MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 11419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015949	TA	3	6	138833	138838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015949	TAA	2	6	138850	138855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015949	T	6	6	138983	138988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015949	T	6	6	139085	139090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015949	AT	3	6	139123	139128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015949	TAT	2	6	139140	139145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015949	CAA	2	6	139270	139275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015949	GCT	2	6	139323	139328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015949	TTTA	2	8	139334	139341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015949	ATT	2	6	139371	139376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015949	GAG	2	6	139377	139382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015949	T	6	6	140412	140417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015949	ATATA	2	10	140444	140453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015949	TTTA	2	8	140455	140462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015949	ACA	2	6	140482	140487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015949	AAT	2	6	140490	140495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015949	A	6	6	140509	140514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015949	TAT	2	6	140545	140550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015949	ATA	2	6	140554	140559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015949	ATA	2	6	140564	140569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015949	TAT	2	6	140587	140592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015949	AGG	2	6	140611	140616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015949	GGGA	2	8	141971	141978	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015949	TTG	2	6	142047	142052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015949	CAA	2	6	142113	142118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015949	AGAT	2	8	142143	142150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015949	CTT	2	6	142182	142187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015949	AAT	2	6	142189	142194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015949	A	7	7	142230	142236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015949	TC	3	6	142256	142261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_015949	AGAC	2	8	142306	142313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_015949	AC	3	6	142452	142457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_015949	ATGA	2	8	142463	142470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015949	TTG	2	6	142521	142526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015949	CTA	2	6	142543	142548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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537	NC_015949	GTT	2	6	142646	142651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015949	TTC	2	6	142695	142700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015949	TATG	2	8	142747	142754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015949	T	6	6	142781	142786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015949	ACA	2	6	142877	142882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015949	TTG	2	6	142902	142907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015949	TGGA	2	8	142953	142960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015949	ACCA	2	8	143008	143015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015949	TTG	2	6	143019	143024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015949	TGG	3	9	143083	143091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015949	TCTA	2	8	143117	143124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_015949	ATC	2	6	143204	143209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015949	TA	3	6	143219	143224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015949	AGA	2	6	144173	144178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015949	T	7	7	144179	144185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015949	CTCC	2	8	144274	144281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
553	NC_015949	A	6	6	144289	144294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015949	AAT	2	6	144311	144316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015949	A	6	6	144321	144326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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557	NC_015949	A	6	6	145811	145816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015949	CTAT	2	8	145839	145846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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561	NC_015949	CCA	2	6	145911	145916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_015949	T	7	7	145959	145965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015949	T	7	7	145973	145979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015949	G	6	6	145982	145987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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566	NC_015949	T	6	6	147606	147611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015949	A	6	6	147615	147620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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572	NC_015949	T	7	7	149467	149473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015949	AAG	2	6	149850	149855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_015949	A	6	6	151973	151978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_015949	TAA	2	6	155109	155114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015949	AT	3	6	155204	155209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_015949	AAT	2	6	155848	155853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_015949	CAT	2	6	156194	156199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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603	NC_015949	TGA	2	6	156243	156248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_015949	ATA	2	6	156334	156339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015949	TAACC	2	10	156350	156359	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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610	NC_015949	ATC	2	6	156448	156453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015949	TAA	2	6	156458	156463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015949	AAT	2	6	156478	156483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_015949	TTAA	2	8	157896	157903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015949	ACT	2	6	157926	157931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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621	NC_015949	AT	3	6	158081	158086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015949	A	6	6	158125	158130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015949	A	6	6	158955	158960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015949	AAGG	2	8	158965	158972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015949	TAAGT	2	10	159019	159028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015949	TTG	2	6	159072	159077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_015949	CAG	2	6	159149	159154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_015949	GATT	2	8	159346	159353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015949	AAT	2	6	159508	159513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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635	NC_015949	ATG	2	6	159762	159767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_015949	AGA	2	6	159982	159987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015949	TAC	2	6	160001	160006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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