8	155227	155234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015949	GGAG	2	8	155332	155339	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015949	TAGT	2	8	155826	155833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015949	CATA	2	8	156022	156029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015949	CCAT	2	8	156214	156221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015949	TGAT	2	8	157813	157820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015949	TTAA	2	8	157896	157903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015949	AAGG	2	8	158965	158972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015949	GATT	2	8	159346	159353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015949	ATAC	2	8	168966	168973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015949	ATGA	2	8	169229	169236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015949	TAAA	2	8	171289	171296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015949	ACAA	2	8	172197	172204	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015949	CAAA	2	8	179127	179134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015949	ATTA	2	8	181521	181528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015949	AATT	2	8	181537	181544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015949	ATTT	2	8	185195	185202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015949	GAAA	2	8	187769	187776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015949	GGCT	2	8	188002	188009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015949	TGCC	2	8	188010	188017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015949	GGTA	2	8	189131	189138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015949	AAAT	2	8	190054	190061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015949	AGAA	2	8	193201	193208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015949	CAAA	2	8	194951	194958	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015949	CAGA	2	8	194996	195003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015949	AGAA	2	8	198053	198060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015949	TTTA	2	8	210132	210139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015949	TTTG	2	8	212767	212774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015949	TTCT	2	8	213080	213087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015949	GAAG	2	8	213418	213425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015949	TACA	2	8	215392	215399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015949	GTTT	2	8	215616	215623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015949	TATT	2	8	215667	215674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015949	CAAT	2	8	218333	218340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015949	ATAG	2	8	219362	219369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015949	AAAG	2	8	219435	219442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015949	AAGA	2	8	220180	220187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015949	TAAT	2	8	222059	222066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015949	AAAG	2	8	225627	225634	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015949	TCTT	2	8	230503	230510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015949	CCTT	2	8	231426	231433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015949	TAAA	2	8	232766	232773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015949	AAAG	2	8	232874	232881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015949	TAAA	2	8	232917	232924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015949	GTAT	2	8	233040	233047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015949	AAAT	2	8	236344	236351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015949	CTTT	2	8	241615	241622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015949	GTTT	2	8	241936	241943	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015949	TAAG	2	8	244697	244704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015949	TGTA	2	8	249247	249254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015949	TAGA	2	8	249702	249709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015949	AGGA	2	8	257148	257155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015949	ATAA	2	8	267535	267542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015949	TAAT	2	8	279411	279418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015949	CTCC	2	8	279469	279476	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_015949	AGGG	2	8	279550	279557	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015949	GAAA	2	8	281091	281098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015949	AAAG	2	8	284094	284101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015949	AAAT	2	8	284515	284522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015949	GAAA	2	8	284629	284636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015949	ATAA	2	8	286021	286028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015949	TTGC	2	8	286271	286278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015949	ACAA	2	8	286461	286468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015949	TTGG	2	8	286598	286605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015949	AATC	2	8	286642	286649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015949	ATAA	2	8	290765	290772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015949	TAAA	2	8	294285	294292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015949	ATCT	2	8	302280	302287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015949	GTAT	2	8	302405	302412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015949	TAAA	2	8	302928	302935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015949	AGAA	2	8	303060	303067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015949	TAAA	2	8	304107	304114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015949	CAGT	2	8	305297	305304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015949	ATTT	2	8	306103	306110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015949	TATT	2	8	306187	306194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015949	TAAA	2	8	306198	306205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015949	TTTA	2	8	307228	307235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015949	TCAA	2	8	307287	307294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015949	AGGT	2	8	308725	308732	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015949	AGTA	2	8	309958	309965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015949	ATCT	2	8	310345	310352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015949	AGAT	2	8	310648	310655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015949	TTTG	2	8	310740	310747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015949	TTTA	2	8	312173	312180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015949	GCAG	2	8	321912	321919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015949	TTTG	2	8	322947	322954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015949	TTTG	2	8	323754	323761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015949	AAAT	2	8	324058	324065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015949	ATTT	2	8	324358	324365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015949	ACTA	2	8	325472	325479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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