MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015859	GGGTGG	2	12	21489	21500	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015859	ACCAGT	2	12	28056	28067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015859	GTGCCG	2	12	28732	28743	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015859	GCTCAC	2	12	42053	42064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015859	TTCGTG	2	12	45829	45840	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015859	GTGGGG	2	12	54362	54373	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015859	GTTTCG	2	12	57654	57665	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015859	TATTTT	2	12	69562	69573	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015859	AGCGAA	2	12	72207	72218	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015859	TTCGAC	2	12	86731	86742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015859	CGTCAC	2	12	100315	100326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015859	CACCCT	2	12	103453	103464	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015859	CGGCGC	2	12	111329	111340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015859	GGACCT	2	12	111350	111361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015859	GACGGT	2	12	111420	111431	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015859	CACCTC	2	12	155246	155257	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015859	ACCCGG	2	12	168071	168082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015859	TACCGG	2	12	176934	176945	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015859	CGCCAG	2	12	205221	205232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015859	GTTCGG	2	12	252382	252393	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015859	GTGCCG	2	12	259072	259083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015859	CCGAGA	2	12	262478	262489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015859	CCCCGA	2	12	281931	281942	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015859	GCCCTG	2	12	294729	294740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015859	CGGTGA	2	12	328757	328768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015859	CTGCAC	2	12	351705	351716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015859	GACGCC	2	12	359812	359823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015859	TGGCCC	2	12	360184	360195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015859	GAACAT	2	12	379371	379382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015859	GCACCT	2	12	382200	382211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015859	GGCGGG	2	12	395600	395611	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015859	CGGTGA	2	12	410166	410177	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015859	CCGTCG	2	12	413764	413775	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015859	GGTGGC	2	12	419947	419958	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015859	TCCTTC	2	12	428765	428776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015859	GCGGAC	2	12	548461	548472	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015859	GTCGAA	2	12	557771	557782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015859	CCGCTG	2	12	583524	583535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015859	GGAGGG	2	12	593359	593370	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015859	CGGACG	2	12	601450	601461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015859	CGGGAG	2	12	601506	601517	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015859	GGAGAT	2	12	601525	601536	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015859	GCGACG	2	12	602278	602289	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015859	GGGTGG	2	12	675825	675836	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015859	GGTAGA	2	12	686538	686549	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015859	TATTTT	2	12	693046	693057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015859	AGCGAA	2	12	695691	695702	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015859	GCGTCG	2	12	713050	713061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015859	TCCTGC	2	12	780293	780304	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015859	TCGCCC	2	12	796746	796757	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015859	TGCCGG	2	12	808614	808625	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015859	AGTCGA	2	12	809538	809549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015859	CACCGG	2	12	819010	819021	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015859	GCGGTG	2	12	878145	878156	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015859	CGACGG	2	12	895035	895046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015859	GCTACG	2	12	908553	908564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015859	CCCCCG	2	12	909694	909705	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_015859	GAATCG	2	12	937874	937885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015859	CCGGCC	2	12	956115	956126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015859	AGGACC	2	12	960370	960381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015859	GTCCCG	2	12	985735	985746	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015859	TGTGAG	2	12	986939	986950	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015859	CCCGAA	2	12	991971	991982	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015859	CCGACG	2	12	1006891	1006902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015859	GTCGCA	2	12	1058484	1058495	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015859	CGACCC	2	12	1095644	1095655	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015859	GCTGGA	2	12	1096171	1096182	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015859	CGGCCA	2	12	1114977	1114988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015859	ATTGAT	2	12	1115728	1115739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015859	TCGATG	2	12	1116766	1116777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015859	GAATCA	2	12	1124497	1124508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015859	TATTTT	2	12	1155767	1155778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015859	AGCGAA	2	12	1158412	1158423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015859	TATTTT	2	12	1162364	1162375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015859	AGCGAA	2	12	1165009	1165020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015859	CTTCCC	3	18	1179701	1179718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015859	CACCGC	2	12	1189535	1189546	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015859	CGACCG	2	12	1198565	1198576	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015859	TCGCCG	2	12	1221591	1221602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015859	ACCGTC	2	12	1321351	1321362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015859	CGTCGA	2	12	1321370	1321381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015859	CCGGCG	2	12	1327359	1327370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015859	GTAGAT	2	12	1327705	1327716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015859	GGGTCC	2	12	1351179	1351190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015859	TCAAGG	2	12	1382467	1382478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015859	CGACCT	2	12	1431942	1431953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015859	TATTTT	2	12	1453909	1453920	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015859	AGCGAA	2	12	1456554	1456565	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015859	CCGGCA	2	12	1475894	1475905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015859	CGGTGA	2	12	1493651	1493662	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015859	GCCGGG	2	12	1505347	1505358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015859	GACCGG	2	12	1524170	1524181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015859	GGACCC	2	12	1560006	1560017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015859	GGGCAT	2	12	1560179	1560190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015859	CTCGCA	2	12	1564159	1564170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015859	ACGCAC	2	12	1583923	1583934	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015859	CGCAGC	2	12	1589137	1589148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015859	GACCTC	2	12	1589361	1589372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015859	ACGCAC	2	12	1589524	1589535	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015859	TCGCCA	2	12	1598559	1598570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015859	GCCCGG	2	12	1619214	1619225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015859	CGTGGG	2	12	1620781	1620792	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015859	CCGCAG	2	12	1621085	1621096	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015859	CTCGGT	2	12	1624795	1624806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015859	CATCGG	2	12	1634265	1634276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015859	CACCGC	2	12	1634946	1634957	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015859	CCGGGG	2	12	1723859	1723870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015859	TGCCCC	2	12	1748771	1748782	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015859	GACGGG	2	12	1761654	1761665	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015859	TGGGCG	2	12	1764657	1764668	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015859	CCACCT	2	12	1775469	1775480	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015859	GCCCCC	2	12	1805910	1805921	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
113	NC_015859	GTCCCC	2	12	1806900	1806911	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015859	GCCTTT	2	12	1823058	1823069	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015859	TGGGGT	2	12	1864100	1864111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015859	GGTCTG	2	12	1871655	1871666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015859	CGACTC	2	12	1892010	1892021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015859	GCCGAT	2	12	1902552	1902563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015859	AACTCC	2	12	1902967	1902978	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015859	CGCGCT	2	12	1903607	1903618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015859	ATCAAT	2	12	1931220	1931231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015859	CACCCC	2	12	1956569	1956580	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
123	NC_015859	GTCCTC	2	12	1958034	1958045	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015859	CAAGGA	2	12	1990726	1990737	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015859	GACCTG	2	12	1992487	1992498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015859	GACCGG	2	12	2000676	2000687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015859	TCCCCC	2	12	2034191	2034202	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
128	NC_015859	GTGGCG	2	12	2042250	2042261	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015859	TCCGCC	2	12	2161208	2161219	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015859	TTGAAC	2	12	2172327	2172338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015859	AGCACG	2	12	2174724	2174735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015859	TCGCAC	2	12	2175467	2175478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015859	CTCGGG	2	12	2178980	2178991	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015859	ACGCAC	2	12	2183192	2183203	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015859	CTGCCA	2	12	2246132	2246143	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015859	TGACAC	2	12	2277671	2277682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015859	TGACAC	2	12	2277737	2277748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015859	AGTTCA	2	12	2287628	2287639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_015859	CAGAAA	2	12	2297794	2297805	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_015859	CTCCCC	2	12	2298473	2298484	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
141	NC_015859	CGCCGG	2	12	2308294	2308305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015859	ACCGGT	2	12	2308376	2308387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015859	CCGACC	2	12	2326979	2326990	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015859	CGCCGT	2	12	2380941	2380952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015859	CCGGCA	2	12	2382293	2382304	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015859	CCTGCT	2	12	2382548	2382559	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015859	GTCACC	2	12	2382639	2382650	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015859	TCGACC	2	12	2405690	2405701	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015859	CCGGTT	2	12	2449193	2449204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015859	CGTAAG	2	12	2449315	2449326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_015859	CTCCCC	2	12	2490568	2490579	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
152	NC_015859	CCCGTC	2	12	2505716	2505727	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_015859	GACACC	2	12	2552298	2552309	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015859	CGGTTC	2	12	2592614	2592625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015859	CCCCCG	2	12	2599703	2599714	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
156	NC_015859	CCGTCG	2	12	2615180	2615191	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
157	NC_015859	ACCGGT	2	12	2633519	2633530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015859	GAGCCG	2	12	2636491	2636502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015859	CGGGGG	2	12	2690870	2690881	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_015859	GCGGTA	2	12	2740121	2740132	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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163	NC_015859	GTCGAA	2	12	2749335	2749346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_015859	TCCCGG	2	12	2752205	2752216	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
165	NC_015859	GCCCCC	2	12	2756881	2756892	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
166	NC_015859	CCGCTG	2	12	2768371	2768382	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.