MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015913	AAAAAT	2	12	32757	32768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015913	AAAATT	2	12	38221	38232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015913	TTAGGT	2	12	42340	42351	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015913	TAGTGA	2	12	44402	44413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015913	TAGTGA	2	12	52629	52640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015913	TTTATT	2	12	56625	56636	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015913	TTTAAT	2	12	56649	56660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015913	TTAATT	2	12	56708	56719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015913	ATTTAA	2	12	57068	57079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015913	AAAATT	2	12	68008	68019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015913	CTAACT	2	12	114949	114960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015913	TTAATG	2	12	172675	172686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015913	TAGTGA	2	12	186420	186431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015913	GGATTA	2	12	204202	204213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015913	TATGAG	2	12	204441	204452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015913	ATTTTT	2	12	214250	214261	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015913	TATTTT	2	12	253455	253466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015913	TTTTTA	2	12	259118	259129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015913	TAGTGA	2	12	302240	302251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015913	TAGTGA	2	12	307248	307259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015913	TAGTGA	2	12	312170	312181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015913	TAATAT	2	12	322275	322286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015913	ATAAAA	2	12	330856	330867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015913	TAAATG	2	12	347156	347167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015913	TATTTT	2	12	356266	356277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015913	CTAATA	2	12	373660	373671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015913	GAGTGT	2	12	381031	381042	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015913	GATTTA	2	12	438710	438721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015913	ATTTTT	2	12	441365	441376	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015913	TTTAAA	2	12	446361	446372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015913	ATATTA	2	12	454328	454339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015913	ATTTAT	2	12	483140	483151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015913	ATTAAT	2	12	493325	493336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015913	TTAAAA	2	12	549885	549896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015913	TGTCAT	2	12	616383	616394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015913	TTTTTA	2	12	637415	637426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015913	GAAAAA	2	12	639064	639075	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015913	TAATTG	2	12	658751	658762	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015913	AATAGT	2	12	658767	658778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015913	GGTATG	2	12	663335	663346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015913	AATTAA	2	12	682285	682296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015913	TAGATT	2	12	688667	688678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015913	ATAAAA	2	12	712298	712309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015913	AATTTA	2	12	725762	725773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015913	AATATG	2	12	729139	729150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015913	ATGAAA	2	12	730369	730380	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015913	TAAATT	2	12	746739	746750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015913	TATTTT	2	12	794255	794266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015913	ATTTTT	2	12	795862	795873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015913	TATAAA	2	12	804643	804654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015913	ACAAAA	2	12	826684	826695	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015913	TAAAAA	2	12	827913	827924	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015913	ATGTAT	2	12	833003	833014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015913	ATAGTA	2	12	833448	833459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015913	TATTAG	2	12	856653	856664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015913	TTCAAA	2	12	868633	868644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015913	TTCAAA	2	12	873662	873673	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015913	TAAATG	2	12	874091	874102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015913	AAAAAT	2	12	893891	893902	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015913	AAATTT	2	12	895149	895160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015913	AAAAAT	2	12	912426	912437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015913	ATAATT	2	12	943868	943879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015913	TAAAAA	2	12	947784	947795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015913	AACTAA	2	12	957337	957348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015913	TAAAAT	2	12	982003	982014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015913	TAAAAA	2	12	982129	982140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015913	TTAAAA	2	12	982371	982382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015913	AATAAA	2	12	987933	987944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015913	AAATTT	2	12	989153	989164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015913	TTTCCA	2	12	1066774	1066785	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015913	TTAAAA	2	12	1069480	1069491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015913	AAAGTA	2	12	1070093	1070104	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015913	AAATAT	2	12	1078657	1078668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015913	TATTAA	2	12	1118911	1118922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015913	TTAAAA	2	12	1125889	1125900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015913	AAATTC	2	12	1129618	1129629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015913	ATTTTA	2	12	1133695	1133706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015913	CTTTAA	2	12	1176705	1176716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015913	AAAATT	2	12	1185893	1185904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015913	AATCAA	2	12	1186009	1186020	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015913	TAAAAA	2	12	1189168	1189179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015913	ATTTAT	2	12	1189748	1189759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015913	TATAAA	2	12	1206751	1206762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015913	TAAAAT	2	12	1214848	1214859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015913	CAAATA	2	12	1216462	1216473	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015913	TAATTA	2	12	1252332	1252343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015913	TATTTA	2	12	1288515	1288526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015913	TCAAAT	2	12	1307722	1307733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015913	AAATCT	2	12	1312399	1312410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015913	ATTTAA	2	12	1321873	1321884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015913	TACAAA	2	12	1327531	1327542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015913	AAATTT	2	12	1338899	1338910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015913	TAAATT	2	12	1342223	1342234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015913	ATTTTT	2	12	1342260	1342271	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015913	TTTTAT	2	12	1349253	1349264	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015913	TTATAA	2	12	1354337	1354348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015913	TAAAAA	2	12	1361000	1361011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015913	TTAACA	2	12	1364385	1364396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015913	ATTAAA	2	12	1370235	1370246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015913	TAAAAA	2	12	1405498	1405509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015913	ATTTTT	2	12	1454878	1454889	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015913	TTCATT	2	12	1482739	1482750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015913	TTGTTT	2	12	1491265	1491276	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015913	ACACTT	2	12	1515419	1515430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015913	TAAATT	2	12	1529212	1529223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015913	ATTAAA	2	12	1535076	1535087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015913	AACTCC	2	12	1560186	1560197	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015913	TTAACT	2	12	1565815	1565826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015913	AATATT	2	12	1605221	1605232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015913	TTTAAT	2	12	1619752	1619763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.