MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015859	TGTGG	2	10	15022	15031	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015859	GAGAG	2	10	15109	15118	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015859	TGCCG	2	10	20159	20168	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015859	GAACG	2	10	25060	25069	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015859	ACGCC	2	10	27532	27541	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015859	GCGTT	2	10	31422	31431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015859	TAGGG	2	10	31779	31788	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015859	CACCG	2	10	33786	33795	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015859	TGCCT	2	10	41922	41931	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015859	CTGAC	2	10	41989	41998	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015859	TTCTC	2	10	45959	45968	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015859	AAAAG	2	10	64927	64936	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015859	TCGTG	2	10	70650	70659	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015859	CTTGT	2	10	70694	70703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015859	CGTCA	2	10	70986	70995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015859	CGTTG	2	10	71258	71267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015859	GGGAG	2	10	72056	72065	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015859	TGGTG	2	10	72121	72130	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015859	GTTCG	2	10	73778	73787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015859	CCCGG	2	10	75522	75531	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015859	CACCG	2	10	75561	75570	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015859	CCTCT	2	10	77743	77752	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_015859	GGACG	2	10	86275	86284	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015859	ATCTC	2	10	91752	91761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015859	GGGTG	2	10	98217	98226	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015859	CCCAC	2	10	100679	100688	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
27	NC_015859	CAGAT	2	10	100696	100705	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015859	GTGAT	2	10	100977	100986	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015859	TGCGC	2	10	103754	103763	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015859	ACCGG	2	10	110566	110575	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015859	ACGGC	2	10	111287	111296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015859	TGGTG	2	10	127901	127910	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015859	TTCTC	2	10	164479	164488	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015859	TGAAG	2	10	166441	166450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015859	GATGT	2	10	185978	185987	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015859	TCCCC	2	10	200143	200152	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_015859	AATAC	2	10	202137	202146	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015859	CAGGG	2	10	203604	203613	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015859	GGCCC	2	10	205063	205072	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_015859	GCACG	2	10	205845	205854	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015859	GCCTG	2	10	205955	205964	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015859	GGCCG	2	10	207515	207524	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015859	GTCCT	2	10	216896	216905	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015859	CGGTG	2	10	222050	222059	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015859	GTGGG	2	10	229784	229793	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015859	CATAG	2	10	233061	233070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015859	CCCCG	2	10	235995	236004	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_015859	GCTGC	2	10	244799	244808	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015859	CCGGA	2	10	245143	245152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015859	GCGGG	2	10	259001	259010	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015859	GGACA	2	10	274357	274366	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015859	TCCGC	2	10	276812	276821	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_015859	AGTGA	2	10	281959	281968	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015859	CCGTG	2	10	291827	291836	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015859	CCCCG	2	10	301955	301964	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
56	NC_015859	CGCAG	2	10	321314	321323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015859	CGGGC	2	10	327142	327151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015859	GTGAG	2	10	331921	331930	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015859	AAGAG	2	10	332267	332276	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015859	GTGAT	2	10	335035	335044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015859	CTGTG	2	10	347908	347917	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015859	TAGCC	2	10	350901	350910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015859	CCGGC	2	10	351481	351490	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_015859	CCGCG	2	10	351921	351930	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_015859	GGTCA	2	10	358087	358096	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015859	CTGGT	2	10	364056	364065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015859	CCTCA	2	10	370406	370415	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015859	GAACC	2	10	379564	379573	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015859	GCCGG	2	10	392404	392413	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015859	ACCCG	2	10	392703	392712	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_015859	GTCCG	2	10	422661	422670	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015859	GCCAG	2	10	431914	431923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_015859	TCAAG	2	10	434368	434377	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015859	CAGGC	2	10	435249	435258	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015859	CCGGC	2	10	451667	451676	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_015859	CACAT	2	10	451899	451908	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015859	CTAAA	2	10	451988	451997	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015859	CACCG	2	10	462350	462359	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015859	CGGCG	2	10	488746	488755	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015859	CGCGC	2	10	500220	500229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_015859	CTGCC	2	10	502017	502026	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015859	CTGTC	2	10	509022	509031	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015859	CCGGC	2	10	510484	510493	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_015859	GAGGG	2	10	510629	510638	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015859	CACGG	2	10	534784	534793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015859	GGGTG	2	10	534821	534830	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015859	CGGCG	2	10	548516	548525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015859	GGGCC	2	10	555985	555994	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015859	TGAGG	2	10	558003	558012	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015859	CACCC	2	10	571286	571295	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_015859	TCCCG	2	10	576819	576828	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_015859	TCCGG	2	10	577487	577496	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015859	GGACC	2	10	583602	583611	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015859	GGGAC	2	10	583703	583712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015859	CGGAT	2	10	585671	585680	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015859	AAGGA	2	10	597261	597270	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015859	GTCTC	2	10	611984	611993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015859	GTGGG	2	10	612360	612369	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015859	GTGAC	2	10	618070	618079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015859	CACGC	2	10	632701	632710	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_015859	CGACC	2	10	644312	644321	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_015859	ACAGG	2	10	661166	661175	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015859	GATAG	2	10	661565	661574	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015859	ACCGT	2	10	687931	687940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015859	TAGGG	2	10	691440	691449	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015859	TCGTG	2	10	694134	694143	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015859	CTTGT	2	10	694178	694187	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015859	CGTCA	2	10	694470	694479	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015859	CGTTG	2	10	694742	694751	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015859	GGGAG	2	10	695540	695549	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015859	TGGTG	2	10	695605	695614	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015859	GTTCG	2	10	697262	697271	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015859	CTGGC	2	10	710708	710717	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015859	TGCCG	2	10	720365	720374	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015859	GCTCC	2	10	726016	726025	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_015859	TCGAG	2	10	728982	728991	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015859	GGTGA	2	10	742144	742153	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015859	AGGAC	2	10	756847	756856	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015859	ACCAC	2	10	776213	776222	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_015859	CGACG	2	10	780724	780733	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015859	GTCCG	2	10	788234	788243	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015859	GGTCG	2	10	808870	808879	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015859	GGTCG	2	10	812434	812443	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015859	TGGGG	2	10	813382	813391	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015859	GGTAG	2	10	820173	820182	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015859	CCTGA	2	10	822843	822852	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015859	GGGGA	2	10	823991	824000	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015859	GGTGT	2	10	829114	829123	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015859	GACGC	2	10	839711	839720	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015859	CCGTT	2	10	840391	840400	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015859	CCTCA	2	10	847144	847153	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_015859	CGGGG	2	10	869656	869665	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015859	GTCCT	2	10	879205	879214	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015859	CGGGC	2	10	879266	879275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_015859	TGGTG	2	10	884332	884341	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015859	ATCTT	2	10	886603	886612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015859	CTCCA	2	10	904650	904659	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_015859	TGCGG	2	10	904775	904784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015859	GGGTG	2	10	909267	909276	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015859	AAACA	2	10	943701	943710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015859	TCAGC	2	10	956592	956601	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015859	ACCAG	2	10	968491	968500	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_015859	ACCGT	2	10	970484	970493	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015859	ACCGC	2	10	974814	974823	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_015859	CACAC	2	10	976856	976865	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_015859	GGGGA	2	10	976925	976934	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015859	AGTTG	2	10	985541	985550	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015859	CATGG	2	10	985903	985912	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_015859	TGACG	2	10	1003940	1003949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_015859	CCTTA	2	10	1109730	1109739	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_015859	GTTGG	2	10	1115884	1115893	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015859	CGTTG	2	10	1157463	1157472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_015859	CTTGT	2	10	1163496	1163505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_015859	CCGCC	2	10	1245549	1245558	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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192	NC_015859	GCCGG	2	10	1327456	1327465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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195	NC_015859	GGACG	2	10	1338077	1338086	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_015859	CTACT	2	10	1930743	1930752	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_015859	ACCAC	2	10	1979034	1979043	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
263	NC_015859	TCCCC	2	10	1992208	1992217	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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265	NC_015859	TCAGG	2	10	1998352	1998361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_015859	TTCCC	2	10	2182324	2182333	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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284	NC_015859	GGTTC	2	10	2193426	2193435	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_015859	CGTGC	2	10	2232638	2232647	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_015859	CCCAC	2	10	2233729	2233738	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
288	NC_015859	CCGCG	2	10	2246117	2246126	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
289	NC_015859	TCTGT	2	10	2277580	2277589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_015859	GCCGT	2	10	2282599	2282608	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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333	NC_015859	CCTGT	2	10	2675193	2675202	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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401	NC_015859	ACCGC	2	10	3341472	3341481	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
402	NC_015859	CAGCC	2	10	3349386	3349395	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
403	NC_015859	ATCTG	2	10	3358525	3358534	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
404	NC_015859	GGCAG	2	10	3367053	3367062	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
405	NC_015859	CCGGA	2	10	3373547	3373556	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
406	NC_015859	ACCAC	2	10	3375823	3375832	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
407	NC_015859	ACACG	2	10	3380740	3380749	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
408	NC_015859	CGTGT	2	10	3380780	3380789	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
409	NC_015859	ACATC	2	10	3414689	3414698	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
410	NC_015859	CGTTC	2	10	3416804	3416813	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
411	NC_015859	TGAGG	2	10	3419078	3419087	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
412	NC_015859	GCGTC	2	10	3429084	3429093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
413	NC_015859	CGGTG	2	10	3430004	3430013	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.